外泌体(Exosome)参与细胞之间的交流,物质的运输以及正常生理过程的维持、还与许多疾病息息相关,目前越来越多的人做这方面的研究。关于外泌体提取、组成、“载体”和相应功能的精准分子机制近些年越来越受到关注,而且发表的有关外泌体的文章也在逐年增加。外泌体(Exosome)的研究历程主要包括外泌体提取与纯化、外泌体鉴定与检测、外泌体荧光标记、和外泌体的蛋白组学以及下游机制研究等。下面我们就简单介绍一下外泌体的研究历程。
1
什么是外泌体?
外泌体(Exosome)是一种由活细胞分泌到细胞外环境的膜性小囊泡,是细胞间信息传递的重要载体。外泌体天然存在于体液中,参与细胞间相互作用。
• 大小:直径约30~140 nm,比微泡小;
• 密度:密度约为1.13~1.19g/ml;
• 结构:双层膜囊泡状结构小体;
• 数量:人体中大约有1014个,平均每个细胞产生1000~10000个;
• 细胞源:人体中几乎所有类型的活细胞均能产生外泌体;
• 异质性:同一种细胞分泌的外泌体,也会存在功能区别;
• 分布:外周血、尿液、唾液、 乳汁、腹水、羊水等体液中;
• 外泌体产生于细胞中的多泡体。
2
外泌体组成与功能
外泌体(Exosome)携带大量特异性的蛋白质以及功能性的mRNAs、miRNAs等,在体内参与细胞通讯、细胞迁移、促血管新生和抗肿瘤免疫等生理过程,与多种疾病的发生和进程密切相关。不仅可以作为诊断多种疾病的生物指标,也可以作为治疗手段,未来有可能作为药物的天然载体用于临床治疗,是液态活检领域“三驾马车”之一。以下为外泌体的提取、纯化、鉴定和分析过程。
图1. 外泌体组分
3
外泌体分离
目前已经开发出多种外泌体(Exosome)提取方法包括:密度梯度,体积排阻,免疫磁珠和基于聚合物沉淀的方法。根据外泌体的体积,密度和表面标志物的不同进行分离,不同提取外泌体方法优劣势比较如下:
分离方法 |
分离原理 |
优点 |
缺点 |
超速离心法 |
根据颗粒的密度,大小,形态逐级离心 |
成本低;容量大; 试剂污染小。 |
仪器价格比较高; 操作时间比较长; 外泌体形态受损。 |
超滤法 |
超滤膜用于从蛋白质和其它大分子分离外泌体。外泌体群集中在膜上。 |
速度快; 不需要特殊仪器; 使用轻便。 |
压力会破坏外泌体; 吸附造成损失;堵塞滤膜。 |
体积排阻法 |
体积排阻层析分离基于它们的大小。它使用填充有多孔聚合珠的柱子。 |
纯度高;外泌体形态和活性较好; 重复性强; 上样量大 |
需要精密的仪器; 花费较大; 时间比较长。 |
外泌体沉降法 |
利用外泌体的溶解度或者分散性通过排水聚合物进行沉淀 |
使用方便;不需要特殊仪器; 可以大量制备。
|
非外泌体物质会发生共沉淀。 例如蛋白质,RNA,聚合物原料,需要进行样品的前处理和后处理。 |
免疫磁珠法 |
通过外泌体表面蛋白的抗原抗体相互作用 |
特异性强; 纯度较高。
|
试剂价格昂贵; 适用性比较低; 产量较低; 只针对没有细胞的样品。 |
色谱法 |
根据外泌体的大小进行分离 |
得到的外泌体大小均一 |
设备特殊,价格高,应用不广泛 |
目前翌圣生物公司提供的细胞上清/血清血浆外泌体提取试剂盒(货号:41201ES25和41202ES),采用独特的分离技术,可以快速从细胞培养上清中获得大量完整的外泌体颗粒,适用于下游的细胞共培养、电镜分析、Western Blot、荧光定量(qPCR)和高通量测序等应用。细胞上清外泌体抽提试剂实验流程如下:
图2. 细胞上清外泌体抽提试剂盒实验流程
4
外泌体鉴定
外泌体的功能研究第一步,即进行外泌体的鉴定。目前包括电镜法、NTA粒径法、WB法、核酸分析法等来鉴定外泌体的结构、特异性蛋白、核酸序列等。
在外泌体研究中,电镜能够直接观察到样品中外泌体的形态。并且具有很高的分辨率,能够鉴别大小不一的外泌体。但对样品的预处理和制备上面要求较高,样品的准备阶段比较复杂,不适合对外泌体进行大量快速的测量。而且由于外泌体经过了预处理和制备过程,无法准确的进行外泌体浓度的测量。
图3. 电镜分析外泌体形态结构(图片来源:Current protocols in cellbiology(2006): 3-22)
NTA技术是表征外泌体的浓度粒径测试手段之一,对不同大小的外泌体颗粒追踪和分析,可计算出外泌体的直径和浓度。相较于其他表征方式,NTA技术的样本处理更简单、更能保证外泌体原始状态、检测速度更快。
图4. NTA分析外泌体颗粒直径符合标准, 颗粒分散性好,大小均一。
