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上新 酶切法DNA建库再进阶:产量更高,数据更优!

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2026-09-04

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在肿瘤精准诊疗时代,NGS(下一代测序)已成为辅助诊断、伴随诊断、MRD监测、早筛早诊、遗传性肿瘤检测等应用场景的核心技术。而在整个NGS检测流程中,建库是至关重要的环节——建库的质量直接影响测序结果的准确性与可靠性。酶切法建库避免了传统的机械打断,无需打断仪,流程简便,可同时处理多个样本,更适合自动化建库,是目前应用最广泛的建库方法之一。

然而,肿瘤样本的特殊性对建库试剂盒提出了苛刻的要求,酶切法建库也存在酶切偏好性、假阳性、起始量适用范围窄等方法学局限。翌圣生物借助ZymeEditor酶改造及发酵纯化工艺平台,对酶进行进化改造,并不断优化反应体系,在经典产品的基础上全新升级,推出Hieff NGS® OnePot Evo DNA Library Prep Kit(Cat#12193ES,让酶切法建库更高效、更精准!

01
肿瘤DNA建库,难在哪?

肿瘤NGS检测中,从提取、建库、捕获到测序,每一个环节的效率都会影响到低频突变的检出率。基于NGS的肿瘤全景变异检测,对DNA建库试剂盒有四大核心要求:

低质量FFPE样本、微量cfDNA样本的建库成功率高;

接头连接效率高、文库扩增效率高;

片段化带来的假阳性低;

扩增无偏好性。

同时,肿瘤样本类型多样 ——FFPE、血浆、胸腹水、全血 / 骨髓血,样本质量参差不齐。以 12194ES 为代表的一步法建库试剂盒已在多家三方医检所客户中稳定应用,文库产量与酶切片段化大小均表现稳定;然而,针对低质量 FFPE 样本,若希望在保障稳定性的基础上进一步提升文库产量,12193ES 应运而生。

02
◆产品介绍
Hieff NGS® OnePot Evo DNA Library Prep Kit(Cat#12193)

产品特点:

适用5 ng - 1 μg的基因组DNA、全长cDNA等样本,兼容FFPE DNA样本;

高质量片段化酶,可随机切割双链DNA,酶切片段偏好性低;

片段化、末端修复/加A一步完成;

强扩增效率的高保真酶,显著提高文库质量及产量;

实验流程

image1.jpeg

03
产品优势

优势一文库产量显著提升

以小牛gDNA为模板,考察5 ng - 1 μg不同投入量的建库表现。

Input DNA

5 ng

50 ng

500 ng

1 μg

cycles

10

6

3

3

文库产量(ng)

1530~1836

2634~2718

2814~2928

3120~3150

数据显示,12193在5 ng微量起始到1 μg高通量投入的全范围内均能获得高产量的文库。

优势二:片段大小灵活可调

以Human gDNA 200 ng为模板,进行酶切时间梯度测试(3 - 20 min),不同酶切时间对应稳定的产物大小

wps_doc_1.jpg

◆酶切时间梯度:3min、5min、7min、10min、12min、15min、17min、20min

数据显示,通过简单调整酶切时间即可精准控制文库片段大小,满足不同Panel与测序平台的插入片段需求。

优势三:捕获数据质量全面优异

对比SupplierA(全外显子Panel,标准品NA12878):

指标 12193 SupplierA
Properly Mapped(%) 99.2 / 98.86 95.51 / 95.85
Coverage(%) 45.88 / 45.93 44.42 / 44.88
diff chr(%) 0.82 / 1.17 4.22 / 4.64

数据显示,12193的Properly比对率、Coverage、嵌合体比例(diff chr)显著优于SupplierA,数据指标基本一致且质量更优。

对比12194、Supplier B(FFPE样本靶向捕获,0.2M Panel,200 ng input,5 cycles):

wps_doc_2.png

Sample Map Ratio (%) Dup (%) Reads Capture (%) Mean Depth Coverage (%) 0.2 Mean Depth X Coverage (%) Soft Clip (%) Chimeric (%) Hairpin Artifacts Reads RPM
HYF--12193 99.95 26.83 80.37 4037.09 100.00 99.35 1.92 0.72 14.00 4.93
HYF--Supplier B 99.94 29.98 80.01 3900.99 100.00 99.08 2.11 0.93 17.00 6.00
FG--12193 99.91 18.19 65.87 3647.78 100.00 99.57 2.17 0.78 20.00 7.05
FG--Supplier B 99.89 19.91 65.56 3606.87 100.00 99.24 2.32 0.92 24.00 8.47
WZF--12193 99.95 29.44 83.13 3996.99 100.00 99.81 1.80 0.50 24.00 7.18
WZF--Supplier B 99.94 35.54 82.71 3614.11 100.00 99.86 2.07 0.82 23.00 8.13

数据显示,相同的样本、相同的投入量、相同的循环数,12193的文库产量最高;Map Ratio、Duplication Rate、Reads Capture率、Mean Depth、Chimeric、Hairpin Artifacts Reads等指标最佳。综合评估:12193的文库产量和数据质量整体优于Supplier B。

海外客户FFPE样本实测案例:

Metric Sample1-Supplier C Sample1-12193 Sample2-Supplier C Sample2-12193
Total reads (M) 25.36 26.28 28.23 26.68
Duplication rate  44.89% HIGH 32.56% PASS 45.12% HIGH 33.03% PASS
Mapping rate  99.96% 99.93% 99.95% 99.94%
Uniformity 99.69% 99.73% 99.55% 99.69%
Mean coverage 8113× 8703× 9008× 8920×
% On-bait  94.3% 94.0% 91.8% 94.3%
Fold enrichment 5939× 5781× 5713× 5829×
% Usable bases on-target 19.6% 24.3% 18.7% 24.3%
SNVs/indels reported 5 5 9 9
Concordant calls 5 5 9 9
Concordance 100% 100% 100% 100%

数据显示,12193相比客户原有FFPE建库方案:Duplication Rate显著降低(全部通过<40%阈值);Uniformity、Mean Coverage普遍更高,捕获效率更稳定;有效靶向碱基比例显著提升(19.6%→24.3%);SNV一致性保持100%。

优势四:假阳性水平可控

FFPE回顾性临床样本验证(200 ng input,杂交捕获后对比):

样本 raw_mut个数
(12193 vs Supplier D)
报告突变个数
(12193 vs Supplier D)
CNV MSI
样本1 11223 vs 13624 26 vs 26 一致 结论一致
样本2 12372 vs 16716 19 vs 19 一致 结论一致
样本3 1777 vs 2545 11 vs 11 一致 结论一致
样本4 2195 vs 2359 2 vs 2 一致 结论一致

数据显示,12193相对Supplier D突变检出个数更少,说明假阳性更小;回顾性样本中两种试剂报告的突变个数一致,检测到的CNV和MSI结论完全一致。

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产品规格

Hieff NGS® OnePot Evo DNA Library Prep Kit

12193ES08

8 T

12193ES24

24 T

12193ES96

96 T

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