Hieff ® Smearase 是针对高通量测序平台设计的新一代酶切试剂。本品采用高质量的片段化酶,酶切效果稳定,偏好性低,可有效降低片段化的时间和成本,摆脱了繁琐的超声步骤,让片段化过程变得更加简单高效。
高质量的片段化酶,酶切效果稳定,偏好性低,可有效降低片段化的时间和成本
Hieff® Smearase 酶切200ng Human gDNA 样本(不同酶切时间片段化效果检测)
-25~-15℃保存,有效期18个月。
Q:12204ES、12907ES 和 12609ES 区别与联系?
A:12204 为完整的建库试剂盒,包含片段化模块,连接模块,扩增模块。12609 为片段化模块,可同时进行样本的片段化,末端修复/加A流程。12907 为单酶(原料酶),仅用于DNA 片段化。
Q:12907里面的酶是什么酶?能否作用于RNA?产生的片段末端是平末端还是黏性末端?
A:是一些随机内切酶,作用于dsDNA,产生的末端是黏性末端。
Q:产品使用时能否用单酶搭配机械法流程建库试剂盒,如 12907+12199?
A:可以。实际使用时我们建议购买完整试剂盒(Cat#12204),该试剂盒经过流程的优化可获得优异的建库表现。如果想要购买 12907 搭配其他品牌建库试剂盒,建议片段化之后先进行纯化再接其他品牌建库试剂盒。
Q:酶切模块可否适用 MGI 平台?
A:片段化酶切模块 12907可通用于各类平台
Q:gDNA 片段化参考说明书酶切条件酶切 20 min,竟然切不动?
A:一般优先考虑 DNA 的质量问题,比如 Input DNA 中引入高浓度金属离子螯合剂或其他盐离子,可能会影响酶切效果,建议将DNA 稀释在 ddH2O 或不含EDTA 的 10 mM Tris Buffer (pH 7.5-8.0)中再进行片段化。其次,如果样本是反转录得到的全长cDNA,则需考虑样本纯度问题。另外,对于环状DNA 的酶切,需要另行摸索酶切时间体系。特殊样本可考虑磁珠纯化之后进行酶切或适当延长酶切时间。
Q:酶切时间也不长,竟然过度酶切了?
A:以插入片段 300 bp 为例,白细胞 gDNA,30 度酶切 10min,出现如下图过度酶切现象。建议参考酶切条件需要考虑不同样本gDNA 大小,如白细胞gDNA 较小,应适当缩短酶切时间,否则易出现过度酶切现象。
Q:最低可以切到多小片段?
A:有小片段保护机制,最低可到150bp左右。
[1] Zhang S, Pei Z, Lei C, et al. Detection of cryptic balanced chromosomal rearrangements using high-resolution optical genome mapping [published online ahead of print, 2022 Jun 16]. J Med Genet. 2022;jmedgenet-2022-108553. doi:10.1136/jmedgenet-2022-108553(IF:6.318)
[2] Ren J, Zhang R, Pan C, et al. Prevalence and genotype-phenotype correlations of GBA-related Parkinson disease in a large Chinese cohort. Eur J Neurol. 2022;29(4):1017-1024. doi:10.1111/ene.15230(IF:6.089)