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WB实验指南!蛋白提取操作指南及注意事项!建议先收藏!

蛋白免疫印迹(Western Blot,WB)是一种常用于蛋白质分析的技术手段,其核心流程包括通过聚丙烯酰胺凝胶电泳对蛋白样品进行分离,随后将蛋白转移至固相膜上,并利用特异性抗体(通常为一抗与二抗的复合物)对目标蛋白进行检测。该方法因其高灵敏度和良好的特异性,已成为生命科学研究中应用最广泛的蛋白检测技术之一。在WB实验中,蛋白样品的制备是至关重要的第一步,其质量直接影响后续实验的可靠性和重复性。

 

蛋白提取的核心在于最大限度地保持目标蛋白的完整性,防止其在提取过程中发生降解。因此,整个操作应在低温条件下进行,并尽量缩短处理时间。此外,针对不同来源的样本(如组织或细胞),需根据其特性选择合适的裂解液和提取方法。

 

在进行蛋白提取前,研究人员应对目标蛋白的基本信息有充分了解,包括其表达水平、亚细胞定位、分子量范围,以及是否存在可变剪接或翻译后修饰等。这些信息不仅有助于优化蛋白提取策略,还能为后续选择内参蛋白、调整电泳和转膜条件提供依据。

 

常用裂解液介绍

选择合适的裂解液也是蛋白提取过程中的一个关键步骤。裂解液通常包含缓冲系统、盐离子、表面活性剂和蛋白酶抑制剂等组分,它们各自发挥着不同的作用,共同影响着蛋白提取的效果。因此,在选择裂解液时,我们需要根据目标蛋白的特性以及实验需求进行综合考虑。

 

货号

名称

主要用途

有效裂解成分

裂解强度

提取膜

蛋白

提取

胞浆蛋白

提取

核蛋白

含蛋白酶

抑制剂

含磷酸酶

抑制剂

20101ES

RIPA裂解液(强)

WB/IP

1% Triton X-100,

1% Sodium Deoxycholate,

0.1% SDS

很好

很好

很好

20114ES

RIPA裂解液(弱)

WB/IP/Co-IP

1% NP-40,

0.25% Sodium

Deoxycholate

温和

一般

很好

较好

20115ES

RIPA裂解液(中)

WB/IP

1% NP-40,0.5% Sodium

Deoxycholate,

0.1% SDS

较好

很好

较好

20118ES

免疫印迹及免疫沉淀用

WB/IP)裂解液

WB/IP/Co-IP

1% Triton X-100

温和

一般

很好

较好

20119ES

免疫印迹及免疫沉淀用

WB/IP)裂解液(无抑制剂)

WB/IP/Co-IP

1% Triton X-100

温和

一般

很好

较好

20120ES

RIPA裂解液(强,无抑制剂)

WB/IP

1% Triton X-100,

1% Sodium Deoxycholate,

0.1% SDS

很好

很好

很好

20131ES

植物蛋白提取试剂盒

植物WB/IP

1% Triton X-100,

1% Sodium Deoxycholate,

0.1% SDS

很好

很好

很好

20103ES

NP-40(Nonidet P 40)

WB/IP/Co-IP

NP-40纯品,

可根据需要配置成1%

的NP-40裂解液

或购买成品裂解液

(Cat#20121ES),

裂解强度温和

一般

很好

较好

/

/

20106ES

SDS

WB

SDS纯品,可根据需要配置成

1%的SDS裂解液,

裂解强度强

很好

很好

很好

/

/

 

特定用途(如质谱检测,需避免AEBSF导致的质谱峰漂移。NO检测,需避免蛋白酶和磷酸酶抑制剂的影响)需要自行添加特定抑制剂或不需要添加抑制剂时,可以考虑选购20119ES或20120ES。

 

常见的裂解液除了其中的有效裂解成分以外,还含有比较复杂的缓冲体系。以常见的RIPA裂解液成分为例:Tris-HCl是常见的缓冲体系之一,为蛋白提供稳定的环境(7.4是接近生理状态的PH值);接近生理状态浓度的NaCl有利于保持蛋白的溶解状态,不会破坏蛋白及蛋白间的相互作用;少量的EDTA可以螯合金属离子抑制蛋白酶活性;SDS是一种裂解能力很强的阴离子表面活性剂,高浓度的SDS会破坏蛋白的天然构象使其变性,溶液中盐离子强度越强,SDS的破坏作用越强;Sodium deoxycholate(脱氧胆酸钠)是一种阴离子表面活性剂,作用较SDS弱;Triton X-100是一种非离子型表面活性剂不会使蛋白变性,也不会破坏蛋白与蛋白之间的相互作用,但可破坏蛋白质与脂质之间的相互作用。

 

常见酶抑制剂介绍

此外,选择裂解液时还需考虑其对膜蛋白、胞浆蛋白和核蛋白的提取效果,以及是否含有蛋白酶抑制剂和磷酸酯酶抑制剂。同时,不同物种的样品兼容性也是选择裂解液时需要考虑的因素。

 

货号

名称

规格

组分

用途

20123ES

蛋白酶抑制剂Cocktail,

EDTA-free,迷你型,片剂

1瓶(10片)/1瓶(50片)

