本产品适用于多重PCR实验,采用两轮PCR多重扩增进行扩增子建库的试剂盒,适用于 DNA&RNA病原微生物共检测。本试剂盒以超多重PCR为基础,结合热启动技术并匹配最优的缓冲,可实现Panel重数为1 ~ 2000重扩增pannel。本产品兼容逆转录体系,扩增子GC含量可以将覆盖25-75%的范围。具备高均一性、高特异性和高灵敏度的特点。本试剂适用于30~500对不同大小片段的多重扩增,也可用于进行数千重及以上扩增子的捕获。
产品编号 |
组分名称 |
12948ES24 |
12948ES48 |
12948ES96 |
12948ES98 |
12948 |
4X 多重PCR预混液 |
180 μL |
360 μL |
720 μL |
7.5 mL |
-15~-25℃保存,有效期2年。
A.反应体系
组分 |
体积(μL) |
终浓度 |
4×多重PCR预混液 |
7.5 |
1× |
Primer mix |
x |
0.1 μM-0.5 μM |
模板 DNA |
- |
1 ng -400 ng |
无菌超纯水 |
up to 30 |
- |
【注】: 1)上表中DNA量和引物浓度均为推荐用量和浓度,可根据具体实验情况进行调整最适浓度。
2)参考建议:每条引物的浓度可在0.1 μM-0.5 μM范围内进行调整。
3)预混液中已经包含扩增所需要的酶、dNTP、盐离子等,无需额外添加。
B.一轮扩增反应程序
循环步骤 |
温度(℃) |
时间 |
循环数 |
热盖 |
105℃ |
On |
|
预变性 |
95℃ |
3 min |
1 |
变性 |
95℃ |
30 sec |
|
退火 |
60℃ |
1 min |
|
延伸 |
72℃ |
1 min |
|
终延伸 |
72℃ |
3 min |
|
暂存 |
4℃ |
- |
1 |
【注】:★ 较低模板投入量可以提高循环数。
C.一轮PCR产物0.9×纯化
1) 准备工作:将Hieff NGS® DNA Selection Beads 磁珠由冰箱中取出,室温平衡至少30 min,配制80%乙醇。
2) 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。
3) 吸取 27 μL Hieff NGS® DNA Selection Beads(0.9×,Beads:DNA=0.9:1)至一轮PCR产物中,室温孵育5 min。
4) 将 PCR 管短暂离心并置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约 5 min),小心移除上清。
5) 保持PCR管始终置于磁力架中,加入200 μL 新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec后,小心移除上清。
6) 重复步骤5,总计漂洗两次。
7) 保持PCR管始终置于磁力架中,开盖空气干燥磁珠至刚刚出现龟裂(不超过5min)。
8) 直接加入11 μL ddH2O,将PCR 管从磁力架中取出,涡旋振荡或使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。进入下一步反应。
A.反应体系
组分 |
体积(μL) |
终浓度 |
4×多重PCR预混液 |
7.5 |
1× |
Primer Index mix |
6 pmol |
- |
一轮纯化产物(带磁珠) |
11 |
- |
无菌超纯水 |
x |
- |
总体积 |
up to 30 |
|
循环步骤 |
温度(℃) |
时间 |
循环数 |
热盖 |
105℃ |
On |
|
预变性 |
95℃ |
3 min |
1 |
变性 |
95℃ |
30 sec |
x |
退火延伸 |
60℃ |
30 sec |
|
终延伸 |
72℃ |
3 min |
|
暂存 |
4℃ |
- |
1 |
【注】:
1)请根据多重扩增引物对数调整退火时间,Panel引物重数较多时可增加退火时间。
2)针对模板含量较低的样本,可通过增加循环数提高扩增产出。
模板量 |
20 ng |
50 ng |
100 ng |
200 ng |
循环数 |
8 cycles |
7 cycles |
6 cycles |
5 cycles |
【注】:
上表是基于10 ng gDNA进行的一轮及二轮循环数的推荐;当投入量大于10 ng,二轮的相应的循环数可以减少;当投入量小于10 ng,一、二轮的相应的循环数要相应的增加。
D.二轮PCR产物0.9×纯化
1) 准备工作:将Hieff NGS® DNA Selection Beads 磁珠由冰箱中取出,室温平衡至少 30 min,配制 80%乙醇。
2) 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。
3) 吸取27 μL Hieff NGS® DNA Selection Beads(0.9×,Beads:DNA=0.9:1)至一轮 PCR 产物中,室温孵育 5 min。
4) 将PCR管短暂离心并置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约 5 min),小心移除上清。
5) 保持PCR 管始终置于磁力架中,加入200 μL 新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育30 sec 后,小心移除上清。
6) 重复步骤5,总计漂洗两次。
7) 磁珠晾干后,将PCR管从磁力架上取下,加入30 μL Nuclease-free ddH2O覆盖磁珠,使用移液器吹打混匀。室温孵育2 min。如果磁珠干燥开裂,适当延长孵育时间。
8)将PCR管短暂离心收集后置于磁力架中,分离磁珠和液体直到溶液澄清(约5 min)。 小心吸取25 μL上清转移至新的EP管中,继续进行下一步反应。
Ver.CN20240909