一文了解菌群移植技术临床应用及规范,翌圣NGS 解决方案助力菌群检测
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2026-07-19
菌群移植技术发展
人体肠道栖息着数以万亿计的微生物,构成复杂且动态平衡的肠道微生态系统,深度参与人体消化代谢、免疫调控、神经调节等核心生理过程。当肠道菌群结构失衡、功能紊乱时,不仅会引发各类消化系统疾病,还会通过“肠-脑轴”“肠-代谢轴”“肠-免疫轴”诱发神经系统、精神系统、代谢及肿瘤相关疾病,成为多种慢性疾病、疑难疾病的核心诱因。
粪便菌群移植(Fecal Microbiota Transplantation,FMT)是目前重塑肠道微生态、纠正菌群紊乱的核心临床技术,通过将健康供体粪便中的功能性菌群精准移植至患者肠道,替代紊乱菌群、重建肠道微生态平衡,从而实现肠道及肠外相关性疾病的靶向治疗。相较于益生菌、益生元等传统微生态干预手段,FMT可实现菌群整体重构,疗效更持久、适用场景更广泛。
菌群移植技术应用场景
依据2021版上海FMT技术管理规范,当前菌群移植技术的应用分为合规临床治疗与临床研究两大维度,覆盖消化、神经、精神、代谢、肿瘤五大疾病领域,实现从单一肠道疾病到全身性菌群相关性疾病的突破。
(一)合规临床治疗场景
复发性、难治性艰难梭状芽孢杆菌感染(CDI)是目前唯一可常规开展FMT临床治疗的适应症。传统抗生素治疗CDI易出现耐药、病情反复问题,而FMT可快速清除耐药致病菌,重建肠道优势菌群,临床治愈率显著优于传统方案,是国内外指南推荐的核心治疗手段。
(二)临床研究应用场景
1.FMT适用于治疗以下消化系统疾病
(1)艰难梭状芽胞杆菌感染:复发性/难治性艰难梭状芽胞杆菌感染。
(2)其他消化系统疾病:溃疡性结肠炎、克罗恩病、功能性便秘、肠易激综合征、菌群紊乱相关腹泻等。
2.应用FMT治疗治疗肠道菌群紊乱所致的消化系统外疾病
(1)神经系统疾病:帕金森病、阿尔兹海默症、癫痫等。
(2)精神系统:自闭症、情绪障碍、多动症、抽动症等。
(3)代谢相关疾病:代谢综合征、糖尿病等。
(4)肿瘤相关疾病:免疫治疗及放化疗所致肠炎等。
FMT供体核心准入要求(合规标准)
1、基础生理与体格标准
成年供体年龄需控制在18-30周岁,儿童专属FMT供体可放宽至15-30周岁;体重指数维持在18.5-23.9kg/m²,体态健康、无肥胖或营养不良问题。同时血常规、肝肾功能、电解质、C反应蛋白等生化指标全部正常,排除全身性炎症、脏器功能异常问题。
2、病原学筛查标准
供体血液、粪便样本需完成全覆盖病原筛查,杜绝各类传染病、致病菌、寄生虫及病毒感染。血液层面需排除肝炎病毒、HIV、梅毒、EB病毒、巨细胞病毒、新冠病毒等病原体;粪便层面需筛查艰难梭菌、沙门菌、志贺菌、耐药大肠杆菌、寄生虫、诺如病毒、轮状病毒等全部致病菌与病毒,同时多重耐药基因检测结果必须为阴性,从源头杜绝移植后感染、耐药菌传播风险。
3、心理与健康病史标准
供体需经专业心理医师访谈评估,且抑郁、焦虑、睡眠质量等量表评分正常,心理状态稳定。
4、菌群稳定性与捐赠持续性标准
合格供体需保证菌群结构稳定,每2个月完成一次全项目复检,每次捐赠粪便均需留样进行菌群测序与代谢组学检测,确保菌群组成、多样性无显著波动。同时需持续捐赠不少于6个月,每周至少捐赠2次、单次粪便重量不低于100g,保障菌液制备的稳定性与连续性。
5、特殊适配与遗传筛查标准
针对存在食物过敏、不耐受的受体,供体需提前5天完成针对性限食,无法耐受限食要求者不得参与捐赠。同时需通过基因检测剔除单基因隐性遗传致病基因阳性供体,杜绝遗传性疾病传播风险。
菌液制作SOP流程
(1)粪便采集:应采用无菌容器采集,粪便重量不少于100g,性状为Bristol评分标准中3-5分方为合格,立即进入菌液制作流程,或立即密封后2-8℃保存。
(2)制作流程:每次需取不少于50g粪便与无菌生理盐水以1∶3比例混合,充分搅拌混匀后过滤,从粪便排出体外至菌液制作完成应保证在2小时以内,整个处理过程应在无菌环境下操作。为了避免感染窗口期的问题,菌液或胶囊制备后应待21 天后经过病毒细菌等检验合格后出库,每批产品留样至少6个月以供追溯。
(3)冻存与复融:菌液制备完成后置于-80℃保存,6个月之内使用不影响疗效;如置于-20℃保存,应在1-4周内使用。使用前置于室温复融,6小时内输注;如使用水浴锅复融,则水温不得超过37℃。
(4)质控标准:每次制作完成的菌液应随机抽样,行致病菌监测、细胞计数及宏基因或16s rDNA菌群测序,菌液中艰难梭菌、弯曲菌、沙门菌、志贺菌、产志贺毒素大肠杆菌及虫卵、囊泡、寄生虫、孢子、诺如病毒、轮状病毒和COVID-19等病原学检测阴性,多重耐药基因(超广谱β内酰胺酶、碳青霉烯酶等)检测阴性,每50mL菌液中活细胞数应不小于2.5×1012个,同供体同批次样本应达到菌群组成一致,6个月内同供体不同批次样本应达到菌群组成差异无统计学意义。制作完成的菌液应有独立包装与标签。如制作胶囊,还应取胶囊内容物进行细菌活性监测与活细胞计数,其中细菌活性应不低于85%,每克内容物包含活菌数不小于109CFU。
