直播预告 | 表观领域重磅突破，探秘黑科技“ARTR-seq”，锁定翌圣直播间！
ARTR-seq（Assay of RT-based RBP binding site sequencing）是芝加哥大学何川教授团队于2024年1月在Nature Methods发表的一种新型RNA结合蛋白（RBP）靶点检测技术。该技术通过抗体引导的原位逆转录策略，直接捕获RBP结合的RNA位点，避免了传统CLIP-seq方法中繁琐的紫外交联和免疫沉淀步骤。
L革命性的灵敏度与样本效率
输入量降低3-5个数量级：相比传统CLIP-seq需数百万细胞，ARTR-seq实现20个细胞级检测。
有效数据率高：>70%的测序reads为有效信号，文库复杂度显著高于iCLIP、eCLIP等方法。
重复性优异：生物学间相关性R≥0.98。
|
传统CLIP-seq |
ARTR-seq |
|
紫外交联（254 nm UV） |
无需交联 |
|
免疫沉淀（IP） |
原位抗体引导，跳过IP |
|
放射性标记验证 |
生物素标记+链霉亲和素富集 |
|
多步骤纯化 |
流程精简，耗时显著缩短 |
随机引物策略：采用10N随机引物而非oligo(dT)，无偏捕获polyA和非polyA RNA；
区室无差别检测：同步分析细胞核与胞质中的RBP-RNA互作；
覆盖全面：对内嵌子、外显子、3'UTR等区域均有高效检测，PTBP1实验中>80% peaks定位于内含子
ARTR-seq通过原位逆转录的创新策略，在灵敏度（20个细胞）、效率（无交联/IP）、全面性（非polyA RNA兼容）和时空分辨率（动态捕获+成像联用）四个维度实现了对RBP靶点解析技术的重大突破。其核心价值在于将经典RBP研究从"批量检测"推向"微量动态"时代，为发育生物学、神经科学、临床病理等领域的RBP功能研究提供了革命性工具。其技术优势使其成为当前RBP-RNA互作研究的首选方法之一。
11月26日晚19:00，翌圣生物直播间将迎来一场技术盛宴——复旦大学肖雨博士将给我们重点解析 ARTR-seq 技术在 RNA 结合蛋白靶点鉴定中的创新应用，为从事基因调控与转录组学研究的科研人员开辟新的技术路径！
探索表观遗传学的奥秘，翌圣生物提供全面的解决方案。我们精心研发的甲基化转化试剂和甲基化建库试剂，确保您在研究DNA甲基化模式时的精确性和可靠性。此外，翌圣的ATAC-seq和CUT-Tag技术，为解析复杂基因调控网络提供了强有力的工具。无论是基础研究还是临床应用，翌圣的表观遗传学原料都是您科研路上的坚实伙伴。选择翌圣，选择科学前沿。
我们欢迎您前来交流探讨~期待在直播间与您相见！
