2023年11月16日,Vertex Pharmaceuticals和CRISPR Therapeutics共同宣布基因编辑疗法产品CASGEVY™(Exagaglogene autotemcel)获英国药品监管机构MHRA有条件批准上市,用于治疗治疗镰状细胞病(SCD)和输血依赖性β-地中海贫血(TDT),是全球首款获批上市的CRISPR基因编辑药物,12月8日,美国食品和药物管理局(FDA)也批准了该基因编辑治疗药物。这是基因编辑治疗历史上的里程碑事件,代表着一项重大的科学进步可以让数以万计的患者受益。
图1. CASGEVY™治疗流程(Source:CRISPR Therapeutics官网)
CRISPR基因编辑疗法
自2012年首次亮相以来,CRISPR技术已在基因功能研究、药物靶点筛选、遗传疾病治疗、癌症研究以及作物育种等多个领域取得突破性成果。其工作机制如下:
Cas蛋白(如常用的Cas9)在gRNA的引导下定位到目标DNA序列,随后Cas9与DNA结合并切割其双链,产生一个双链断裂(DSB)。细胞为了修复这一断裂,将启动自身的修复机制,如非同源末端连接(NHEJ)或同源重组修复(HDR)。通过这些修复过程,可以在目标DNA中引入特定的序列。
目前CRISPR技术能以前所未有的精确度对DNA进行修改,包括添加、删除或替换特定基因片段,这一进步不仅使基因修复更加便捷和精准,也为基因治疗指明了新的发展方向。基于CRISPR技术的基因治疗主要分为体外和体内两种形式,下面将为大家详细介绍。
图2. 体外与体内基因编辑疗法[1]
体外基因编辑疗法
体外CRISPR基因编辑疗法主要包括从患者身上收集细胞、在体外进行进行CRISPR基因编辑、将编辑后的细胞移植回患者体内等流程,上述介绍的CASGEVY™便是典型的体外CRISPR基因编辑疗法。除了直接利用CRISPR技术纠正导致癌症的基因突变外,该技术在癌症治疗领域的另一关键应用是免疫细胞的工程化改造,如创建嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)、通用型CAR-T(UCAR-T)等抗癌免疫疗法。
CAR-T疗法是通过改造患者自体T细胞,使T细胞表面表达针对特定癌症抗原的嵌合抗原受体(CAR),通过CAR特异性识别体内肿瘤细胞,并释放大量的多种效应因子,高效地杀灭肿瘤细胞。然而,CAR-T疗法在实际应用中仍面临一些挑战,包括较长的制备周期、自体T细胞质量的不稳定性以及相对较高的治疗成本,这些因素限制了其更广泛的应用。
图3. CAR-T疗法流程图[2]
为了突破传统CAR-T疗法的限制,UCAR-T疗法,即通用型CAR-T或异体CAR-T应运而生。这种疗法使用健康捐献者的T细胞作为原料,通过病毒载体等技术将CAR基因导入T细胞,并运用基因编辑技术去除T细胞表面的TCR、HLA或CD52等分子,以预防供体T细胞引发的移植物抗宿主病(GvHD)并降低患者对异体细胞的排异反应(HvGR)。经过这一系列精细的改造和扩增过程,UCAR-T细胞被制备成可用于治疗患者的成熟产品。
图4. UCAR-T疗法流程[3]
UCAR-T疗法流程:
供者筛选
选择健康供者进行T细胞的采集。
CAR的引入
利用病毒载体或非病毒方法将CAR基因转入T细胞,使其能够特异性识别肿瘤细胞表面的抗原。
基因编辑
使用CRISPR/Cas、TALENs或ZFNs等基因编辑技术,敲除T细胞表面的TCR、HLA或其他可能导致免疫排斥的分子,以降低异体反应。
体外扩增
在实验室条件下对改造后的T细胞进行大量扩增,以获得足够的细胞数量用于治疗。
质量控制
对扩增后的UCAR-T细胞进行严格的质量检测,包括细胞活性、纯度、无菌性等。
患者筛选和准备
确定患者是否适合接受UCAR-T治疗,并进行一些预处理,以减少宿主对UCAR-T的排斥。
细胞输注
将UCAR-T细胞通过静脉输注到患者体内。
CRISPR基因编辑的体外疗法涉及从患者体内提取细胞,在实验室环境中进行基因修改,然后将经过编辑的细胞重新输回患者等过程。这种方法适用于某些关键类型的细胞,如造血干细胞(HSC),但并不适用于所有种类的细胞。另一种基因编辑疗法是直接在体内进行的基因编辑,无需细胞提取和体外操作的步骤,可直接在患者的体内进行基因编辑。这种方法易于批量生产,给药方式简单,能显著降低治疗成本,还能为难以进行细胞提取或体外培养的疾病提供治疗可能。
