Hieff NGS® EvoMax RNA Library Prep Kit(dNTP) 预装板RNA建库试剂盒(不含放线菌素D)

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产品说明书

FAQ

COA

已发表文献

 

Hieff NGS® EvoMax RNA Library Prep Kit(dNTP)是兼容Illumina和MGI双平台的Total RNA测序文库构建试剂,本产品有常规管式和预装板两种规格预装板建库试剂盒无需手动配制或分装,可直接适配自动化上机建库,使用更为便捷。试剂包含RNA片段化试剂,反转录试剂,ds-cDNA合成试剂,以及文库扩增试剂。可以衔接mRNA纯化试剂盒或rRNA去除试剂盒构建测序文库。所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,最大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。

产品信息

货号

12341ES24/12341ES96/12341ES97/12341ES98

规格

24 T/96 T/96 T(自动化)/96 T(板式)

组分信息

产品组分

组分名称

12341ES24

12341ES96

12341ES97

(管式自动化96T)

12341ES98

(板式自动化96T)

12341-A

Frag/Prime Buffer

450 μL

2×900 μL

2×1064 μL

8×266 μL

12341-B

1st Reaction Module 2.0

192 μL

768 μL

960 μL

8×120 μL

12341-C

2nd Reaction Module(dNTP)

840 μL

3×1120 μL

3×1280 μL

8×480 μL

12341-D

Ligation Reaction Module

840 μL

3×1120 μL

3×1280 μL

8×480 μL

12341-E

2×Super Canace® II High-Fidelity Mix

600 μL

2×1200 μL

2×1360 μL

8×340 μL

*

Primer Mix*

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/

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注:* 标注表示该成分不包含在本试剂盒,若建库时,搭配短接头,无需该组分;若建库时搭配完整长接头,则需要额外配置,本试剂盒组分兼容Illumina和MGI双平台,但需要额外配置专属于Illumina®或者MGI®的primer mix(Cat# 13334 Primer Mix for MGI®以及Cat# 13335 Primer Mix for Illumina®)。

** 板式自动化试剂组分排版情况见下图。

图:板式建库试剂盒试剂组分排版图

储存条件

-25~-15保存,有效期1年。

注意事项

1.关于操作

1)为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

2)请于使用前将试剂盒各组分置于室温解冻。解冻后上下颠倒数次充分混匀,短暂离心后置于冰上待用。

3)推荐在带热盖的PCR仪中进行各步骤反应,使用前应预热PCR仪至反应温度附近。

4)请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用ThermoFisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

5)PCR产物因操作不当极容易产生气溶胶污染,进而影响实验结果准确性。推荐将PCR反应体系配制区和PCR产物纯化检测区进行强制性的物理隔离;配备文库构建专用移液器等设备;定时对各实验区域进行清洁(推荐使用ThermoFisher公司的DNAZapTM高效核酸去除喷雾),以保证实验环境的洁净度。

6)若搭配移液工作站进行自动化建库,可咨询翌圣自动化建库流程。

7)板式试剂盒每孔试剂推荐开封后一次性使用。

8)本产品仅作科研用途!

2.关于接头连接 (Adapter Ligation)

1)本公司可提供Illumina®或者MGI®长接头(Barcoded Adapter)试剂盒和短接头试剂盒,客户可根据实验需求进行选择。

2)我们建议选用高质量的商业化接头。如客户使用自制接头,请委托具有NGS引物合成经验的公司,并备注需进行严格的防污染控制。此外,进行接头退火操作时,请在超净台完成。每次只操作一种接头,防止交叉污染。

3)使用接头时,请提前将接头取出放在4℃或冰盒上解冻;在室温操作时,实验室温度最好不要超过25℃,防止接头解链。

4)建库过程中,接头浓度过高或过低都会导致建库成功率变低。本试剂板操作方案中,所加入的接头体积固定为5 μL,请根据初始的RNA投入量,参考表1对接头进行稀释。接头稀释液请选择0.1×TE buffer,稀释过的接头可在4℃保存48小时。

1-1 Input Total RNA量与Illumina®接头使用浓度推荐表*

Input Total RNA

Illumina® Adapter stock concentration

10 ng

1 μM

100 ng

1.5 μM

500 ng

3 μM

≥1 μg

5 μM

1-2  Input Total RNA量与MGI®接头使用浓度推荐表*

Input Total RNA

MGI® Adapter stock concentration

10~99 ng

1 μM

100~499 ng

2 μM

500~4000 ng

5 μM

*可根据不同类型total RNA样本及投入量,按需求适当调整Adapter使用量

3.关于文库扩增 (Library Amplification)

