分子生物学
IVD分子诊断
细胞培养与分析
蛋白研究
细胞因子
重组蛋白
抗体
高通量测序建库
病原检测UCF系列
生物医药
工具酶
抑制剂激活剂与常用试剂
仪器
耗材
Hieff® HC Fast Tagmentase
产品详情
FAQ
产品文档
已发表文献
产品介绍

Hieff® HC Fast Tagmentase(10 U/μL,2.2 μg/μL)是野生型Tn5转座酶的突变形式,可识别 Tn5 转座子酶序列的内端(inside end, IE)、外端(outsideend, OE)和嵌合端(mosaic end, ME)序列,含有ME序列片段的转座效率最高。

该产品为高浓度的Tn5裸酶,进行接头包埋后,可高效、随机的将Tn5 转座子插入到目标序列,被广泛应用于体外转基因和二代测序建库等领域。

产品特色
  • 高酶活浓度。
  • 野生型Tn5酶。
  • 可兼容不同的包埋序列。
  • 应用方向:DNA建库、ATAC建库、细菌突变体库、甲基化、单细胞基因组、三代基因组等方法。
应用案例

转座酶应用,有针对测序和微生物突变体文库构建

方案一:以高通量测序建库为例,在使用前,请务必仔细阅读使用说明。

1. 接头制备

1)Illumina平台参考引物名称及序列:

Primer A:5'-phos-CTGTCTCTTATACACATCT-NH2-3'

Primer B:5′-TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAG-3′

Primer C:5′-GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAG-3′

2)使用Annealing Buffer溶解Primer A、Primer B、Primer C至100 μM。

3)分别配制如下反应体系:

组分反应1
Primer A(100 μM)10 μL
Primer B(100 μM)10 μL
total20 μL

组分反应2
Primer A(100 μM)10 μL
Primer C(100 μM)10 μL
total20 μL

4)分别将反应1和反应2涡旋振荡充分混匀,并短暂离心使溶液回到管底。置于PCR仪内,进行如下反应程序:热盖105℃ On,94℃加热2 min。时间到后,立即停止反应程序(一定不要超过反应时间,最好设置一个计时器提醒),不要打开PCR仪盖子,直接让反应管在PCR仪器中自然冷却2 hour,然后再于4℃或冰上冷却5 min。

或者设置PCR程序:热盖105℃ On;72℃ 15 min;60℃ 10 min;50℃ 10 min;40℃ 10 min;25℃ 30 min。

5)反应结束后,将反应1和反应2等体积混合,混匀。命名为Adapter Mix,-25~-15℃保存。

2.转座子生成

1) 配置以下反应体系:

组分体积(μL)
HC Fast Tagmentase(10 U/μL,2.2 μg/μL)10
Adapter mix (25 μM)*8
Assemble BufferUp to 200

*Adapter mix根据实验目的以及测序平台,自备。

2)反应条件:使用移液器轻轻吹打充分混匀。置于25℃反应1 h(热盖关闭)。反应产物命名为Tn5 Mix,可直接应用于建库实验,或-25~-15℃保存。

3.DNA片段化测试

1)配置以下反应体系:

组分体积(μL)
Input DNA (50 ng/μL)1*
5 × Reaction buffer4
Tn5 Mix2**
ddH2OUp to 20

*DNA 使用量越大,片段化产物平均长度越长;反之,片段化产物平均长度越短。

**如需提高打断程度,可提高Tn5 Mix使用量;反之,可减少酶使用量。

2)片段化反应程序

轻轻吹打或振荡混匀,短暂离心。按照下表所示反应程序,进行片段化反应。

温度时间
热盖105℃On
55°C10 min
4°CHold

3)DNA片段化终止

配置以下反应体系,在上述片段化产物中添加下表中各反应组分,使用移液器轻轻吹打20次混匀。

组分体积(μL)
片段化产物20
6×Terminate Solution4
Total24

按照下表所示反应程序,进行终止反应。

温度时间
热盖105℃On
55°C10 min
4°CHold

待样品温度降到4°C后,取出PCR管,进行片段化产物纯化,可以选择1.2×磁珠纯化,推荐使用Hieff NGS® DNA Selection Beads(Cat#12601ES),最终使用21 μL ddH2O洗脱片段化产物。

4)质量控制

a. 使用 Qubit 进行浓度测定。

b. 使用 Agilent Technologies 2100 Bioanalyzer 进行长度分布检测。

5)片段化产物扩增

可根据具体的实验目的与测序平台选择合适的试剂进行扩增实验。

方案二:微生物突变体文库构建

步骤1:转座子准备:

a. Tn5转座子的设计。Tn5转座子是两侧带有19bp ME序列的DNA片段,可以使用含有ME序列的上下游引物进行PCR合成。为了获得最佳的转座效率,在两端的PCR引物中需要添加一个5'磷酸基团。
典型的Tn5转座子参考图1。
ME序列:5'-[phos]CTGTCTCTTATACACATCT-3'

得到的转座子的正义链序列:
5'-CTGTCTCTTATACACATCT+目的基因(抗性标记)+AGATGTGTATAAGAGACAG-3'

图1:Tn5转座子示意图。Tn5转座子其两端为19bp ME序列,ME序列可被Tn5转座酶特异性识别。

b. 按照下表依次加入相应试剂,制备Tn5转座体复合物。

成分用量
Tn5 Transposon DNA(100 μg/mL in TE Buffer,步骤2a)2 μL
Tn5转座酶(40 μM)4 μL
Glycerol(100%,714419ES)2 μL
总反应体积8 μL

· 本反应无须Mg2+催化,请勿使用5×Reaction Buffer。

· 参考a中Tn5的转座子设计,Tn5 Transposon DNA为含选择标记(如抗性标记)、成对识别序列(如ME序列)和目标基因的双链DNA,可通过PCR等方法获得。

· 本反应体系可根据实际需要进行放大或缩小。

c. 混匀后室温孵育0.5~1 hour。

d. 取1 μL的转座体复合物电击转化到感受态细胞中,在体内进行插入,并根据抗性标记筛选阳性菌株。推荐的电击转化条件:50 μL感受态细胞,1 μL转座体复合物,2毫米电击杯,2500 V,电击时间5毫秒。转化条件可根据该条件的转化效果进行优化。转座的克隆数主要取决于所转化的宿主细胞、内源性的限制修饰系统及感受态细胞的转化效率。

e. 构建好的转座体复合物-20℃可以保存1年。

2 关于体外转座的补充说明(特别适用于DNA转化法)

对于某些转化效率较低的细菌(如嗜热菌Thermus thermophilus),可考虑以下变通方法:

将Tn5转座体与1 μg目标细菌的基因组DNA混合孵育后,用DNA聚合酶补齐转座后产生的单链缺口(该步骤对某些细菌至关重要)。之后将处理后的DNA直接转化(如自然感受态菌株)或电转至目标细菌。


存储条件

组分A(HC Fast Tagmentase)于-85~-65℃ 保存,接收货物后应在一个月内完成接头组装,装配产物-15~-25°C保存;

其余组分-15~-25°C保存。

COA
联系我们
购物车
客服
转染试用