Hieff NGS® In-Situ DNA Binding Profiling Library Prep Kit for Illumina® V2
CUT&Tag试剂盒(pA/G-Tn5版)
样本即用型试剂盒:含CUT&Tag实验中除样本和一抗和蛋白酶抑制剂以外的所有试剂,无需额外其他组分
产品应用
蛋白质-DNA互作研究:组蛋白修饰调控、转录因子调控等表观作用机制研究
产品优势
●含两种纯化磁珠:针对小片段纯化,回收效果更好。
●实验操作简单、实验周期短:建库一步法,节省建库时间;ConA使用,无需离心转管;无需超声片段化;样本投入量低。
●实验重复性好
产品描述
Hieff NGS® In-Situ DNA Binding Profiling Library Prep Kit for Illumina® V2 是针对Illumina®高通量测序平台研发的用于CUT&Tag实验的文库构建试剂盒,适用于100-100,000个细胞起始量的样本建库。CUT&Tag是研究蛋白与DNA互作的技术,相较于传统的ChIP-seq、CUT&RUN,该技术具有文库构建时长更短(仅需7小时)、操作更简单、对起始样本要求更低、抗体投入量更少、文库产量更高等优点。经过细胞捕获、一抗孵育、二抗孵育、转座酶孵育、转座酶激活、掺入DNA标准品、细胞裂解、磁珠回收gDNA、文库扩增和磁珠分选等步骤,靶蛋白结合的DNA片段最终转化为适用于Illumina®平台测序的文库。
本试剂盒包含两个独立模块:BOX-I和BOX-II。BOX-I包含结合细胞的ConA Beads、提取DNA 的DNA Extract Beads以及文库纯化的DNA Selection Beads,BOX-II包含细胞透化剂、抗体结合buffer、转座酶结合buffer、蛋白酶K以及后续文库扩增所需的所有试剂。此外,本试剂盒已在不同种类细胞(如293T、K562、CHO、ESC细胞等)中进行了验证,均具有良好的建库效率和建库产量。本试剂盒提供的所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,最大程度上保证了文库的稳定性和重复性。
实验数据
图 Qsep对不同细胞投入量文库质量分析:不同样本投入,CUT&Tag实验都能得到一致的结果
图:spike in 让数据分析结果更真实:Spike in校正后,不同投入量的样本,基因富集倍率更真实、更准确。
组分信息
组分编号 |
组分名称 |
12597ES04 |
12597ES12 |
12597ES48 |
||
BOX-I |
12597-A |
⇔ |
ConA Beads |
40 μL |
120 μL |
480 μL |
12597-B |
⇔ |
DNA Extract Beads |
280 μL |
840 μL |
3.36 mL |
|
12597-C |
⇔ |
DNA Selection Beads |
400 μL |
1.2 mL |
4.8 mL |
|
BOX-II |
12597-D |
⇔ |
10 × Binding Buffer |
120 μL |
360 μL |
1.44 mL |
12597-E |
⇔ |
10 × Wash Buffer |
600 μL |
1.8 mL |
7.2 mL |
|
12597-F |
⇔ |
5% Digitonin |
45 μL |
135 μL |
540 μL |
|
12597-G |
⇔ |
50 × PB Buffer |
6 μL |
18 μL |
72 μL |
|
12597-H |
⇔ |
10 × Dig-300 Buffer |
400 μL |
1.2 mL |
4.8 mL |
|
12597-I |
⇔ |
pA/G-Transposome Mix |
8 μL |
24 μL |
96 μL |
|
12597-J |
⇔ |
33× Activating Buffer |
6 μL |
18 μL |
72 μL |
|
12597-K |
⇔ |
15 × Terminate Solution |
20 μL |
60 μL |
240 μL |
|
12597-L |
⇔ |
30 × Proteinase K |
10 μL |
30 μL |
120 μL |
|
12597-M |
⇔ |
DNA Spike-in Mix (5 ng/μL) |
4 μL |
12 μL |
48 μL |
|
12597-N |
⇔ |
2×HiFi Amplification Mix |
100 μL |
300 μL |
1.2 mL |
|
12597-O |
⇔ |
Goat Anti-Rabbit lgG(H+L)* |
2 μL |
6 μL |
24 μL |
|
12597-P |
⇔ |
N5 (N501)** |
4 μL |
/ |
/ |
|
12597-Q |
⇔ |
N7 (N701)** |
4 μL |
/ |
/ |
注意:*本试剂盒中包含的二抗为山羊抗兔二抗,适用于使用一抗来源于兔源的研究,若需要一抗来源于鼠源的研究,需客户自行准备抗鼠二抗(Yeasen cat#34851ES)或其他等效产品。
**测序时 Index 序列 填写时,测序平台为NovaSeq 6000 v1.0 reagents, MiSeq, HiSeq 2000/2500,则N501-CTCTCTAT,N701-TAAGGCGA。测序平台为NovaSeq 6000 v1.5 reagents,MiniSeq, NextSeq,HiSeq 3000/4000,则N501-ATAGAGAG,N701-TAAGGCGA。
***本试剂盒在实验前需自备蛋白酶抑制剂Cocktail(Yeasen Cat#20123ES)或其他等效产品。
存储条件
BOX-I:2-8℃保存,BOX-II:-25~-15℃保存,有效期1年。