产品简介
Hieff Clone® Universal II One Step Cloning Kit是新一代的同源重组克隆试剂盒,精心优化的第二代2× Hieff Clone® Universal II Enzyme Premix预混了重组酶和重组反应所需缓冲液,并添加了独特的重组增强因子,可显著提高重组克隆效率。
该试剂盒可以将PCR产物定向克隆至任何载体的任何位点,兼容未纯化PCR产物、直接回收的PCR产物、低浓度的胶回收产物,本产品可重组同源臂GC含量30%-70%的接头片段。将载体完全线性化,并在插入片段正、反向PCR引物5’端引入15-25 bp的线性化载体末端同源序列,使得插入片段PCR产物5’和3’末端分别带有与线性化载体两末端对应的完全一致的序列。PCR产物和线性化载体在重组酶的作用下,在50℃条件下最快仅需5 min即可完成重组反应。克隆阳性率可达95%以上。
组分信息
组分编号 |
组分名称 |
10923ES05 |
10923ES20 |
10923ES50 |
10923ES53 |
10923-A |
2 × Hieff Clone® Universal II Enzyme Premix |
50 μL |
200 μL |
500 μL |
500 μL |
10923-B |
500 bp control insert (25 ng/μL) |
5 μL |
5 μL |
5 μL |
5 μL |
10923-C |
pUC 19 control vector, linearized (50 ng/μL) |
5 μL |
5 μL |
5 μL |
5 μL |
10923-D |
LB Powder预混培养基 |
- |
- |
- |
3×0.5 L |
储存条件
组分A、B、C:-25~-15℃保存,有效期1年。
组分D:室温保存,有效期2年。
性能展示
单片段6 μL小体系高效重组
图1. 在6 μL小体系非复苏感受态下,连接10 ng低投入量单片段。结果显示,10923ES性能好于竞品,连接效率高,菌落数多,阳性率达100%。A-B:重组转化平板。载体(10 kb)和插入片段(1 kb)摩尔比为1:2。C:插入片段PCR鉴定电泳图,M:Yeasen 10505ES。
低浓度多片段高效重组
图2. 分别连接低浓度的五片段和六片段。结果显示,10923ES在低浓度下连接性能稳定,菌落数多,阳性率100%。A-B:重组转化平板。载体(11.6 kb)和插入片段(5片段共5.6 kb、六片段共7.6 kb)摩尔比为1:2。C-D:插入片段PCR鉴定电泳图,M:Yeasen 10505ES,菌P长度2.6 kb。
简版使用说明
1. 重组反应
1)线性化载体和插入片段使用量
Hieff Clone®重组反应体系各个片段及载体插入总浓度为0.02 - 1 pmol。载体与各个插入片段摩尔比为1:2*。对应的DNA质量可由以下公式计算获得:
50 ng 5,000 bp的DNA片段约为0.015 pmol
50 ng 500 bp的DNA片段约为0.15 pmol
*当插入片段长度>载体时,最适载体与插入片段使用量的计算方式应互换,即插入片段当做载体,载体当做插入片段进行计算。
**线性化载体及插入片段的反应终浓度最低可达到1 ng/μL。当上述公式计算的值低于或超过体系范围时,直接使用最低/最高投入量即可。
***线性化载体和插入片段扩增产物未纯化直接使用时,使用总体积应不超过反应体系体积的1/5,如20 μL体系不超过4 μL。
https://www.yeasen.com/calculator.html#/cloning-link/
2) 重组反应体系(可等比扩大或缩减反应体系,冰上配制,各组分使用前需混匀)
组分 |
重组反应体系 |
阳性对照 |
阴性对照-A |
阴性对照-B |
2× Hieff Clone® Universal II Enzyme Premix |
10 μL |
10 μL |
0 μL |
0 μL |
每个插入片段投入量 |
X μL |
1 μL(10923-B) |
0 μL |
X μL |
目的载体投入量 |
Y μL |
1 μL(10923-C) |
Y μL |
0 μL |
ddH2O |
To 20 μL |
To 20 μL |
To 20 μL |
To 20 μL |
表1 反应体系
阳性对照:排除实验材料及操作因素的影响。
阴性对照-A:确认线性化载体有无环状质粒残留;阴性对照-B:当插入片段原始质粒与载体有相同抗性时,确认插入片段有无环状质粒残留。
3)重组反应条件
连接片段数 |
重组反应时间 |
2 |
10 min |
3 |
20 min |
4 |
30 min |
5 |
40 min |
6 |
50 min |
表2 反应时间
2. 10 min快速转化
1)提前15分钟将用到的筛选培养基平板拿到37℃预热。
2)在冰上解冻快速克隆感受态细胞(如:DH5α Fast Chemically Competent Cell,Cat#11803ES)。
3)取10 μL冷却重组产物,加入到100 μL感受态细胞中,轻弹管壁数下混匀,在冰上放置5 min。
