Tn5转座酶特异性识别转座子两端反向重复的ME序列(Mosaic End),形成转座复合体后随机的将转座子插入靶DNA中。 Protein A 偶联转座酶(Protein A-Tn5) , 即通过将Protein A与改造的超高活性Tn5转座酶融合,形成兼具双重活性的新型融合酶(pA-Tn5Transposase),可在抗体引导下精准靶向切割目的蛋白附近的DNA序列,适用于CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)技术。CUT&Tag是替换传统的ChIP-Seq用以研究蛋白质-基因组互作的新技术,与后者相比,它具有显著优势,如:信噪比高,可重复性好,实验周期短(1天实现从细胞到文库构建),细胞投入量低等,该方法适用于表观遗传学、肿瘤、干细胞等研究领域。
产品组分
组分编号 |
组分名称 |
产品编号/规格 |
||
14529ES03 |
14529ES20 |
14529ES50 |
||
14529 |
pA-Tn5 Transposase (10 U/μL, without buffer) |
1 mL |
20 mL |
50 mL |
【注】:5×Tagment Buffer L含Mg2+,用于测试制备的转座子片段化DNA的效果,而非CUT&Tag工作Buffer。
产品应用
高通量建库;CUT&Tag;
运输与保存方法
干冰运输。-85~-65℃保存,有效期1年。
注意事项
1. 转座酶对温度敏感,请在接收货物后建议尽快完成接头包埋,生成的转座子可以放置于-20℃保存。
2. 为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。
3. 本产品仅做科研用途!
使用方法
以高通量测序建库为例,在使用前,请务必仔细阅读使用说明。
1. 转座子生成
1.1 配置以下反应体系
表1. 转座子反应体系
组分 |
体积(μL) |
pA-Tn5 Transposase (10 U/μL, without buffer) |
2 |
Adapter mix (100 μM) |
0.4 |
Assemble Buffer |
Up to 20 |
注:Adapter mix根据实验目的以及测序平台,自备。
1.2 反应条件
使用移液器轻轻吹打充分混匀。置于25℃反应1 h(热盖关闭)。反应产物命名为pA-Tn5 Mix,可直接应用于建库实验,或-20℃保存。
2. DNA片段化测试
2.1 配置以下反应体系
表2. 片段化反应体系
组分 |
体积(μL) |
Input DNA (50 ng/μL) |
X |
5×Tagment buffer |
4 |
pA-Tn5 Mix |
1 |
ddH2O |
To 20 |
【注】:*DNA 使用量越大,片段化产物平均长度越长;反之,片段化产物平均长度越短。
**如需提高打断程度,可提高pA-Tn5 Mix使用量;反之,可减少酶使用量。
2.2 片段化反应程序
轻轻吹打或振荡混匀,短暂离心。将上述PCR管置于PCR仪,按照表3所示反应程序,进行片段化反应。
表3. 片段化反应程序
温度 |
时间 |
热盖105℃ |
On |
55°C |
10 min |
4°C |
Hold |
2.3 DNA片段化终止
配置以下反应体系,在上述片段化产物中添加表4中各反应组分,使用移液器轻轻吹打20次混匀。
表4. DNA片段化终止体系
名称 |
体积(μL) |
片段化产物 |
20 |
6×Terminate Solution |
4 |
Total |
24 |
设置以下反应程序:
表5. DNA片段化终止程序
温度 |
时间 |
热盖105℃ |
On |
55°C |
10 min |
4°C |
Hold |
待样品温度降到4°C后,取出PCR管,进行片段化产物纯化,可使用21 μL ddH2O 进行洗脱。
2.4. 片段化产物质量控制
a) 使用 Qubit 进行浓度测定;
b) 使用 Agilent Technologies 2100 Bioanalyzer 进行长度分布检测。
2.5 片段化产物扩增
可根据具体的实验目的与测序平台选择合适的试剂进行扩增实验。
HB221210