pG-Tn5 Transposase (10 U/μL)

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产品说明书

FAQ

COA

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产品简介

 

Tn5转座酶特异性识别转座子两端反向重复的ME序列(Mosaic End),形成转座复合体后随机的将转座子插入靶DNA中。Protein G 偶联转座酶(Protein G-Tn5),即通过将Protein G与改造的超高活性Tn5转座酶融合,形成兼具双重活性的新型融合酶(pG-Tn5 Transposase),可在抗体引导下精准靶向切割目的蛋白附近的DNA序列,适用于CUT&Tag (Cleavage Under Targets and Tagmentation)技术。CUT&Tag是替换传统的ChIP-Seq用以研究蛋白质-基因组互作的新技术,与后者相比,它具有显著优势,如:信噪比高,可重复性好,实验周期短(1天实现从细胞到文库构建),细胞投入量低等,该方法适用于表观遗传学、肿瘤、干细胞等研究领域。

 

组分信息

 

组分编号

组分名称

14530ES60

14530ES76

14530-A

pG-Tn5 Transposase (10 U/μL)

10 μL

50 μL

14530-B

Assemble Buffer

100 μL

500 μL

14530-C

5×Tagment buffer

500 μL

3×1 mL

14530-D

6×Terminate Solution

500 μL

3×1 mL

14530-E

Annealing Buffer

500 μL

3×1 mL

 

储存条件

 

pG-Tn5 Transposase于-85~-65℃保存,其余组分可于-25~-15℃保存,有效期1年。

 

注意事项

 

1. 转座酶对温度敏感,建议尽快完成接头包埋,生成的转座子可于-25~-15℃保存,有效期1年。

2. 本产品仅作科研用途

3. 为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。

 

使用说明

 

以高通量测序建库为例,在使用前,请务必仔细阅读使用说明。

  1. 接头制备

1)Illumina平台参考引物名称及序列:

 Primer A:5'-phos-CTGTCTCTTATACACATCT-NH2-3'

 Primer B:5′-TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAG-3′

 Primer C:5′-GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAG-3′

2)使用Annealing Buffer溶解Primer APrimer BPrimer C100 μM

3) 分别配制如下反应体系:

组分

反应1

Primer A(100 μM)

10 μL

Primer B100 μM)

10 μL

total

20 μL

 

组分

反应2

Primer A(100 μM)

10 μL

Primer C100 μM)

10 μL

total

20 μL

4)分别将反应1和反应2涡旋振荡充分混匀,并短暂离心使溶液回到管底。置于PCR仪内,进行如下反应程序:热盖105℃ On,94℃加热2 min。时间到后,停止反应程序,不要打开热盖,让PCR管在PCR仪器中自然冷却2 h,然后再于4℃中放置5 min。

5)反应结束后,将反应1和反应2等体积混合,混匀。命名为Adapter Mix,-25~-15℃保存。

 

2.转座子生成

1) 配置以下反应体系:

组分

体积(μL

pG-Tn5 Transposase (10 U/μL)

2

Adapter mix (25 μM)*

1.6

Assemble Buffer

Up to 20

2)反应条件:使用移液器轻轻吹打充分混匀。置于25℃反应1 h(热盖关闭)。反应产物命名为pG-Tn5 Mix,可直接应用于建库实验,或-25~-15℃保存。

 

3. DNA片段化测试

1)配置以下反应体系:

组分

体积(μL

Input DNA (50 ng/μL)

X*

5×Tagment buffer

4

pG-Tn5 Mix

1**

ddH2O

Up to 20

*DNA 使用量越大,片段化产物平均长度越长;反之,片段化产物平均长度越短。

**如需提高打断程度,可提高pA-Tn5 Mix使用量;反之,可减少酶使用量。

2)片段化反应程序

轻轻吹打或振荡混匀,短暂离心。按照下表所示反应程序,进行片段化反应。

温度

时间

热盖105℃

On

55°C

10 min

4°C

Hold

3)DNA片段化终止

配置以下反应体系,在上述片段化产物中添加下表中各反应组分,使用移液器轻轻吹打20次混匀。

组分

体积(μL

片段化产物

20

6×Terminate Solution

4

Total

24

按照下表所示反应程序,进行终止反应。

温度

时间

热盖105℃

On

55°C

10 min

4°C

Hold

待样品温度降到4°C后,取出PCR管,进行片段化产物纯化,可以选择1.2×磁珠纯化,推荐使用Hieff NGS® DNA Selection Beads(Cat#12601ES),最终使用21 μL ddH2O洗脱片段化产物。请勿使用TE等含金属离子络合剂的缓冲液洗脱片段化产物!

4)片段化产物质量控制

a. 使用 Qubit 进行浓度测定。

b. 使用 Agilent Technologies 2100 Bioanalyzer 进行长度分布检测。

5)片段化产物扩增

可根据具体的实验目的与测序平台选择合适的试剂进行扩增实验。

 

Ver.CN20241230

400-6111-883