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熔解曲线分析全攻略:如何识别非特异产物与引物二聚体

20

2026-07-02

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做染料法的qpcr,不要只看扩增曲线,更要看熔解曲线,熔解曲线单峰说明特异性良好,扩增结果可信。但是如果熔解曲线不是单峰,有多峰,说明可能形成了引物二聚体或者是非特异产物,也可能是试剂或者环境的污染造成的。那如何快速分辨到底属于哪种情况呢?今天教会大家一招非常使用的技巧,利用NTC反应,即可快速找到问题根源!

 

具体操作步骤:

样品反应孔:加入模板,引物,qPCR mix

NTC反应孔:加入水,引物,qPCR mix

一起上机反应,查看各自熔解曲线,根据熔曲结果可对应以下三种情况

 

情况一:引物二聚体

 

样品反应孔

NTC反应孔

熔解曲线

 

 

分析说明

NTC反应孔起峰,样品反应孔扩增双峰。
双峰可能由于引物二聚体造成。可通过降低引物浓度、提高退火温度、提高模板浓度等方法改善,必要时重新设计引物。

 

情况二:非特性扩增

 

样品反应孔

NTC反应孔

熔解曲线

 

 

分析说明

样品反应孔扩增存在双峰,NTC反应孔无扩增。
引物对于靶序列的扩增特异性不强,可扩增出目的片段以外的片段。

 

情况三:试剂及环境污染

 

样品反应孔

NTC反应孔

熔解曲线

 

 

分析说明

样品反应孔与NTC反应孔的熔解曲线相似(可能是单峰、也可能是双峰或乱峰)。
反应体系可能存在污染,建议选用带UNG的防污染型试剂。

对于双峰,较多情况出现的都是引物二聚体,因此使用一款特异性好的qPCR mix就特别重要,从源头在一定程度上避免了这种困扰。

 

11185  Hieff UNICON® Advanced qPCR SYBR Master Mix

产品特色

· 特异性高:抗体法热启动&Buffer优化,最大程度减少二聚体生成

· 灵敏度高:可有效检测低拷贝数模板

· 高荧光值:荧光信号值更高,曲线线型更好,信噪比更高

· 精密度好:可精准区分2倍模板差异,复孔间差距小

· 多平台适用:适用于多种qPCR仪器,无需调整ROX浓度

  

· 特异性高

 

图.以人源cDNA为模板,扩增56组不同GC含量的基因片段(部分曲线如上方展示),结果显示,11185ES的特异性优于其他品牌,数据统计显示11185ES在这些样本中非特异性概率约为5.4%,其他品牌在同种样本中的非特异性概率约为53.6%。

  

 

· 灵敏度高

 

图.分别在不同类型仪器上以101-107拷贝的IL23R质粒为模板,扩增IL23R基因。结果显示在不同浓度模板下,11185ES的灵敏度更加优秀,Ct值更小,同时荧光平台期更高,曲线线型更好,信噪比更高。

· 精准区分2倍模板差异

 

图.分别以稀释10倍、20倍、40倍、80倍、160倍、320倍、640倍的人源cDNA为模板,扩增人GAPDH基因。测试结果显示11185ES能有效区分2倍模板浓度差异。

 

 

 

*备注:模板浓度差5倍,Ct值则相差2.322,22.322=5

图.分别以人源cDNA原液稀释了20倍、100倍和200倍的cDNA为模板,扩增60%GC含量的基因片段。数据显示11185ES针对不同浓度模板的分辨率优于其他品牌,且荧光值更高,曲线线型更好,信噪比更高。

 

 

 

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