产品简介
Tn5转座酶特异性识别转座子两端反向重复的ME序列(Mosaic End),形成转座复合体后随机的将转座子插入靶DNA中。 Protein A 偶联转座酶(Protein A-Tn5) , 即通过将Protein A与改造的超高活性Tn5转座酶融合,形成兼具双重活性的新型融合酶(pA-Tn5Transposase),可在抗体引导下精准靶向切割目的蛋白附近的DNA序列,适用于CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)技术。CUT&Tag是替换传统的ChIP-Seq用以研究蛋白质-基因组互作的新技术,与后者相比,它具有显著优势,如:信噪比高,可重复性好,实验周期短(1天实现从细胞到文库构建),细胞投入量低等,该方法适用于表观遗传学、肿瘤、干细胞等研究领域。
组分信息
组分编号 |
组分名称 |
14528ES58 |
14528ES66 |
14528-A |
pA-Tn5 Transposase (10 U/μL) |
8 μL |
16 μL |
14528-B |
Assemble Buffer |
1 mL |
2×1.25 mL |
14528-C |
5×Tagment buffer* |
1 mL |
2×1.25 mL |
14528-D |
6×Terminate Solution |
1 mL |
2×1.25 mL |
*5×Tagment buffer 含Mg2+,用于测试制备的转座子片段化DNA的效果,而非CUT&Tag工作Buffer。
储存条件
组分A应于-85~-65℃保存,其余组分-25~-15℃保存,有效期1年。
注意事项
1. 转座酶对温度敏感,请在接收货物后建议尽快完成接头包埋,生成的转座子可以放置于-20℃保存。
2. 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
3. 本产品仅用作科研用途。
使用方法
以高通量测序建库为例,在使用前,请务必仔细阅读使用说明。
1. 转座子生成
1.1 配置以下反应体系
组分 |
体积(μL) |
pA-Tn5 Transposase (10 U/μL) |
2 |
Adapter mix (100 μM)* |
0.4 |
Assemble Buffer |
Up to 20 |
*Adapter mix根据实验目的以及测序平台,自备。
1.2 反应条件
使用移液器轻轻吹打充分混匀,置于25℃反应1 h(热盖关闭)。反应产物命名为pA-Tn5 Mix,可直接应用于建库实验,或-20℃保存。
2. DNA片段化测试
2.1 配置以下反应体系
组分 |
体积(μL) |
Input DNA (50 ng/μL)* |
X |
5×Tagment buffer |
4 |
pA-Tn5 Mix** |
1 |
ddH2O |
To 20 |
*DNA 使用量越大,片段化产物平均长度越长;反之,片段化产物平均长度越短。
**如需提高打断程度,可提高pA-Tn5 Mix使用量;反之,可减少酶使用量。
2.2 片段化反应程序
轻轻吹打或振荡混匀,短暂离心。将上述PCR管置于PCR仪,按照下表所示反应程序,进行片段化反应。
温度 |
时间 |
热盖105℃ |
On |
55°C |
10 min |
4°C |
Hold |
2.3 DNA片段化终止
配置以下反应体系,在上述片段化产物中添加下表中各反应组分,使用移液器轻轻吹打20次混匀。
组分 |
体积(μL) |
片段化产物 |
20 |
6×Terminate Solution |
4 |
Total |
24 |
按照下表所示反应程序,进行终止反应。
温度 |
时间 |
热盖105℃ |
On |
55°C |
10 min |
4°C |
Hold |
待样品温度降到4°C后,取出PCR管,进行片段化产物纯化,可使用21 μL ddH2O 进行洗脱。
2.4. 片段化产物质量控制
a) 使用 Qubit 进行浓度测定。
b) 使用 Agilent Technologies 2100 Bioanalyzer 进行长度分布检测。
2.5 片段化产物扩增
可根据具体的实验目的与测序平台选择合适的试剂进行扩增实验。
Ver.CN20241230