4)用200 μL移液枪将上一步的混合物转移到已经37℃预热的LB培养基上,均匀涂布。
5)将平板置于37℃培养箱倒置过夜培养。若进行蓝白斑筛选操作,平板在37℃至少倒置培养15 h。
3. 克隆鉴定
最方便快捷的方法是菌落PCR。用无菌的枪头或牙签将单个菌落挑至菌落PCR Mix中混匀(如:2×Hieff® Ultra-Rapid II HotStart PCR Master Mix,Cat#10167ES),加入引物直接进行PCR反应。推荐至少使用一条通用测序引物进行菌落PCR,可以避免PCR假阳性的产生。后续也可用于酶切或测序鉴定。
注意事项
1. 需自备的材料:
1)自备样品:自备好线性化载体和插入片段。
2)自备试剂(仅罗列部分):
a. 超级感受态:转化效率>108 cfu/μg,如翌圣F DH5α快速超级感受态细胞(Cat#11803ES)。
b. 高保真酶:2× Hieff Canace® AdvanceFast PCR Master Mix (With Dye)(Cat#10164ES)或其他等效产品。
c. 快速菌落PCR mix:2×Hieff® Ultra-Rapid II HotStart PCR Master Mix(Cat#10167ES)或其他等效产品。
d. 核酸染料:YeaRed Nucleic Acid Gel Stain (10,000× in Water)(Cat#10202ES),适用于紫外凝胶成像仪;YeaGreen Nucleic Acid Gel Stain (10,000×in Water)(Cat#10204ES),适用于紫外凝胶成像仪和蓝光切胶仪;或其他等效产品。
3)自备仪器耗材(仅罗列部分):PCR仪,水平电泳槽,切胶仪,EP管等。
4)制备LB液体培养基、固体平板,操作步骤参考说明书“5. LB培养基配制”。
2. 为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。
3. 本产品仅作科研用途!
常见问答
1、最佳克隆位点选择?
答:在选择克隆位点时,应避免选择克隆位点上下游50 bp内有重复序列的区域。当克隆位点上下游25 bp区域内GC含量均在40%-60%范围内时,重组效率将达到最大。若高于70%或者低于30%,重组效率会受到较大影响。
2、无克隆长出或克隆数较少?
答:出现该情况,建议使用阳性对照,可排除试剂盒本身的影响,并进行进一步判定,主要有以下可能情况:
1)引物设计不合适:推荐【同源序列(15-25 bp)+完整的酶切位点+基因特异性扩增引物】,GC含量40% - 60%。
2)感受态细胞效率低:使用新鲜制备或妥善冻存的感受态细胞,确保其转化效率>107 cfu/μg。每次操作时可设置一组转化质粒的对照实验,以检测感受态细胞的转化效率。连接产物体积不应超过感受态细胞体积的1/10,否则会降低转化效率。
3)线性化载体和插入片段扩增产物的使用量不足/过量,或者比例不佳:尽量按照推荐的量和比例配制重组反应体系。
4)线性化载体和插入片段扩增产物不纯,抑制反应:线性化载体和插入片段扩增产物未纯化,直接使用时,使用总体积应不超过反应体系体积的1/5,如20 μL体系不超过4 μL。建议线性化载体、插入片段扩增产物进行凝胶回收纯化,纯化产物溶解在ddH2O中。
3、出现较多假阳性
答:主要有以下可能情况:
1)载体线性化不完全:即使是痕量未完全酶切的载体也会产生很高的转化背景。可通过阴性对照检测载体是否线性化完全,优化酶切体系,提高限制性内切酶使用量、延长酶切反应时间、胶回收纯化酶切产物等都可以有效减少环状质粒残留。
2)插入片段扩增产物混有非特异扩增产物:建议:①优化PCR体系,提高特异性;②胶回收PCR产物;③鉴定更多克隆。
3)反应体系中混入了相同抗性的质粒:PCR扩增模板(载体或插入片段)为环状质粒时,若扩增产物直接用于重组反应,残留环状质粒模板会产生较高的转化背景。建议使用预线性化质粒作为扩增模板、扩增产物进行DpnI消化或扩增产物进行胶回收纯化。
4、菌落PCR无条带
答:主要有以下可能情况:
1)引物不正确:推荐使用载体的通用引物或至少使用一条通用引物进行菌落PCR检测。
2)PCR体系或程序不合适:没有目的条带也没有空质粒条带,建议优化PCR体系、程序;或者提取质粒,以质粒做模板PCR验证;或者进行酶切验证。
3)重组失败:没有目的条带,只有空质粒的条带,说明重组不成功,载体线性化不完全,建议优化酶切体系。
5、测序无信号或测序插入片段序列突变
1)菌P条带亮,但测序无信号:建议进行双酶切验证,或者摇菌培养单菌落,提取质粒DNA重新验证。
2)插入片段序列突变/缺失几个碱基:查看测序图谱,比对碱基序列峰图,如为连续碱基,会有漏读或读错风险。
3)插入片段序列缺失/增加大片段序列:①插入片段与载体的部分位点存在同源互补序列。②实验中存在插入片段上下游引物(含同源臂)扩出的非特异条带。建议:目的片段切胶回收纯化。
Ver. CN20241126
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