Blood Advanced Direct PCR Kit是一款可直接对全血样本进行PCR扩增而无需进行DNA纯化或样本预处理的试剂盒,兼容含EDTA、肝素、柠檬酸盐等常规抗凝剂的新鲜血液、冷藏(冻)血液及Whatman903®和FTA®商用干血渍。试剂盒中含有经过经基因工程改造的DNA Polymerase组合,具有保真性高、对PCR抑制剂耐受性强的特点,2× Hieff® Blood Advanced PCR Buffer中添加强力延伸因子、扩增增强因子以及优化的缓冲体系,能够在快速延伸条件下高效扩增8 kb的基因组片段,对于2 kb以下的片段,设置3-5 sec/kb延伸时间即可完成扩增,从而大幅缩短血液样本的鉴定及检测时间。
Hieff® Advanced High-Fidelity DNA Polymerase Mix的扩增产物的3’端为平末端,适用于一步法快速克隆及TOPO克隆试剂盒(Yeasen CAT# 10907/10908/10909/10910/10911/10912/10922)。
试剂盒中提供的引物预混液Positive control primer mix (10 μM each)能够从哺乳动物和大多数脊椎动物的sox21基因上游保守序列中扩增出长度237 bp的片段,可作为阳性对照使用。
产品组分
编号 |
名称 |
10188ES20 |
10188ES50 |
10188ES60 |
10188ES76 |
10188-A |
2× Hieff® Blood Advanced PCR Buffer |
500 μL |
1.25 mL |
2.5 mL |
12.5 mL |
10188-B |
Hieff® Advanced High-Fidelity DNA Polymerase Mix |
20 μL |
50 μL |
100 μL |
500 μL |
10188-C |
Positive control primer mix (10 μM each) |
100 μL |
100 μL |
200 μL |
500 μL |
10188-D |
10× DNA loading buffer |
1 mL |
1 mL |
1 mL |
1 mL × 5 |
运输与保存方式
干冰运输。-20℃保存,有效期1年。
适用范围
不同类型的全血样本直接PCR反应。
注意事项
1. 推荐血液模板使用量为反应总体积的10%,即50 μL反应体系中加入5 μL全血作为模板,注意避免吸取血液凝块。
2. 延伸时间10 sec/kb可扩增8 kb以下大部分目的片段,3-5 sec/kb即可扩增大部分2 kb以下片段。若扩增效率较低,可适当延长时间至30 sec/kb。
3. PCR反应结束后,推荐将反应产物于4000 rpm (1000× g) 离心1-3 min以沉淀血细胞碎片,取上清进行下游分析。
4. 本产品不可直接用于医疗诊断。
5. 为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。
PCR反应体系a
组分 |
体积 |
ddH2O |
to 50 μL |
2× Hieff® Blood Advanced PCR Buffer |
25 μL |
Forward Primer (10 μM) b |
2 μL |
Reverse Primer (10 μM) b |
2 μL |
Hieff® Advanced High-Fidelity DNA Polymerase Mix |
1 μL |
血液样本c |
X |
a 使用前请充分混匀各组分。
b 推荐每条引物的使用终浓度为0.4 μM,过高会导致非特异性扩增。
c 最佳全血模板浓度范围为0.5%-20%,推荐使用量为10%作为初始尝试条件,即50 μL反应体系中加入5 μL全血作为模板,注意避免吸取血液凝块。对于贮存在Whatman®滤纸卡上的干血渍,则可取约1 mm2带血渍的圆纸片,无需进行预处理,直接放入PCR反应液中即可进行扩增。
PCR反应条件
循环步骤 |
温度 |
时间 |
循环数 |
预变性 |
95℃ |
5 min |
1 |
变性 |
95℃ |
15 sec |
30-35 |
退火a |
60℃ |
15 sec |
|
延伸b |
72℃ |
3-10 sec/kb |
|
终延伸 |
72℃ |
5 min |
1 |
a 退火温度为通用Tm值或低于引物Tm值1-2℃。如果扩增产物特异性较差,可以建立退火温度梯度以寻找最佳退火条件。
b 延伸时间10 sec/kb可扩增8 kb以下大部分目的片段,3-5 sec/kb即可扩增大部分2 kb以下片段。若扩增效率较低,可适当延长时间至20-30 sec/kb,不应超过60 sec/kb。
PCR产物分析
PCR反应结束后,推荐将反应产物于4000 rpm (1000× g) 离心1-3 min以沉淀血细胞碎片,取上清进行下游分析。该步骤可消除全血中多种残留成分对电泳检测的干扰,对使用高浓度血液作为模板的PCR产物尤为必要。通常,5 μL/50 μL (10%)反应产物可取30-35 μL上清,3 μL/50 μL (5%)反应产物可取40-45 μL上清。若需对PCR产物进行其它分析,例如酶切等,应将产物稀释2-4倍以降低反应中的盐及其它抑制剂对反应的干扰。
对照反应
试剂盒内提供引物预混液Positive Control Primer Mix (10 μM each) 用于阳性对照反应。可从哺乳动物及其他许多脊椎动物的基因组sox 21基因上游序列中扩增出237 bp的片段,该扩增区是一段高度保守的非编码区。
Primer F: 5'- AGCCCTTGGGGASTTGAATTGCTG -3'
Primer R: 5'- GCACTCCAGAGGACAGCRGTGTCAATA -3'
常见问题与解决方案
无扩增产物或产量少 |
产物呈现高分子量弥散条带 |
产物呈现低分子量弥散条带 |
检查引物设计,确认引物浓度和纯度 |
提高退火温度或设置退火梯度 |
电泳前离心取上清 |
重复实验,确认体系、程序无误 |
延伸时间不应过长 |
提高退火温度或设置退火梯度 |
增加循环数 |
尝试不同的血液用量 |
尝试不同的血液用量 |
优化退火温度 |
减少循环数 |
减少循环数 |
尝试不同的血液用量 |
降低引物浓度 |
降低引物浓度 |
重新设计引物 |
重新设计引物 |
HB220617