肠道微生物研究的利器-粪便DNA提取试剂盒

 

PART 01

背景简介

 

1998年,Handelsman等人提出宏基因组学这概念,它是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象,以功能基因筛选和/或测序分析为研究手段,以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法。随着高通量测序技术的不断发展,宏基因组学的研究也掀起了一波热潮,应用范围十分广泛,例如环境检测、水质检测、挖掘功能菌株、肠道菌群检测、新药开发等领域。

粪便是人或动物的大肠排遗物。粪便的四分之一是水分,其余大多是蛋白质、无机物、脂肪、未消化的食物纤维、脱了水的消化液残余、以及从肠道脱落的细胞和死掉的细菌等。一般来说,只需提取其中细菌的核酸进行研究,剩余的食物纤维、蛋白质等均会对提取造成干扰,其中食物纤维会增加裂解难度,蛋白质会降低核酸的纯度,影响下游研究的开展。

为解决这些难题,翌圣研发了一款粪便DNA提取试剂盒--- MolPure® Stool DNA Kit,能高效获得优质的粪便DNA,有利于后续对肠道微生物的研究。

 

 

PART 02

产品介绍

 

MolPure® Stool DNA Kit 适用于各类粪便样本的基因组DNA提取。离心吸附柱中采用的硅基质材料为特有新型材料,配合独特的缓冲液配方可有效去除动物粪便中各种影响下游实验的抑制因子,并能高效地回收粪便中的基因组DNA。提取的DNA纯度高,质量稳定可靠,可适用于各种下游应用实验,如酶切、PCR、文库构建等。

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产品特点

 

»  纯度高:无有机提取或乙醇沉淀,下游应用不受抑制。

»  提取产量高从粪便中纯化最多30 μg基因组、细菌、病毒和寄生虫DNA。

»  操作简便、快速:可以在1 h内完成提取操作。

»  提取产量高从粪便中纯化最多30 μg基因组、细菌、病毒和寄生虫DNA。

»  操作简便、快速:可以在1 h内完成提取操作。

 

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应用案例

 

MolPure® Stool DNA Kit提取粪便DNA完整度好、产量高。分别称取6份200 mg小鼠粪便样本,使用MolPure® Stool DNA Kit和O品牌、T品牌同类产品提取基因组DNA,50 μL ddH2O洗脱。并取等体积量的DNA,跑胶鉴定基因组完整度和条带亮度。

l1.jpg 

图1. 琼脂糖电泳判定提取的基因组产量。Y为翌圣品牌,O*为进口品牌,T为国产品牌。翌圣品牌提取产量高,DNA完整性更好。

 

 

PART 03

F A Q

 
Q:
粪便样品提取的DNA都是动物本身的DNA?

粪便样品中仅含有一小部分脱落的消化道细胞,消化脱落细胞的基因组DNA,约占总DNA的0.01%。大部分DNA为细菌DNA和食物源DNA。

Q:

如何保存粪便样品,可尽量避免遗传物质的降解?

目前较好的保存方法是粪便与干燥硅豆混合保存,或是在DMSO / EDTA/ Tris盐溶液中保存,可以有效减缓DNA的降解。

Q:

粪便样品的DNA的产量如何?

粪便样品中大部分的DNA来自于细菌和食物。粪便中细菌的含量较别大,因此,粪便DNA的含量差别非常大,一般为200 ng-20 μg不等。

Q:

粪便样品中存在的PCR等抑制因子有何组分?

粪便样品中含有多种微生物,其多聚糖、植物多糖、胆酸、 胆盐、胆色素、消化液、粘液等均会对Taq酶等的活性产生影响,而影响到粪便DNA的下游检测。

Q:

如何减少粪便样品的污染?

由于粪便会不同程度的暴露在环境中,因而易于受到外源遗传物质的污染,在粪便DNA的提取以及PCR扩增过程中,污染已经成为影响研究结果的重要因素。因而在DNA提取及PCR扩增过程中,所有步骤进行空白对照实验是必要的,另外,在粪便样品收集、保存以及提取过程中,采用严格的消毒措施也可以有效减少污染的机会。

Q:

粪便DNA下游PCR检测无法扩增出特异性片段是否均为抑制剂的影响?

由于粪便样品中含有大量的PCR等抑制因子,如果纯化过程没有将其去除掉,会影响到特异性片段的扩增。但是模板添加量也是个关键性问题,虽说PCR检测对其模板是非常灵敏的,但也是有其正常的检测域,一般要在100 ng以上,而粪便样品含有的核DNA非常少,在纯化过程中产量不高的话,会由于模板添加量在其正常检测域之外而导致无法扩增出特异性片段。

 

 

 

PART 04

订购信息

 

 

产品名称

产品编码

规格

MolPure® Stool DNA Kit 粪便DNA提取试剂盒

18820ES50

50T

 

 

PART 05

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实验类型

产品名称

产品编码

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HB210927

 

400-6111-883