Hieff NGS® RNA 384 CDI Primer for Illumina®

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产品说明书

FAQ

COA

已发表文献

Hieff NGS® RNA 384 CDI Primer for Illumina®Illumina®高通量测序平台RNA文库构建专用接头引物试剂盒,共分为2个Set,每个Set包含二代测序建库中使用的PE adapter以及 8种i5 Index Primer和12种i7 Index Primer。 2个Set共提供16种i5 Index Primer和24种i7 Index Primer,配合 Yeasen出品的RNA建库试剂盒使用可构建多达384种不同组合的双端index标记的文库。试剂盒中提供的所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,最大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。


产品组分

编号

名称

规格

12414ES02

PE Adapter

320 μL

RP 501-508

60 μL each

RP 701-712

40 μL each

12415ES02

PE Adapter

320 μL

RP 509-516

60 μL each

RP 713-724

40 μL each


运输与保存方法

冰袋运输。

所有组分-20°C保存,有效期18个月。


注意事项

1)本试剂盒中PE Adapter的浓度为15 μM,单个文库构建的接头使用量根据所用建库试剂盒的推荐用量进行调整。 Index Primer的浓度为10 μM

2)本试剂盒提供的PE Adapter为通用型短接头,需要通过PCR扩增获得完整的文库。Index Primer提供Barcode序列标签,用于高通量测序时区分样品。

3)本试剂盒每个Set包含8种i5 Index Primer (RP 5xx)12种i7 Index Primer (RP 7xx)互相组合可以构建96种不同组合的双端Index标记文库。2个Set共提供16种i5 Index Primer和24种i7 Index Primer。您可以使用Cat#12414中的i5 Index Primer(或i7 Index Primer)与Cat#12415中的i7 Index Primer(或i5 Index Primer)组合用以构建多达384种不同组合的双端Index标记文库。

4)切勿加热接头,应在室温让其缓慢溶解,实验室温度最好设置为20-25℃。接头避免反复冻融,建议分装保存,可短暂存放于4℃。

5)使用Hieff NGS® RNA 384 CDI Primer for Illumina®试剂盒构建的测序文库结构如下:

  图片.png

6)为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
7)本产品仅作科研用途!


使用方法

1. 接头的使用:参照所用建库说明书中对不同投入量的推荐用量稀释至合适浓度使用。

2. Index Primer的使用:按照建库说明书中文库扩增体系配制反应体系(如下表),反应程序按照建库说明书中程序进行设置。

组分名称

体积(μL)

2× High Fidelity DNA PCR Mix

25

RP 5xx

2.5

RP 7xx

2.5

Adapter Ligated DNA

20

Total

50

 

序列信息

PE Adapter for Illumina:

5´-/5Phos/ GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT*C -3´

5´-ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATC*T-3´

i5 Index Primer for Illumina:

5´-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC[i5 Index]ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT -3´

i7 Index Primer for Illumina:

5´-CAAGCAGAAGACGGCATACGAGAT[i7 Index]GTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATC-3´

[i5 Index]表示8 bp 的i5 Index序列,[i7 Index]表示8 bp 的i7 Index序列,各引物对应的Index名称、引物中包含的Index序列以及测序时对应的Index序列信息如下表所示:

 

I5 Index Primers

引物中的序列

Sample Sheet输入/测序时Index序列

NovaSeq 6000 v1.0 reagents, MiSeq, HiSeq 2000/2500

NovaSeq 6000 v1.5 reagents

MiniSeq, NextSeq,
HiSeq 3000/4000

RP501

TATAGCCT

TATAGCCT

AGGCTATA

RP502

ATAGAGGC

ATAGAGGC

GCCTCTAT

RP503

CCTATCCT

CCTATCCT

AGGATAGG

RP504

GGCTCTGA

GGCTCTGA

TCAGAGCC

RP505

AGGCGAAG

AGGCGAAG

CTTCGCCT

RP506

TAATCTTA

TAATCTTA

TAAGATTA

RP507

CAGGACGT

CAGGACGT

ACGTCCTG

RP508

GTACTGAC

GTACTGAC

GTCAGTAC

RP509

GACCTGTA

GACCTGTA

TACAGGTC

RP510

ATGTAACT

ATGTAACT

AGTTACAT

RP511

GTTTCAGA

GTTTCAGA

TCTGAAAC

RP512

CACAGGAT

CACAGGAT

ATCCTGTG

RP513

TAGCTGCC

TAGCTGCC

GGCAGCTA

RP514

AGCGAATG

AGCGAATG

CATTCGCT

RP515

TATGCTGC

TATGCTGC

GCAGCATA

RP516

AGAAGACT

AGAAGACT

AGTCTTCT

 

 

 

I7 Index Primers

引物中的序列

Sample Sheet输入/测序时Index序列

RP701

CGAGTAAT

ATTACTCG

RP702

TCTCCGGA

TCCGGAGA

RP703

AATGAGCG

CGCTCATT

RP704

GGAATCTC

GAGATTCC

RP705

TTCTGAAT

ATTCAGAA

RP706

ACGAATTC

GAATTCGT

RP707

AGCTTCAG

CTGAAGCT

RP708

GCGCATTA

TAATGCGC

RP709

CATAGCCG

CGGCTATG

RP710

TTCGCGGA

TCCGCGAA

RP711

GCGCGAGA

TCTCGCGC

RP712

CTATCGCT

AGCGATAG

RP713

CCTACACG

CGTGTAGG

RP714

GTAGTGTC

GACACTAC

RP715

TGTATGCA

TGCATACA

RP716

CCAGACTG

CAGTCTGG

RP717

AGGTGCCA

TGGCACCT

RP718

TCACCTTG

CAAGGTGA

RP719

GTATCTTT

AAAGATAC

RP720

CAGCTCCA

TGGAGCTG

RP721

TCGCCTTA

TAAGGCGA

RP722

CTAGTACG

CGTACTAG

RP723

AGCGTAGC

GCTACGCT

RP724

GAGCCTCG

CGAGGCTC

 

HB210118

400-6111-883