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CUT&Tag还是ChIP-seq?

       最近收到一些客户疑问,为什么现在做CUT&Tag技术的人更多?ChIP-seq还有必要做吗?
 

       ChIP-seq作为研究蛋白质与DNA互作的经典技术,迄今为止仍然被大多数的客户在使用且在文章见刊。但是CUT&Tag作为该研究的新秀,也是崭露头角,光芒正盛。当然,小翌觉得CUT&Tag技术这个新秀光芒正盛,是自身实力也有市场发展需求的影响。
 

       CUT&Tag技术于2019年问世,问世以来,受到热捧。但是最初,CUT&Tag技术有被质疑,原因在于,CUT&Tag技术在做一些转录因子时,结果不太理想,导致一些声音怀疑CUT&Tag实验是否适用于转录因子。但是果真如此吗?目前报道的CUT&Tag成功实验的转录因子已经很多,包括CTCF、RNA polII、SOX15、RUNX1、JUN、CCKBR等,甚至G4结构、R-loop的也能成功实验。
 

       那为啥CUT&Tag做转录因子就这么难?

       那么,转录因子用ChIP-seq方式来做就不难么?

       转录因子本身做ChIP-seq实验成功率就不高,需要优化实验条件,那为啥CUT&Tag实验就不能去做优化?

       扯远了,回归话题,CUT&Tag技术为什么越来越受到重视?
 

       前面说到了CUT&Tag技术的技术实力:不仅组蛋白修饰能做好,转录因子也能够很好实验。另外,CUT&Tag技术实验背景信号低、实验重复性好、实验操作时长短等等,都是优势。

       除此之外,CUT&Tag技术还能迎合市场需求,像现在较为火热的单细胞技术、空间组学研究等,CUT&Tag技术都能与之配合。同时,CUT&Tag技术还能同时做多个靶点研究。

 

 

01

 空间CUT&Tag研究

 

 

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1.空间CUT&Tag实验流程及验证标准(From Deng Y, et al. Science,2022)
 

 

02

 单细胞CUT&Tag研究

 

 

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2.小鼠脑组织的scCUT&Tag不同组蛋白修饰图谱From Bartosovic M, et al. Nat Biotechnol. 2021)
 

 

03

 CUT&Tag单细胞多组学研究

 

 

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3.scCUT&Tag+scRNA-seq技术Paired-Tag总概(From Zhu C, et al. Nat Methods. 2021)
 

 

04

 CUT&Tag多靶点研究

 

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4.CUT&Tag2for1实验流程及结果展示(From Janssens DH, et al.  Genome Biol. 2022)

 拥有这么多技能的CUT&Tag技术,你会选择么?

 

 

翌圣CUT&Tag试剂盒优势

 

1.翌圣CUT&Tag试剂盒优化了实验体系,使用protein A/G增加抗体特异识别之外,将二抗与protein A/G提前孵育,减少了非特异切割,同时实验时长缩短至6 h;

2.添加spike in,让你的实验结果更真实,更准确。

 
 

 

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5.Spike in校正后,更能反映数据的真实性

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6.Spike in校正后,基因富集更明显

 

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产品名称

货号

规格

Hieff NGS® G-Type In-Situ DNA Binding Profiling Library Prep Kit for Illumina®

12598ES04/12/48

4/12/48T

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参考文献

 

Kaya-Okur, H. S., Wu, S. J., Codomo, C. A., Pledger, E. S., Bryson, T. D., Henikoff, J. G., ... & Henikoff, S. (2019). CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells.Nature communications,10(1), 1930.

 

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