pA-Tn5 Transposase (10 U/μL)

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产品说明书

FAQ

COA

已发表文献

产品简介

 

Tn5转座酶特异性识别转座子两端反向重复的ME序列(Mosaic End),形成转座复合体后随机的将转座子插入靶DNA中。 Protein A 偶联转座酶(Protein A-Tn5) , 即通过将Protein A与改造的超高活性Tn5转座酶融合,形成兼具双重活性的新型融合酶(pA-Tn5Transposase),可在抗体引导下精准靶向切割目的蛋白附近的DNA序列,适用于CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)技术。CUT&Tag是替换传统的ChIP-Seq用以研究蛋白质-基因组互作的新技术,与后者相比,它具有显著优势,如:信噪比高,可重复性好,实验周期短(1天实现从细胞到文库构建),细胞投入量低等,该方法适用于表观遗传学、肿瘤、干细胞等研究领域。

 

组分信息

 

组分编号

组分名称

14528ES58

14528ES66

14528-A

pA-Tn5 Transposase (10 U/μL)

8 μL

16 μL

14528-B

Assemble Buffer

1 mL

2×1.25 mL

14528-C

5×Tagment buffer*

1 mL

2×1.25 mL

14528-D

6×Terminate Solution

1 mL

2×1.25 mL

*5×Tagment buffer 含Mg2+,用于测试制备的转座子片段化DNA的效果,而非CUT&Tag工作Buffer。

 

储存条件

 

组分A应于-85~-65℃保存,其余组分-25~-15℃保存,有效期1年。

 

注意事项

 

1. 转座酶对温度敏感,请在接收货物后建议尽快完成接头包埋,生成的转座子可以放置于-20℃保存。

2. 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

3. 本产品仅用作科研用途。

 

使用方法

 

以高通量测序建库为例,在使用前,请务必仔细阅读使用说明。

1. 转座子生成

1.1 配置以下反应体系

组分

体积(μL)

pA-Tn5 Transposase (10 U/μL)

2

Adapter mix (100 μM)*

0.4

Assemble Buffer

Up to 20

*Adapter mix根据实验目的以及测序平台,自备。

1.2 反应条件

使用移液器轻轻吹打充分混匀置于25℃反应1 h(热盖关闭)。反应产物命名为pA-Tn5 Mix,可直接应用于建库实验,或-20℃保存。

2. DNA片段化测试

2.1 配置以下反应体系

组分

体积(μL)

Input DNA (50 ng/μL)*

X

5×Tagment buffer

4

pA-Tn5 Mix**

1

ddH2O

To 20

*DNA 使用量越大,片段化产物平均长度越长;反之,片段化产物平均长度越短。

**如需提高打断程度,可提高pA-Tn5 Mix使用量;反之,可减少酶使用量。

2.2 片段化反应程序

轻轻吹打或振荡混匀,短暂离心。将上述PCR管置于PCR仪,按照下表所示反应程序,进行片段化反应。

温度

时间

热盖105℃

On

55°C

10 min

4°C

Hold

2.3 DNA片段化终止

配置以下反应体系,在上述片段化产物中添加下表中各反应组分,使用移液器轻轻吹打20次混匀。

组分

体积(μL

片段化产物

20

6×Terminate Solution

4

Total

24

按照下表所示反应程序,进行终止反应。

温度

时间

热盖105℃

On

55°C

10 min

4°C

Hold

待样品温度降到4°C后,取出PCR管,进行片段化产物纯化,可使用21 μL ddH2O 进行洗脱。
2.4. 片段化产物质量控制
a) 使用 Qubit 进行浓度测定
b) 使用 Agilent Technologies 2100 Bioanalyzer 进行长度分布检测。
2.5 片段化产物扩增
可根据具体的实验目的与测序平台选择合适的试剂进行扩增实验。

 

Ver.CN20241230

400-6111-883