1)本试剂盒中的文库扩增组分由本公司第二代高保真DNA聚合酶所组成,在第一代的基础上,大大增强了扩增的均一性,即使是低拷贝的基因,也能进行无偏好性地扩增。

2)文库扩增步骤需要严格控制扩增循环数。循环数不足,将导致文库产量低;循环数过多,又将导致文库偏好性增加、重复度增加、嵌合产物增加、扩增突变积累等多种不良后果。表2列举了使用本试剂盒进行文库扩增,Input Total RNA 量与相应扩增循环数的推荐。

3)表2中推荐的循环数可满足绝大多数建库需求,若您的样本质量较差(如降解严重的FFPE样本),可根据实际情况适当增加循环数。mRNA建库时请特别注意,由于不同物种和组织所提取的 Total RNA中,mRNA的含量差异较大,实验中需根据建库起始量、物种类型及样本处理情况适当调整扩增循环数。

2 Input Total RNA 量与扩增循环数推荐表*

Input Total RNA

Number of cycles

10 ng

16

100 ng

14

500 ng

11

1 μg

10

【注】:*由于文库产量不仅与投入量和扩增循环数相关,样本质量、片段化条件、分选条件等都会影响产量。建库过程中请根据实际情况综合考虑,选择最合适的建库条件。

4.DNA磁珠纯化与分选 (Bead-based Clean Up and Size Selection)

1)建库过程中有多个步骤需要使用DNA纯化磁珠,我们推荐使用Hieff NGS® DNA Selection Beads (Yeasen Cat#12601)或AMPure® XP磁珠(Beckman Cat#A63880)进行DNA纯化和分选。

2)磁珠使用前应先平衡至室温,否则会导致得率下降、分选效果不佳。

3)磁珠每次使用前都应充分振荡混匀或使用移液器上下吹打充分混匀。

4)转移上清时,请勿吸取磁珠,即使微量残留都将影响后续文库质量。

5)磁珠洗涤使用的80%乙醇应现用现配,否则将影响回收效率。

6)产物洗脱前应将磁珠置于室温干燥。干燥不充分容易造成无水乙醇残留影响后续反应;过分干燥又会导致磁珠开裂进而降低纯化得率。通常情况下,室温干燥3-5 min足以让磁珠充分干燥。

7)DNA纯化或长度分选产物如需保存,可使用0.1×TE Buffer洗脱,产物于4℃可保存2天,-20℃可保存1个月。

5.关于文库质检 (Library Quality Analysis)

1)通常情况下,构建好的文库可通过长度分布检测和浓度检测来进行质量评价。

2)文库浓度检测可使用:基于双链DNA荧光染料的方法,如Qubit®、PicoGreen®等;基于qPCR绝对定量的方法。

3)推荐使用qPCR方法进行文库浓度检测:Qubit®等基于双链DNA荧光染料的浓度测定方法时,无法有效区分单端连接Adapter的产物、两端均未连接Adapter的产物及其他不完整双链结构产物;qPCR绝对定量基于PCR扩增原理,仅定量样品中两端Adapter完整的文库(即可测序的文库),可排除单端或双端都不连接Adapter的不可测序文库的干扰。

4)文库浓度检测不可使用:基于光谱检测的方法,如NanoDrop®等。

5)文库长度分布检测,可通过Agilent Bioanalyzer 2100等基于毛细管电泳或微控流原理的设备进行检测。

6.自备材料 (Other Material)

1)mRNA富集试剂盒:Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit V2 (Yeasen Cat#12629)。

2)rRNA去除试剂盒:Hieff NGS® MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS)(Yeasen Cat#12257)或其他rRNA去除试剂盒。

3)RNA纯化磁珠: Hieff NGS® RNA Cleaner (Yeasen Cat#12602)或其他等效产品。

4)DNA纯化磁珠:Hieff NGS® DNA Selection Beads (Yeasen Cat#12601)或AMPure® XP Beads (A63880)或其他等效产品。

5)RNA质控:Agilent 2100 Bioanalyzer RNA 6000 Nano/Pico Chip或其他等效产品。

6)Adapters:Complete Adapter for Illumina®使用(Cat#13519-13520或其他等效产品)或Complete Adapter for MGI®使用(Cat#13360-13362或其他等效产品)。

7. 文库质检

Agilent 2100 Bioanalyzer DNA 1000 Chip/ High Sensitivity Chip或其他等效产品;文库定量试剂。

8. 其他材料

无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

建库流程图

1:RNA建库流程

 

400-6111-883