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MGISP-960在根际微生物中的应用:根际微生物的自动化文库构建流程

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2026-08-04

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1. 目的:建立适用于植物根际土的微生物的宏基因组自动化建库流程

2. 平台:MGISP-960(华大智造)

3. 样本类型:植物根际土提取的DNA                          

4. 下游应用:群落结构与多样性解析、功能潜力与代谢通路、基因组解析与未培养微生物、多组学整合、根际工程与农业转化、环境响应与生态研究等

5. 建库试剂盒:Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V4 货号:12972ES

6. 文库类型:Illumina

7. 自动化耗材和数量:96深孔板8个、PCR板6个、滤芯吸头7盒

8. 实验条件:

样本投入量

10 ng

25 ng

酶切片段化/末端修复/加A

12972-A

10 μL

12972-B

10 μL

DNA

40 μL,Up to 60 μL

程序

4℃-1 min;30 ℃(12-15 min);72 ℃-20 min;4℃ hold

接头连接

12972-C

30 μL

12972-D

10 μL

PE Adapter

2 μM,5 μL

Total

 110 μL

连接程序

20℃ 15 min,4℃ hold

连接产物纯化/分选

0.6×磁珠(66 μL)纯化,104 μL洗脱,取100 μL分选,分选比例0.60×/0.15×;22 μL洗脱,取20 μL扩增。

PCR扩增

12972-E

25 μL

Index Primer

5 μL

循环数

11 cc

扩增后纯化

0.8×磁珠(40 μL)纯化,终文库32 μL洗脱,取30 μL上清

质控结果

文库产量

1053 ng

2620 ng

文库峰图

 

 

 

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