试剂盒采用酶法破碎酵母细胞壁来提取酵母质粒DNA。所采用的酵母破壁酶能有效地破坏酵母细胞壁,提高酵母质粒DNA的产量。吸附柱中采用的硅基质材料能高效、专一地吸附DNA,可最大限度去除杂质蛋白质及细胞中其他有机化合物。使用本试剂盒提取的酵母质粒DNA可适用于各种常规的分子生物学实验,包括酶切、PCR、测序、连接和转化等试验。本试剂盒无需使用酚、氯仿等有毒试剂,操作安全。
储存条件
2~8 ℃干燥保存, 有效期2年。
操作步骤
- 取1-5 mL酵母培养物(不超过5×107cells), 12000 rpm离心1 min, 尽量吸除上清(菌液较多时可以通过多次离心将菌体沉淀收集到一个离心管中)。
- 酵母细胞壁的破除: 向酵母菌体中加入470 μL破壁Buffer, 充分悬浮菌体, 加入25 μL酵母破壁酶和5 μL巯基还原剂, 充分混匀, 37 ℃处理1-2 h, 期间可颠倒离心管混匀数次。12000 rpm离心1 min,弃上清, 收集沉淀。
- 向沉淀中加入250 μL溶液YP1(请先检查是否已加入RNase A), 充分悬浮沉淀。
注意:如果菌块未彻底混匀,会影响裂解导致质粒提取量和纯度偏低。
- 向离心管中加入250 μL溶液YP2, 温和地上下翻转 6-8次使菌体充分裂解。
注意:混匀一定要温和, 以免污染细菌基因组DNA, 此时菌液应变得清亮粘稠, 作用时间不要超过5 min, 以免质粒受到破坏。
- 向离心管中加入350 μL溶液YP3, 立即温和地上下翻转6-8次, 充分混匀, 此时会出现白色絮状沉淀。12000 rpm离心10 min, 用移液器小心地将上清转移到另一个干净的离心管中, 尽量不要吸出沉淀。
注意: 溶液YP3加入后应立即混合避免产生局部沉淀。如上清中还有微小白色沉淀, 可再次离心后取上清。
- 将上一步所得上清液加入吸附柱中, 室温放置2 min, 12000 rpm离心1 min, 倒掉收集管中的废液, 将吸附柱重新放回收集管中。
- 向吸附柱中加入600 μL漂洗液(使用前请先检查是否已加入无水乙醇), 12000 rpm离心1 min, 弃废液, 将吸附柱放入收集管中。
- 向吸附柱中加入600 μL漂洗液, 12000 rpm离心1 min, 弃废液, 将吸附柱放入收集管中。
9. 12000 rpm离心2 min, 将吸附柱敞口置于室温或50 ℃温箱放置数分钟, 目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除, 否则漂洗液中的乙醇会影响后续的实验如酶切、PCR等。
10. 将吸附柱放入一个干净的离心管中, 向吸附膜中央悬空滴加30-50 μL经65 ℃水浴预热的洗脱液, 室温放置2min, 12000 rpm离心1 min。
11. 为了增加质粒的回收效率, 可将得到的洗脱液重新加入吸附柱中, 室温放置2 min, 12000 rpm离心1min。
注意事项
- 使用前请先检查溶液YP2和溶液YP3是否出现混浊, 如有混浊现象, 可在37 ℃水浴中加热几分钟, 待溶液恢复澄清后再使用。
- 洗脱缓冲液体积不应少于50 μL, 体积过小影响回收效率; 洗脱液的pH值对洗脱效率也有影响, 若需要用水做洗脱液应保证其pH值在8.0左右(可用NaOH将水的pH值调至此范围), pH值低于7.0 会降低洗脱效率; DNA产物应保存在-25~ -15 ℃, 以防DNA降解。
- 质粒得率与酵母菌株、质粒拷贝数、培养条件等因素有关。通常酵母质粒拷贝数都很低, 一般通过电泳或分光光度计法都很难检测到, 可通过PCR或转化大肠杆菌来检测。
- DNA浓度及纯度检测: 得到的基因组DNA片段的大小与样品保存时间、操作过程中的剪切力等因素有关。回收得到的DNA片段可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。DNA应在OD260处有显著吸收峰, OD260值为1相当于大约50 μg/mL双链DNA、40 μg/mL单链DNA。OD260 /OD280比值应为1.7-1.9, 如果洗脱时不使用洗脱缓冲液, 而使用去离子水, 比值会偏低, 因为pH值和离子存在会影响光吸收值, 但并不表示纯度低。
Ver. CN2023102