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cfDNA的特征及提取方法

16374

2026-03-11

cfDNA (cell-free DNA,游离DNA)是指存在于血液、尿液、脑脊液等体液中,游离于细胞之外的高度片段化DNA。这些DNA片段长度通常在150-200个碱基对左右,主要来源于细胞凋亡或坏死过程中释放的DNA 。如果按来源分,可以分为以下几种类型:

  1. 正常细胞来源 cfDNA,健康人主要是造血细胞凋亡、坏死释放的短片段 DNA。
  2. 胎儿游离 DNA(cffDNA),孕妇血浆中来自胎盘 / 胎儿的 DNA,用于无创产前筛查(NIPT)。
  3. 肿瘤来源游离 DNA(ctDNA),肿瘤细胞释放,含突变、甲基化异常,是液体活检核心。
  4. 移植物来源 cfDNA(donor-derived cfDNA),器官移植后供体器官释放,用于排异监测。
  5. 微生物来源 cfDNA,血浆 / 体液中的细菌、病毒 DNA,用于感染诊断。

一、cfDNA核心特征

1. 短片段

  • 健康人血浆:以167bp单核小体峰为主,伴随320bp(双核小体)、480bp(三核小体)等多倍体峰,呈典型“梯状”分布。
  • 肿瘤患者:片段整体更短,短片段(<150bp)比例显著升高,ctDNA富集于短片段区域。
  • 超短片段:存在40–70bp的超短cfDNA,常规双链建库易丢失。

2. 极低的浓度与短半衰期

  • 浓度:健康人血浆中约1–10 ng/mL;肿瘤患者可升高数倍至数十倍。
  • 半衰期:采集的血浆容易被酶降解和溶血,所以采血后需快速处理,或者在采血管中保存一周内。

3. 其他关键特征

  • 结构:以线性双链为主,含少量单链、环状及环状双链DNA(线粒体DNA)。
  • 表观修饰:携带甲基化、羟甲基化等表观信息,可用于溯源与分型。
  • 易污染:极易被血细胞破裂释放的基因组DNA(gDNA,>10kb)污染,严重干扰检测。

图 在一定的环境作用下,DNA和磁珠特异性结合后,磁珠被磁力架吸附到一侧

• 优势:

  • 回收率高,对短片段(<150bp)捕获能力强。
  • 兼容自动化提取仪,适合高通量临床样本。
  • 无需离心,操作简便,减少gDNA污染风险。

cfDNA提取产品选品指南

货号

品名

备注

18382ES

MolPure® Magnetic Circulating Cell-FreeDNA Kit

血浆、血清游离 DNA 提取试剂盒(磁珠法)

适用于从0.3-4 mL的血浆、血清样本中的提取游离DNA

18383ES

MolPure® Magnetic Circulating Cell-Free DNA Kit (KF Prepackaged)

血浆、血清游离DNA提取试剂盒(KF预装版)(磁珠法)

适用于从4 mL的血浆、血清样本中的提取游离DNA,

适配奥盛24通道大体积提取仪或Kingfisher提取仪

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