Nanobody-Tn5主要是将纳米抗体与Tn5转座酶进行融合,制备出可结合两种不同物种(小鼠和兔)一抗的anti-mouse Tn5和anti-rabbit Tn5。这两种nanobody-Tn5中包埋含不同index的接头序列时,Tn5切割染色质即可将接头插入到染色质中,通过不同的index来区分来源于mouse的一抗靶向区域还是来源于rabbit一抗靶向的区域。该产品为裸酶,需要自己组装接头序列。
组分信息
组分编号 |
组分名称 |
12595ES01 |
12595ES02 |
12595ES03 |
12595-A |
Anti-mouse Tn5 |
10 μL |
80 μL |
100 μL |
12595-B |
Anti-rabbit Tn5 |
10 μL |
80 μL |
100 μL |
12595-C |
Assemble buffer |
10 μL |
80 μL |
100 μL |
储存条件
-85~-65℃保存,有效期1年。
使用说明
以高通量测序建库为例,在使用前,请务必仔细阅读使用说明。
1)Illumina平台参考引物名称及序列:
Primer A-1:5'-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACATAAGGCTCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAG-3' Primer A-2:5'-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACATATCCTTCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAG-3'
Primer A-3:5′-TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAG-3′
Primer B:5′-GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAG-3′
Primer C:5'-phos-CTGTCTCTTATACACATCT-3'
2)将Primer A、Primer B、Primer C溶解至200 μM。
3) 分别配制如下反应体系:
组分 |
反应1 |
Primer B(200 μM) |
10 μL |
Primer C(200 μM) |
10 μL |
total |
20 μL |
组分 |
反应2 |
Primer A-1 or A-2 or A-3(200 μM) |
10 μL |
Primer C(200 μM) |
10 μL |
total |
20 μL |
4)分别将反应1和反应2涡旋振荡充分混匀,并短暂离心使溶液回到管底。置于PCR仪内,进行如下反应程序:热盖105℃ On,94℃加热2 min。时间到后,停止反应程序,不要打开热盖,让PCR管在PCR仪器中自然冷却2 h,然后再于4℃中放置5 min。
5)反应结束后,将反应1和反应2等体积混合,混匀。命名为Adapter Mix,-25~-15℃保存。
2.转座子生成
1) 配置以下反应体系:
组分 |
体积(μL) |
Anti-mouse Tn5 or Anti-rabbit Tn5 |
10 |
Adapter mix (50 μM) |
0.5 |
Assemble Buffer |
0.5 |
2)反应条件:使用移液器轻轻吹打充分混匀。置于25℃反应1 h(热盖关闭)。反应产物可直接应用于建库实验,或-25~-15℃保存。
注意事项
1. 转座酶对温度敏感,建议尽快完成接头包埋,生成的转座子可于-25~-15℃保存,有效期1年。
2. 本产品仅作科研用途。
3. 为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。
Ver.CN20231008