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基于MGISP-960自动化平台的人血液gDNA样本重测序文库构建方法

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2026-08-04

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全基因组重测序是挖掘基因组变异、开展遗传研究的核心技术,传统血液gDNA文库构建多依赖人工操作,存在通量低、重复性差、人为误差大等问题,难以满足大批量样本测序需求。本文基于MGISP-960高通量自动化样本制备平台,优化建立血液gDNA重测序文库构建方法。该方法实现建库全流程自动化操作,有效规避人工操作偏差,提升文库构建效率与均一性,流程稳定可控,可适配大批量血液样本的标准化重测序建库需求,为高通量基因组测序研究提供可靠技术支撑。

目的:建立适用于人血液gDNA样本的重测序自动化建库流程

平台:MGISP-960(华大智造)

样本类型:人血液gDNA

下游应用:肿瘤易感基因筛查、遗传病诊断、药物基因组学

建库试剂盒:Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V4 一步法DNA酶切建库试剂盒V4

货号:12972ES

文库类型:华大

 

自动化简版流程

流程分类

流程(其他设置默认按12972说明书内容执行,说明书可依据货号在官网搜索下载)

1 DNA片段化/末端修复/dA尾添加

① 加入样本,样本投入量:100ng (人工);

② 进行片段化,片段程序选择35℃-15min。

2 接头连接

提前将接头从10uM稀释到5uM(人工),加入片段化产物和连接试剂,进行连接程序孵育。

3 连接产物纯化和分选

① 对连接产物进行纯化,磁珠比例为0.8×;

② 对纯化产物进行片段分选,分选1磁珠比例:0.68×,分选2磁珠比例:0.20x。

4 文库扩增

将分选产物和扩增试剂混匀,进行扩增程序富余,扩增循环数选择6。

5 扩增产物纯化

对扩增产物进行纯化,磁珠比例为0.9×。

6 建库结束

建库结束,弹窗提醒人工取走文库。

案例结果展示(抽检,检测仪器:Qubit 4.0)

序号

样本

Qubit浓度(ng/μL)

文库体积(μL)

产量(ng)

1

人血液gDNA-A

39

28

1092

2

人血液gDNA-B

42.6

28

1192.8

3

人血液gDNA-C

45

28

1260

4

人血液gDNA-D

39.6

28

1108.8

5

人血液gDNA-E

35.8

28

1002.4

6

人血液gDNA-F

29.2

28

817.6

 

片段大小图(检测方法:琼脂糖凝胶电泳)

                                                                                                                                                                  

结论:文库浓度均在29-45ng/uL之间,片段大小在350bp左右,满足后续上机测序需求。

 

相关核心产品目录

应用

产品货号

产品名称

RNA建库

12972ES

Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V4 一步法DNA酶切建库试剂盒V4

接头

13350ES

Hieff NGS® Unique Dual Barcode Primer Kit for MGI®, Set1(板式MGI平台接头,双端唯一短接头,Set1)

纯化磁珠

12601ES

Hieff NGS® DNA selection Beads (Superior Ampure XP alternative)DNA纯化分选磁珠

自动化耗材

83560ES

0.2 mL 96孔PCR板,白色,全裙边(NGS,伯乐款)

83672ES

96孔深孔板,U底(1.3 mL)

83130ES

250 μL盒装滤芯透明无菌吸头

83624ES

荧光定量QPCR压敏封板膜,内附刮板

文库浓度测定

12642ES

1× dsDNA HS Assay Kit 即用型dsDNA qubit定量试剂

83509ES

Qubit专用检测管

80571ES

核酸定量仪荧光计Qubit(单通道)

文库条带大小检测

10516ES

GoldBand 100 bp plus DNA Ladder

10202ES

YeaRed Nucleic Acid Gel Stain (10,000× in Water) YeaRed 核酸染料(10,000× 水溶液)

10208ES

Agarose琼脂糖

60161ES

1x TAE Buffer,TAE 缓冲液(粉末),PH 8.0,1L

 

 

磁珠偶联转座酶法建库原理
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