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高产量T7 RNA转录试剂盒助力多种长度RNA高效合成

高产量RNA转录试剂盒介绍

T7 High Yield RNA Synthesis Kit 进行了转录反应体系的优化,试剂盒使用 T7 RNA 聚合酶并以含有 T7 启动子序列的线型双链 DNA 为模板,以 NTPs 为底物,对启动子下游的 DNA 序列进行转录,高效合成单链 RNA。转录时可在底物中加入修饰的核苷酸,制备生物素或染料标记的 RNA。

本试剂盒可以合成长转录本以及短转录本,以 1 μg 的模板投入量可以产生 100-200 μg 的 RNA,转录合成的 RNA 可用于诸如 RNA 结构与功能研究、RNA 酶保护、探针杂交、RNAi、显微注射及体外翻译等多方面的下游应用。

 

体外转录原理

 

 

 

Figure 1: RNA体外转录过程

 

产品优势

 

极高的产量—2小时内产量可以达到200 µg

通用适用于20nt-10000nt RNA的转录

高的性能—降低IVT过程中的副产物

多种应用可用于普通、标记、修饰的RNA合成

 

产品性能

 

Figure 2 体外转录产量对比

 

Figure 3 不同长度转录产物的质量

 

 

Figure 4转录的mRNAHEK-293细胞中的表达量

: mRNA已经用Vaccinia Capping Enzyme(Yeasen#10614/10615)进行了加帽

 

使用说明

 

A. 试剂解冻

 T7 RNA Polymerase Mix 短暂离心置于冰上。解冻 10×Transcription Buffer 和核糖核苷酸(ATP、CTP、GTP、UTP)混匀并离心至管底,10×Transcription Buffer 置于室温,4 种核糖核苷酸置于冰上备用。

 

B. 室温装配转录反应

按下列体系配制反应体系

组分

体积(μL

终浓度

RNase free H2O

Up to 20

-

10×Transcription Buffer

2

CTP / GTP/ ATP/ UTP (100 mM each)

2 each

10 mM each

Template DNA

1 µg

-

T7 RNA Polymerase Mix

2

-

1. 反应于室温配置。由于10×Transcription Buffer中含有亚精胺,低温下亚精胺浓度过高会引起 DNA 模板沉淀。

2. 短转录本(<100 nt),模板可使用 2 ug,转录时间增至 4-8 个小时

3. 长转录本(>1000 nt),建议使用质粒线性化模板进行转录。

4. 建议在 PCR 仪中进行反应,热盖打开,防止长时间导致反应液蒸发。

5. 反应产物可能有白色沉淀。这是反应过程中游离的焦磷酸与反应液中的镁离子形成焦磷酸镁,不影响后续实验。如 想去除,添加 EDTA 即可消失。添加 EDTA 如果影响后续实验,也可以离心回收上清。

6. 使用试剂、容器等无 RNase 污染。

 

C. 37℃孵育 2 个小时

将上述反应液混合均匀,短暂离心至管底,37℃孵育 2 个小时。若转录本长度小于 100 nt,增加反应时间至 4-8 个小时。 

D. DNase I处理(可选)

反应完成后,每管加入 2 μL DNaseⅠ(RNase free),37℃孵育 15 min 以去除模板 DNA

 

FAQs

1. 转录产物产量低

模板的质量与产量密切相关,实验组产量明显低于对照组可能原因有

①实验模板中有抑制反应成分;

②实验模板本身原因。

建议:

①重新纯化模板;

②确定模板定量以及其完整性;

③延长反应时间;

④加大模板投入量;

⑤尝试其它的启动子和 RNA 聚合酶。

 

2. 短转录本产量低

转录起始片段短会抑制反应,转录产物小于 100nt 时,延长反应时间至 4-8 小时或增加模板量至 2ug 可以提高 RNA 产量。

 

3. RNA 转录长度大于预期

如果电泳显示产物条带大于预期大小,可能原因:

①质粒模板可能没有完全线性化;

②有义链 3’端为突出结构

③RNA存在未完全变性的二级结构。

建议:

①检查模板是否完全线性化,如有必要,额外进行线性化;

②选择合适的限制性酶,避免产生3’突出端,或者用 Klenow Fragment 或 T4 DNA 聚合酶补齐后,再进行转录;

③使用变性胶检测RNA产物。

 

4. RNA 转录长度小于预期

如果电泳显示产物条带小于预期大小,可能原因:

①模板包含类似于 T7 RNA 聚合酶的终止序列;

②模板中GC含量高。

建议:

①降低反应温度(比如,30℃),有时降低温度可以增加转录长度,但会降低产量。或者尝试不同的 RNA 聚合酶进行转录;

②若模板 GC 含量高,采用 42℃进行转录反应,或者添加 SSB 提高产量及转录长度。

 

 

5. 转录产物电泳拖尾

电泳过程中有拖尾现象,可能原因:

①实验操作过程被 RNase 污染;

②DNA 模板被 RNase 污染。

建议:

①实验过程中使用 RNase-free 的枪头和EP管,佩戴一次性乳胶手套和口罩,所有试剂均用 RNase free H2O配制。

重新纯化模板DNA

 

订购信息

 

产品名称

货号

规格

T7 High Yield RNA Synthesis Kit

10623ES

50/100/500 T

mRNA Vaccinia Capping Enzyme GMP-grade

10614ES

2KU/10KU/100KU

mRNA Cap 2'-O-Methyltransferase GMP-grade

10612ES

10KU/50KU/250KU

Deoxyribonuclease I (DNase I) GMP-grade

10611ES

500/2000/10000 U

Hieff NGS® RNA Cleaner

12602ES

1/5/60/450 mL

Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit mRNA纯化试剂盒

12603ES

24/96 T

 

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