样本即用型试剂盒：含ATAC-seq实验中除样本以外的所有试剂，无需额外其他组分（注：因index种类较多，index需额外配备，index货号17265ES，该货号最多有384种搭配组合）。

组织样本需搭配12514/12516ES进行细胞核提取（组织细胞核提取试剂盒）。

植物样本需自行处理成细胞核样本后再搭配12208使用。

Hieff NGS® ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina®是针对Illumina®高通量测序平台研发的用于ATAC-Seq实验的文库构建试剂盒，适用于100-100,000个细胞起始量的样本建库。ATAC-Seq(Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing)技术能够利用Tn5 转座酶识别染色质开放区域，快速有效的反映表观遗传状态。经过细胞收集及裂解、转座酶片段化、磁珠回收片段化DNA、文库扩增和磁珠分选等步骤，DNA片段最终转化为适用于Illumina®平台测序的文库。

本试剂盒包含两个独立模块：BOX-I和BOX-II。BOX-I为提取DNA的DNA Extract Beads和回收文库的DNA Clean Beads，BOX-II包含细胞裂解、片段化以及后续文库扩增所需的所有试剂。此外，本试剂盒已在不同种类样本(如K562、MCF-7细胞，小鼠肝脏等)中进行了验证，均具有良好的建库效率和建库产量。本试剂盒提供的所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证，最大程度上保证了文库的稳定性和重复性。

●含两种纯化磁珠：针对小片段纯化，回收效果更好。

●实验操作简单、实验周期短：建库一步法，节省建库时间；

●样本投入量低，投入量兼容范围广：能兼容100~10万个细胞投入。

●实验重复性好

产品应用：ATAC-seq、染色质开放性研究、转录因子鉴定、足迹分析等

1、不同细胞投入量的ATAC建库结果一致性较高

293细胞ATAC建库，细胞投入量从100个到10万个，不同细胞投入量建库后，文库峰型以及IGV可视化结果一致性较高。

2、冻存样本ATAC建库结果展示

对不同冻存时间的样本进行ATAC建库，目前测试冻存20天内的样本建库无问题，且测序结果信号明显。

冻存样本要求：尽量客户样本保存在液氮中，如果保存-80℃冰箱，需要无反复冻融情况。

BOX-I：2~8℃保存。

BOX-II：-25~-15℃保存。

Q：投入多少细胞量合适？

A：兼容100-100000个细胞或细胞核，最佳投入量为5w个细胞或细胞核。

Q：ATAC文库产量低的原因？

A：1. 细胞核投入量少或实验过程中细胞核部分丢失。细胞核离心后弃去上清液时容易造成丢失，在离心时，统一EP管方向并标记细胞沉积位置，弃上清时避免碰到沉淀，在实验操作过程中避免剧烈涡旋振荡；2. 转座酶切割不充分，这种原因有很多，首选需要确认细胞核的纯度，如果杂质较多，可能影响转座酶的效果，提取细胞核时尽量多清洗几遍，以获得纯净的细胞核。

Q：TSS富集程度不好是什么原因？如何增加？

A：TSS富集效果不好通常是由于实验样本细胞活性不好或游离DNA较多。可对细胞或细胞核进行镜检确认细胞或细胞核完整性。

2、ATAC文库中的线粒体reads较多，如何减少？

A：通常是由于细胞核提取过程中，细胞漂洗时未能吸出所有的上清液(其中包含mtDNA)。应吸尽上清，同时注意不要影响到细胞核完整性。或者可以多清洗几遍，提升细胞核的纯度。