WB分析典型的标记蛋白包括四跨膜蛋白超家族,如CD9、CD63、CD81等,定性鉴定检测需要选择至少2个指标才能达到文章发表要求,比如检测CD63和TSG101。外泌体鉴定试剂盒(货号:41203ES05 )是翌圣生物针对外泌体标志蛋白CD63和TSG101检测而研发的一款高效且方便的产品。试剂盒内的抗体经过严格筛选而得,适用于外泌体CD63和TSG101蛋白的检测。
该产品适用于人、大鼠、小鼠外泌体的鉴定。
图5. P为CD63&TSG101阳性对照品;S为外泌体样品
外泌体中含有大量的RNA和DNA,包括功能性的 mRNAs、miRNAs、lncRNA、mtDNA等,这些RNA分子以外泌体为载体进入靶细胞后,会通过不同的机制对靶细胞产生影响。可通过实时荧光定量PCR法、高通量测序技术分析外泌体RNA分子差异,是对外泌体RNA功能研究的有效手段。
图6. qPCR法分析细胞上清液提取出的外泌体
5
外泌体荧光标记
通过对外泌体体外荧光标记示踪,可以对外泌体功能性进行研究,包括蛋白组学研究、外泌体活体成像实验、外泌体启动子活性研究等。目前荧光标记外泌体的方法有很多,主要包括亲脂性染料PKH-67/PKH-26、亲脂性羰花青染料DiI/DiD/DiO/DiR、以及渗透型的化合物标记法:CFSE/CFDA/Calcein-AM等。
6
外泌体相关FAQ
1. 不同样本提取外泌体参考体积?
样本体积(参考量) |
||
样本类型 |
电镜、NTA粒径、Western Blot |
多基因核酸分析(qPCR)、NGS测序 |
细胞上清* |
10-20 mL |
40-60 mL |
血清 |
1 mL |
2 mL |
血浆 |
1 mL |
2 mL |
尿液 |
20 mL |
50-60 mL |
脑脊液 |
10 mL |
20-30mL |
精液 |
1-2 mL |
2-5 mL |
唾液 |
5-10 mL |
10-20 mL |
腹水 |
10-20 mL |
20-40 mL |
羊水 |
10-20 mL |
20-40 mL |
乳液 |
5 mL |
10-20 mL |
2. 外泌体血液样本提取需注意事项?
全血经过长时间放置,冷冻、离心、会发生溶血现象,无法提取外泌体,必须做好血清血浆的分离。以及去除血清外源的外泌体。
3.如何去除血清外源的外泌体。
a.将细胞培养用的血清通过1×105g超速离心10h,去除血清外泌体;
b.选择无血清培养基进行细胞培养。
4.细胞上清外泌体提取试剂盒(货号:41202)可以提取哪些样本的外泌体?
细胞上清液、尿液(可直接提取)、脑脊液(需处理后再提取)。其他的组织液包括体液、唾液、卵泡液、精液等提取效率较低,建议客户用专门的组织液提取试剂盒。
5.如何提取组织细胞外泌体?
无菌环境下将组织剪成小块(越小越好),然后在无血清的培养基中培养12h;将培养液转移至离心管中,于4℃以3000g离心20 min去除培养液中杂质和细胞碎片,将上清液转移至新的离心管中;先使用0.45μm滤器过滤上清液,接着使用0.2μm滤器过滤上清液,再按照本试剂盒说明书提取外泌体。
6.外泌体如何保存?
纯化后的外泌体可于 4℃保存不超过一周,-80℃条件下可长期保存,避免反复冻融。
7
外泌体相关产品推荐
名称 |
货号 |
规格 |
价格(元) |
|
外泌体提取 |
HieffTM Quick exosome isolation kit for Cell Culture Media)细胞培养上清外泌体快速抽提试剂盒HOT |
41201ES25/50 |
25 mL/50 mL |
2155.00/ 3855.00 |
41202ES30 |
30 mL |
2155.00 |
||
外泌体定量 |
20101ES60 |
100 mL |
228.00 |
|
20201ES76 |
500T(100 mL) |
228.00
|
||
外泌体鉴定(Western Blot) |
36231ES10 |
1盒(10块) |
573.00 |
|
GoldBand 3-color Regular Range Protein Marker(10-180 kDa)三色预染蛋白质分子量标准HOT |
20351ES76 |
2×250 μL |
585.00 |
|
外泌体标记 |
40725ES10/25 |
10/25 mg |
488.00/988.00 |
|
40757ES25 |
25 mg |
988.00 |
HB20200927