包含AEBSF、Aprotinin、

Bestatin、

E-64、Leupeptin、

Pepstatin A多种成分

哺乳动物细胞或

组织抽提蛋白用

20124ES

蛋白酶抑制剂Cocktail,

EDTA-free,100×DMSO储液

1 mL/10×1 mL/100×1 mL

包含AEBSF、Aprotinin、

Bestatin、

E-64、Leupeptin、

Pepstatin A多种成分

哺乳动物细胞或

组织抽提蛋白用

20134ES

蛋白酶抑制剂Cocktail

(用于真菌或酵母提取),

EDTA-free, 100×DMSO储液

1 mL

包含AEBSF、E-64、

Pepstatin A、

1,10-phenanthroline

真菌或酵母

抽提蛋白用

20135ES

蛋白酶抑制剂Cocktail

(用于His-Tag蛋白纯化),

EDTA-free, 100×DMSO储液

1 mL

包含AEBSF、

Bestatin、E-64、

Pepstatin A、

Phosphoramidon Disodium Salt

His-Tag蛋白裂解及

镍柱纯化用

20136ES

蛋白酶抑制剂Cocktail

(用于植物样本提取),

EDTA-free, 100×DMSO储液

1 mL

包含AEBSF、Bestatin、

E-64、Leupeptin、

Pepstatin A、1,10-Phenanthroline

植物细胞或

组织抽提蛋白用

20137ES

蛋白酶抑制剂Cocktail

(用于细菌提取),100×储液

2 mL

包含AEBSF、

Bestatin、E-64、

Pepstatin A和

单独包装的EDTA

细菌抽提蛋白用

20138ES

蛋白酶抑制剂Cocktail

(质谱兼容),50×储液

2 mL

包含Aprotinin、Bestatin、E-64、

Leupeptin 和

单独包装的EDTA

质谱分析的细胞或

组织样品的蛋白抽提

20109ES

 磷酸酶抑制剂混合物

(100×,储存液)

2 mL/10×2 mL/100×2 mL

A管含有Cantharidin、

Bromotetramisole、

Microcystin-LR。

B管含有Sodium orthovanadate、

Sodium molybdate、

Sodium tartrate、Imidazole 、

Sodium Fluoride。

广谱抑制非特异性的酸性/碱性磷酸酶

以及特异性的蛋白酪氨酸磷酸酶,

丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶(PPA,PP2A)等

20140ES

去乙酰化酶抑制剂 Cocktail

(100× in 70% DMSO)

1 mL

包含Trichostatin A、

EX-527、

Nicotinamide、

Sodium Butyrate

用于保持蛋白质的乙酰化状态。

 

蛋白提取注意事项

01

防止蛋白降解:在蛋白提取过程中,应尽量避免样品暴露于蛋白酶活性较高的温度环境。对于来源于哺乳动物的组织或细胞样本,整个制备流程需在低温条件下进行,以最大限度抑制蛋白酶的活性,防止目标蛋白被降解。

 

组织采集顺序与处理建议:取样时应遵循一定的顺序,优先处理消化腺相关组织(如肝脏、胰腺)及消化道器官(如胃、小肠、大肠),以及富含免疫细胞的组织(如肺)。随后再采集生殖系统组织(如卵巢、子宫、睾丸),最后处理心脏、脾脏、肾脏和脑等器官。若组织不能立即用于实验,应迅速置于液氮中冷冻或转移至−80°C保存。需特别强调的是,尽量使用新鲜组织进行蛋白提取,尤其是消化系统来源的样本,因其在WB检测中通常信号更强、背景更低。若样品经历反复冻融,应弃用,以免影响实验结果。

 

细胞样本处理注意事项:某些细胞系内源性蛋白酶活性较高,提取时应尽量缩短操作时间,并可选用含高浓度SDS的裂解液,以加快裂解过程并抑制酶活性。

胰蛋白酶对膜蛋白提取的影响:若实验目标为膜蛋白,需警惕胰蛋白酶可能引起的蛋白剪切效应。在细胞传代过程中,胰酶处理可能导致膜蛋白被切割,从而在WB中出现非特异性条带或信号缺失。因此,建议最后一次传代时控制细胞密度,给予细胞充分时间恢复膜蛋白表达。收集贴壁细胞时,推荐采用直接裂解后刮取的方式,或先刮取细胞再进行裂解,尽量避免使用胰酶消化步骤。

02

减少杂质干扰:

蛋白提取物中常含有杂质,这些杂质会影响后期电泳分离的效果。为了优化这一步骤,可以采取以下措施:

杂质类型

解决方法

外源蛋白

所有试验器具需洁净;贴壁细胞不用胰蛋白酶消化

核酸(使上清粘稠,蛋白上样困难)

超声或1 mL注射器断裂DNA从而与蛋白分开。或加入全能核酸酶(Cat#20156ES)切断核酸。

油脂

吸取蛋白时应小心避开油脂或先将油脂吸去

盐离子

盐离子浓度过高将导致“微笑”带;相同分子量蛋白条带高低不一可能因为样品中盐离子浓度差别过大。盐离子浓度不宜过高,各样品之间离子浓度应保持一致

03

细胞/组织破碎是蛋白质提取的关键环节,常用的破碎方法包括机械破碎、超声波破碎以及化学溶解等。选择适合的方法对样品进行破碎,并确保破碎效果彻底。
04

总蛋白溶液可用于检测细胞中大多数蛋白的表达情况。若需要分离特定细胞器的特异蛋白,可以选用专门的蛋白分离试剂盒进行处理。
05

使用PMSF等蛋白酶抑制剂时需注意防护,因为这些物质可能对呼吸道、眼睛和皮肤造成损害。
06

提取得到的蛋白样品应及时分装,并长期保存在-80℃环境中,以避免样品反复冻融。

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