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上新 | 免凝胶回收!翌圣Small RNA建库试剂盒正式亮相!

8820

2025-12-04

背景介绍

Small RNA,是长度大约在18-30 nt的非编码RNA分子,包括miRNA、siRNA、piRNA、snoRNA、rasiRNA等,其中很多种类是生命活动重要的调控因子,通过靶向沉默与降解与之结合的靶基因在基因表达调控、生物个体发育、代谢与疾病的发生等生理过程中起重要作用。

由于miRNA基因数量多,表达量丰富,所以进行small RNA测序出来的数据中miRNA占主要地位,目前研究最广的也是miRNA,而其他small RNA的研究分析较少。


miRNA在细胞核内经过剪切形成pre-miRNA。在细胞核外剪切形成成熟体miRNA。miRNA发挥功能是在细胞核外(与mRNA翻译一致,mRNA在核内转录,且在核内进行加工形成成熟的mRNA,成熟的mRNA释放到胞质中,有一些被mRNA调控后抑制或者降解而不能翻译,没被调控的mRNA会在核糖体上翻译成蛋白,最终呈现出物种的不同表型)。

翌圣Small RNA建库试剂盒介绍

Hieff NGS® Small RNA Library Prep Kit for llumina建库试剂盒,是适用于Illumina测序平台的Small RNA文库构建专用试剂盒。适用于动、植物细胞/组织分离纯化的Small RNA,以及其他类型总RNA(如外泌体总RNA)的小RNA文库构建。

  • 适合动物、植物和组织等不同样本分离纯化的10~1 μg的small RNA。

  • 适合不同样本提取的100 ng~4 μg总RNA。

  • 磁珠分选试剂盒,免凝胶回收。

  • 即用型试剂盒:试剂盒中含建库所需的磁珠和接头,无需准备除酒精和样本以外的其他试剂。

  • 适配自动化移液工作站建库。

Small RNA建库应用

small RNA适合生命体生长发育等各个阶段、部位或方面的研究。

  • 植物方向:植物对环境的适应性、突发、个体发育、遗传性状。

  • 动物方向:农艺性状、适应性、个体发育、遗传性状、药物干预模式动物调控机制。

  • 真菌方向:机理性、应用性、药用食用性研究。

  • 肿瘤标志物:miRNA评估癌症患者的发展、进展、预后、诊断和治疗反应。

Small RNA数据展示

100 ng~4 μg Total RNA建库数据展示

用鼠心脏、肝脏、肺组织以及293细胞提取的total RNA按照Hieff NGS® Small RNA Library Prep Kit for llumina试剂盒进行small RNA建库,最终能得到单一条带,且文库浓度和峰型都符合small RNA文库特征。

图.鼠心脏、肝脏、肺组织以及293细胞提取的total RNA的100 ng~4 μg Total RNA建库数据展示

small RNA推荐投入量1 μg~10 ng的small RNA投入的建库数据展示

用鼠肝样本提取的small RNA直接投入,按照Hieff NGS® Small RNA Library Prep Kit for llumina试剂盒进行small RNA建库,最终能得到单一条带,且文库浓度和峰型都符合small RNA文库特征。

图.鼠肝脏提取的small  RNA的10 ng~1 μg Small  RNA建库数据展示

miRNA小知识

miRNA特征

  • miRNA无开放阅读框且表现出进化上的保守性,由含有发夹结构的前体剪切加工而来,通常其前体的自由能比较低(基本命名miR-1,miR-172这样,在不同物种中,名称都是一样的,后面的编号是由miRNA注册数据库按顺序指派。miRNA家族命名为miR375a,miR375b等。如果miRNA多拷贝,则命名miR-281-1、miR-281-2)。

  • 成熟的miRNA长度为19~25 nt,5’端带有磷酸基团且多为尿嘧啶核苷酸,3’端带有羟基,因而miRNA能与大多数寡核苷酸和功能RNA的降解片段区分开来。

  • 大多数miRNA呈现出组织特异性表达和发育阶段特异性表达的特点,且具有调控自身转录的机制。

  • miRNA基因以单拷贝、多拷贝或基因簇的形式广泛存在于真核生物基因组中,且大部分位于基于间隔区,也有相当一部分位于编码蛋白基因的内含子中。

miRNA调控机制

  • miRNA介导mRNA的翻译抑制
    动物miRNA与靶mRNA的3’-UTR部分序列反向互补结合,而这种结合基本上不是完全匹配的从而导致靶标mRNA翻译表达受影响,但是该影响是可逆的。

  • miRNA介导mRNA的特异性切割
    植物miRNA与靶序列的ORF近乎完全匹配。在植物中,miRNA主要通过介导mRNA的特异性切割来实现对基因进行调控。

  • miRNA介导mRNA的快速脱腺苷酸化
    mRNA转录后通过polyA尾的添加来维持稳定性而不被降解。有些miRNA能促进mRNA的polyA尾的去除而导致其降解。

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货号

名称

规格

12342ES

Hieff NGS® Small RNA Library Prep Kit for llumina

8 T/24 T/96 T

12642ES

1× dsDNA HS Assay Kit 即用型dsDNA qubit定量试剂

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