NGS,即下一代测序技术,是近年来基因测序领域的一次重大突破。相较于传统的测序方法,NGS具有高通量、高准确性、低成本等诸多优势,使得基因测序变得更加高效和便捷。通过NGS技术,科学家们能够更深入地了解基因组的结构和功能,为疾病诊断、治疗以及新药研发等领域提供了强有力的支持。
酶切法建库:NGS的得力助手
在NGS的研究中,建库是一个至关重要的环节。建库的质量直接影响到测序结果的准确性和可靠性。而酶切法建库,避免了传统的机械打断,无需打断仪,流程简便,可同时处理多个样,更适合于自动化建库,满足大规模基因组研究的需求,是目前应用最广泛的建库方法之一。
酶切法建库有其独特的优势,但是也有其劣势,比如:酶切偏好性、引入假阳性、起始量适用范围窄等,翌圣借助ZymeEditor(点击了解更多)酶改造及发酵纯化工艺平台,对酶进行进化改造,及不断优化的反应体系,克服了酶切法建库方法学上的局限性,让酶切法建库更精准更快速!
Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3(Cat#12194)
Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3 是一款可用于Illumina®和MGI®高通量测序平台的新一代酶切法建库试剂盒。本试剂盒将片段化模块与末端修复模块合二为一,极大的降低了建库的时间和成本、连接模块的酶和buffer预混,简化了操作流程,更加适合于自动化建库。
实验原理
图1.酶切法建库原理
产品优势
高效稳定的片段化效果
以不同质量等级的FFPE DNA样本建库,样本投入量100 ng,采用同一酶切条件4℃ 1 min,37℃10 min,72℃ 20 min,4℃ hold,文库主峰在300 bp左右;数据显示不同降解程度的FFPE样本同一酶切条件下,文库主峰基本一致。
FFPE DNA质量等级 |
A |
B |
C |
D |
文库产量(ng) |
2550 |
2470 |
1760 |
1790 |
文库主峰(bp) |
295bp |
301bp |
288bp |
278bp |
图2.FFPE DNA的酶切文库峰图
高效稳定的片段化效果
Human gDNA为模板,以不同的样本投入量,12194与竞品W试剂盒相比,12194的文库产量与竞品相当。数据显示不同投入量文库产量对比,12194有高效的文库转化效率。
极低的假阳性率
NGS建库引入的假阳性问题主要包括嵌合序列和碱基错掺等因素,在酶切法片段化时将会引入一些假的嵌合序列,12194对片段化酶全面升级,解决了酶切假阳性的痛点。
用12194酶法片段化建库试剂盒对3种标准品样本(FFPE标准品、gDNA标准品、ctDNA标准品)建库,并和竞品W进行了头对头的比较。数据显示,无论是FFPE样本、gDNA、还是ctDNA,12194的Soft Clip、false chimeric都低于或近似于竞品W。
图4.12194与竞品W的数据质量对比
优异的位点检出率
用12194和竞品W建库杂交捕获测序对比,模板类型为肿瘤SNV 5% gDNA标准品GW-OGTM006和肿瘤gDNA野生型标准品GW-OGTM005,将突变位点稀释为 0.5% 和0.1%,模板投入量100ng,PCR扩增循环数为7,捕获panel为何因Cancer SLC Panel,平均测序深度为5000×,比较捕获测序数据。数据显示12194对突变位点检出率与目标检出率一致。
图5.12194与竞品W的低频位点检出率
产品订购指南
产品名称 |
产品货号 |
产品规格 |
Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3一步法DNA建库试剂盒V3 |
12194ES08 |
8 T |
12194ES24 |
24 T |
|
12194ES96 |
96 T |
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