Hieff® Fast T4 DNA Ligase是一款可用于NGS建库过程中DNA片段和接头连接的单酶产品,该产品已经过高通量测序验证,质量优异。本酶具有高效的连接能力,非常适合复杂结构核酸片段的连接,比如华大平台的Ω接头。对于无需进行体系调整的客户,推荐选购Hieff NGS® Ultima DNA Ligation Module (Cat#12604),其核心组分即为本品。
产品组分
组分编号 |
组分名称 |
产品编号/规格 |
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14952ES03 (1 mL) |
14952ES10 (10 mL) |
14952ES60 (100 mL) |
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14952 |
Hieff® Fast T4 DNA Ligase (2000 U/µL) |
1 mL |
10 mL |
100 mL |
单位定义
在20 μL的连接反应体系中,6 μg的λDNA-Hind Ⅲ分解物在16℃下反应30 min时,催化50%以上的DNA片段发生连接所需要的酶量定义为1个活性单位(U)。
运输与保存方法
冰袋运输。-20℃保存,有效期2年。
注意事项
1. T4 DNA Ligase对物理变性敏感,混合时轻轻颠倒试管摇匀,请勿剧烈振荡;
2. 酶使用时宜存放在冰盒内或冰浴上,使用完毕后宜立即放置于-20℃保存;
3. 本产品仅做科研用途;
4. 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
使用方法
1. 目前主流的合并法DNA建库试剂盒,其末端修复和加A处理后一般不纯化,直接进行接头连接。本试剂盒可与主流的商业化末端修复加A体系兼容,进行接头连接。反应体系请参考如下配制,涡旋瞬离后置于20℃,反应15 min即可。
表1 Adapter Ligation体系
名称 |
体积(μL) |
dA-tailed DNA |
60 |
10 × T4 DNA Ligase Buffer(Cat#15821) |
10* |
50% PEG 6000 |
10** |
DNA Adapter |
X*** |
Hieff® Fast T4 DNA Ligase (2000 U/µL) |
0.2-1**** |
ddH2O |
To 100 |
【注】:*试剂盒内未提供10 × T4 DNA Ligase Buffer,若需要可自行准备或推荐选购Yeasen Cat# 15821。**试剂盒内未提供50% PEG 6000,需自行准备。
***接头用量参考表2。
****Hieff® Fast T4 DNA Ligase用量可根据需要添加0.2-1 μL。
2. Adapter的质量和使用浓度直接影响连接效率及文库产量。Adapter用量过高可能会产生较多Adapter Dimer;用量较低可能会影响连接效率及文库产量。表2列举了使用本试剂盒,不同Input DNA量推荐的Adapter使用量。
表2 500 pg-1 μg Input DNA推荐的Adapter使用浓度
Input DNA |
Adapter : Input DNA摩尔比 |
Input DNA |
Adapter : Input DNA摩尔比 |
1 μg |
10:1 |
50 ng |
100:1 |
500 ng |
20:1 |
25 ng |
200:1 |
250 ng |
40:1 |
1 ng |
200:1 |
100 ng |
100:1 |
500 pg |
400:1 |
【注】:Input DNA摩尔数(pmol)≈ Input DNA质量(ng)/ [0.66 × Input DNA平均长度(bp)]。
【接头添加计算举例】:当Input DNA为100 ng,Input DNA长度为300 bp时,接头应该添加多少?
第一步,计算Input DNA摩尔数。公式:Input DNA摩尔数(pmol)≈ Input DNA质量(ng)/ [0.66 × Input DNA平均长度(bp)];
Input DNA摩尔数(pmol)=100 ÷(0.66×300)=0.5 pmol;
第二步,计算接头添加摩尔数。根据表2查询接头添加比例;
根据表2,查得Input DNA 100ng时接头添加比例100:1,则接头添加摩尔数=100×0.5 pmol=50 pmol;
第三步,计算接头添加体积。接头浓度=15 μmol/L(如使用其他接头,浓度需要依据其他接头浓度参数);
接头添加体积=接头添加摩尔数(50 pmol)÷接头浓度(15 μmol/L)=3.34 μL(注:15 μmol/L=15 pmol/μL)
综上,接头可添加3.4 μL。(注:接头最大加入体积不超过5 μL)
HB220930