全场景覆盖:翌圣生物肠道微生物检测NGS一站式解决方案
针对肠道微生物研究全流程技术痛点与多场景应用需求,翌圣生物深耕分子生物学试剂领域多年,依托成熟的NGS技术平台,打造了从样本前处理、核酸提取、宿主污染去除、文库构建到测序质控的全链条、标准化肠道微生物NGS解决方案,全面适配基础科研、菌株研发、临床检测、大健康消费四大赛道,完美兼容Illumina、MGI双测序平台。
一、高难样本核酸提取体系,保障样本原始真实性
专为粪便、肠道内容物等复杂样本研发的高纯度核酸提取试剂盒,可高效去除腐殖酸、多糖、胆汁等抑制杂质,完整保留低丰度致病菌群、严格控制试剂的背景菌,从源头保障数据准确性。
二、全覆盖NGS建库试剂,适配多技术研究范式
搭建完善的微生物测序建库产品矩阵,覆盖全研究技术路线:
产品推荐
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产品类别 |
产品名称 |
产品编号 |
产品应用 |
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DNA提取 |
MolPure® Mag Pro Soil/Stool DNA Kit |
土壤粪便等环境样本提取 |
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MolPure® Magnetic Bacterial/Fungal DNA Kit |
细菌 真菌DNA提取 |
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酶切法建库 |
Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit 2.0 |
适配样本广 |
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转座酶建库 |
Hieff NGS®Fast Tagment DNA Library(for 50 ng)Prep Kit for Illumina® |
菌落DNA建库 |
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rRNA去除 |
Hieff NGS® One-Step rRNA Removal Kit (100-1000ng) |
人源rRNA快速去除 |
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Total RNA建库 |
Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit |
mNGS 单RNA建库 |
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cDNA酶切法建库 |
Hieff NGS® ds-cDNA Synthesis Kit |
cdna 建库 |
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Hieff NGS® OnePot DNA Library Prep Kit |
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多重PCR |
Hieff NGS® Multiplex Long PCR Master Mix |
16S 多重扩增 |
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tNGS多重 |
Hieff® Multiplex RT-PCR Kit |
靶向扩增试剂 |
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16S(V3-V4) |
16S(V3-V4)Bacterial Metagenomic Library Construction Kit For Ilumina |
16S 多重扩增 含引物 |
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16S(V4) |
16S(V4)Bacterial AmpSeq Prep Kit For Illumina |
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16S(V4) |
16S(V4)Bacterial Metagenomic Library Construction Kit For MGI |
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16S(V3-V4)Bacterial Metagenomic Library Construction Kit For MGI |





