PCR-based Genotyping等实验,常需纯化样本基因组。当待测样本较多时,纯化基因组的过程费时、操作重复,并且实验成本高。翌圣生物通过改造Taq DNA聚合酶,优化PCR反应体系开发出无需基因组纯化的Direct PCR Kit系列产品。
Clever PCR:Direct PCR
翌圣Direct PCR Kit是直接从样本开始,以未经基因组纯化的微量原始样本(图1-A)或其裂解产物(图1-B)作为模板,进行PCR-based Genotyping(见图1)。与常规PCR-based Genotyping相比,Direct PCR Kit样本用量少,操作简单,实验成本低,可高通量化样本检测。
图1. Direct PCR技术
A. 直接法:取少量样本直接加入到PCR Master Mix中,进行PCR鉴定。
B. 裂解法:样本取样后,加入裂解液中,裂解释放基因组,取少量裂解上清液加入到PCR Master Mix中,进行PCR鉴定。
技术优势
★ 直接:无需进行费时而昂贵的DNA纯化
★ 快速:10min完成模板制备,最少50min完成PCR反应
★ 简便:样品无需剪碎或研磨即可完成裂解;PCR Mix为预混液形式,减少加样步骤
★ 节省:材料用量少
★ 高通量:可在96孔板中完成裂解反应
翌圣生物Direct PCR Kit
产品参数 |
Animal Tissue Direct PCR Kit |
Mouse Tissue Direct PCR Kit |
Plant Tissue Direct PCR kit |
适用生物 |
小鼠、兔子、鸟类、淡水鱼、果蝇、线虫、狗 |
小鼠、大鼠 |
水稻、玉米、烟草、油菜、小麦、大豆等 |
适用组织/材料类型 |
脑、心脏、肝脏、胰脏、肾脏、脾脏、睾丸、肌肉、羽毛末端 |
鼠尾、鼠耳、脚趾(带肌肉)和其他脏器 |
嫩叶、老叶、幼苗、嫩茎 |
样品使用量 |
5-10mg |
组织:5-10mg,鼠尾:1-5mm |
叶片:1-10mm,种子:1-3mm |
基因组释放时间 |
5-30min |
15min |
0-10min |
PCR产物最适长度 |
<1kb |
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PCR产物是否加A |
裂解反应体系加A效率不定 |
||
20µL体系,裂解产物使用量 |
1-4µL |
0.2-2µL |
0.2-1µL |
应用 |
转基因鉴定、基因分型等 |
Direct PCR Kit实验过程
本系列产品运用独特的蛋白酶裂解体系,裂解样品,裂解液可直接作为模板,搭配试剂盒中的PCR Master Mix进行基因扩增。
图2.动物、小鼠组织直扩PCR实验过程
图3.植物组织直扩PCR实验过程
产品优势
改造的Taq DNA Polymerase是Direct PCR的保证:超强的抑制物耐受性
对于非纯化样本作为模板时,会引入很多对PCR反应有抑制的成分。以普通的PCR反应体系和Taq DNA聚合酶较难得到理想的结果,甚至无法进行PCR扩增。本系列试剂盒中PCR Mix为配方优化预混液,采用改造的Taq DNA Polymerase,增加与模板DNA结合能力,对于常见PCR抑制剂具有更高的耐受性,因此具有更广泛的模板适应性。
图4.直扩PCR Kit中的PCR Mix具有更高的杂质耐受度。
相同模板量,用不同的PCR Mix进行PCR,同时在体系中加入不同浓度的各种PCR反应抑制物。比较不同条件下的PCR产物量。
翌圣生物针对不同样本,开发出一系列产品
一、多动物通用型:Animal Tissue Direct PCR Kit
★ 快速:操作时间短
图5.翌圣动物组织直扩PCR试剂盒更加节省时间。
★ 实验例:基因敲除小鼠基因型鉴定
图6.动物组织直扩PCR试剂盒检测基因敲除动物组织直扩结果。
M:100bp DNA ladder。1-8:以裂解产物为模板。+:以50ng纯化基因组DNA为模板。﹣:以去离子水为模板。循环数:35个循环。
单条带(580bp):敲除动物纯合子基因组。单条带(180bp):野生型基因组。两条带(580bp/180bp):敲除动物杂合子基因组。
二、啮齿类专用型:Mouse Tissue Direct PCR Kit
★ 更快速:基因释放充分
图7.小鼠组织直扩PCR试剂盒不同裂解时间直扩结果。M:100bp DNA ladder。+:以50 ng纯化基因组DNA为模板。循环数:35个循环。
★ 更彻底:基因释放充分
1、优于常规碱裂解方法
图8.鼠尾经不同裂解方式处理后的直扩结果。
检测基因:SOX21。M:100 bp DNA ladder。1-2:以常规碱裂解方式处理裂解产物为模板。
3-4:以小鼠组织直扩PCR试剂盒裂解产物为模板。+:以50 ng纯化基因组DNA为模板。﹣:以去离子水为模板。循环数:35个循环。
2、媲美同类产品
图9.鼠尾经不同品牌同类产品裂解处理后的直扩结果。
检测基因:SOX21。M :100 bp DNA ladder。+ :以50 ng纯化基因组DNA为模板。循环数:35个循环。
三、植物类专用型:Plant Tissue Direct PCR Kit
多类型植物样本验证
图10.不同类型植物叶片直扩结果。
M:100 bp DNA ladder。C:相应植物纯化基因组DNA为模板。1-2:叶片组织裂解产物为模板。循环数:30个循环。
客户案例
★ 小鼠基因型鉴定
图11. 北京基石生命科技有限公司用户使用鼠尾直扩PCR试剂盒进行小鼠基因型鉴定结果
★ 水稻基因直扩
图12. 华中农业大学用户使用植物直扩PCR试剂盒扩增水稻相关基因
订购信息
产品名称 |
产品货号 |
规格 |
10184ES50/70 |
50T/200 T |
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10185ES50/70 |
50T/200 T |
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10187ES50/70 |
50T/200 T |
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19698ES50/70 |
50T/200 T |
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10170ES50/70 |
50T/200 T |