体内CRISPR基因编辑疗法
体内基因编辑疗法主要通过将基因编辑工具直接输送至患者体内,在体内环境中对引发疾病的特定基因进行精确且有效的修改。目前已用于体内基因编辑治疗的基因编辑工具有3类:核酸酶(Nucleases)、碱基编辑器(Base editors)及先导编辑器(Prime editors)。
图5. 体内基因编辑疗法原理图[4]
在哺乳动物细胞中,通常利用核酸酶在基因组DNA的特定位置引入DSB实现有效的基因编辑,其中,CRISPR-Cas核酸酶系统因其高效性和精确性而成为创建定向DSB最广泛的应用工具。CRISPR-Cas核酸酶系统体内基因编辑流程如下:
gRNA设计及合成
设计特异性的导向RNA(gRNA)以靶向特定的DNA序列。
Cas蛋白递送形式选择
选择合适的基因编辑形式,如质粒DNA(pDNA)、mRNA或Cas核糖核蛋白(RNP)。
递送系统的选择与优化
选择合适的递送系统,如腺相关病毒(AAV)、脂质纳米颗粒(LNP)、病毒样颗粒(VLP)等。
体内送达
将基因编辑复合体通过静脉注射、局部注射或其他方式递送到患者体内。
基因编辑
在目标细胞内,gRNA引导Cas蛋白识别并结合到目标DNA序列。Cas蛋白在目标位点造成DNA双链断裂(DSB)。
DNA修复
细胞通过自身的DNA修复机制,对断裂的DNA进行修复。
监测与评估
监测基因编辑效果,评估脱靶效应和治疗效果。通过生物标志物和临床指标评估安全性和有效性。
图6. 核酸酶作用原理图[1]
来源于化脓性链球菌(Streptococcus pyogenes)的SpCas9蛋白是目前最为常用的一种Cas蛋白,然而,由于SpCas9潜在的脱靶效应和尺寸限制等问题,研究人员持续探索其他类型的Cas蛋白,如Cas12和Cas13,以期找到更小、更精确的Cas蛋白。同时,通过蛋白质工程技术对Cas蛋白进行改造也是当前研究的重点之一。这些改造旨在提高基因编辑的效率、减少脱靶率并优化编辑窗口,从而进一步扩展CRISPR技术在基因治疗等领域的应用潜力。
目前CRISPR基因编辑技术仍处于高速发展阶段,整个行业尚未完全成熟,随着技术的不断进步,预计会有更多的递送技术得到改进,新的传递工具也将诞生,从而进一步提高治疗的安全性和效果。体外CRISPR基因编辑疗法已上市,相信体内疗法也会在不久的将来问世。
基因编辑相关产品
编辑类型 |
产品分类 |
产品名称 |
产品货号 |
体外编辑(研究级) |
Cas9蛋白 |
Cas9 Nuclease |
14701ES |
Cas12a蛋白 |
ArCas12a Nuclease |
14702ES |
|
Cas12b蛋白 |
AapCas12b Nuclease |
14808ES |
|
sgRNA合成 |
Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit |
11355ES |
|
表达鉴定 |
Cas9(CRISPR Associated Protein 9) ELISA Kit |
99401ES |
|
体内编辑 (GMP级) |
内切酶 |
BspQI GMP-grade (10 U/μL) |
10664ES |
Bsa I GMP-grade (20 U/μL) |
10661ES |
||
T7 RNA Polymerase |
T7 RNA Polymerase GMP-grade (50 U/μL) |
10624ES |
|
无机焦磷酸酶 |
Pyrophosphatase,Inorganic GMP-grade |
10620ES |
|
RNase抑制剂 |
Murine RNase inhibitor GMP-grade |
10621ES |
|
牛痘病毒加帽酶 |
mRNA Vaccinia Capping Enzyme GMP-grade |
10614ES |
|
Cap2氧甲基转移酶 |
mRNA Cap 2'-O-Methyltransferase GMP-grade |
10612ES |
参考文献:
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