Hieff NGS® RNA 384 CDI Primer for MGI®是MGI®高通量测序平台RNA文库构建专用接头引物试剂盒,共分为2个Set,每个Set包含二代测序建库中使用的UDB adapter以及 8种Barcode 2 Index Primer和12种Barcode 1 Index Primer。 2个Set共提供16种Barcode 2 Index Primer和24种Barcode 1 Index Primer,配合 Yeasen出品的RNA建库试剂盒使用可构建多达384种不同组合的双端index标记的文库。试剂盒中提供的所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,最大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。
产品组分
编号 |
名称 |
规格 |
13365ES02 |
UDB Adapter |
480 μL |
RP 201-208 |
60 μL each |
|
RP 101-112 |
40 μL each |
|
13366ES02 |
UDB Adapter |
480 μL |
RP 209-216 |
60 μL each |
|
RP 113-124 |
40 μL each |
冰袋运输。
所有组分-20°C保存,有效期1年。
1)本试剂盒中UDB Adapter的浓度为10 μM,单个文库构建的接头使用量根据所用建库试剂盒进行调整。Index Primer的浓度为10 μM。
2)本试剂盒提供的UDB Adapter为通用型短接头,需要通过PCR扩增获得完整的文库。Index Primer提供Barcode序列标签,用于高通量测序时区分样品。
3)本试剂盒每个Set包含8种Barcode 2 Index Primer (RP 2xx)和12种Barcode 1 Index Primer (RP 1xx),相互组合可以构建96种不同组合的双端Index标记文库。2个Set共提供16种Barcode 2 Index Primer和24种Barcode 1 Index Primer。您可以使用Cat#13365中的Barcode 2 Index Primer(或Barcode 1 Index Primer)与Cat#13366中的Barcode 1 Index Primer(或Barcode 2 Index Primer)组合用以构建多达384种不同组合的双端Index标记文库。
4)切勿加热接头,应在室温让其缓慢溶解,实验室温度最好设置为20-25℃。接头避免反复冻融,建议分装保存,可短暂存放于4℃。
5)使用Hieff NGS® RNA 384 CDI Primer for MGI®试剂盒构建的测序文库结构如下:
6)为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
7)本产品仅作科研用途!
1. 接头的使用:参照所用建库说明书中对不同投入量的推荐用量稀释至合适浓度使用。
2. Index Primer的使用:按照建库说明书中文库扩增体系配制反应体系(如下表),反应程序按照建库说明书中程序进行设置。
组分名称 |
体积(μL) |
2× High Fidelity DNA PCR Mix |
25 |
RP 2xx |
2.5 |
RP 1xx |
2.5 |
Adapter Ligated DNA |
20 |
Total |
50 |
UDB Adapter for MGI:
5´-/5Phos/ AGTCGGAGGCCAAGCGGTCTTAGGAAGACAATCAG -3´
5´-TTGTCTTCCTAAGCAACTCCTTGGCTCACAGAACGACATGGCTACGATCCGACTT -3´
Barcode 2 Index Primer for MGI:
5´-/5Phos/CTCTCAGTACGTCAGCAGTT[Barcode 2 Index]CAACTCCTTGGCTCACAGAAC -3´
Barcode 1 Index Primer for MGI:
5´-GCATGGCGACCTTATCAG[Barcode 1 Index]TTGTCTTCCTAAGACCGCTTGG-3´
[Barcode 2 Index]表示10 bp 的Barcode 2 Index序列,[Barcode 1 Index]表示10 bp 的Barcode 1 Index序列,各引物对应的Index名称、引物中包含的Index序列以及测序时对应的Index序列信息如下表所示:
Barcode 2 Index Primers |
引物中的序列 |
测序仪拆分用序列(同引物中的序列) |
RP201 |
TAGGTCCGAT |
TAGGTCCGAT |
RP202 |
GGACGGAATC |
GGACGGAATC |
RP203 |
CTTACTGCCG |
CTTACTGCCG |
RP204 |
ACCTAATTGA |
ACCTAATTGA |
RP205 |
TTCGTATCCG |
TTCGTATCCG |
RP206 |
GGTAACGAGC |
GGTAACGAGC |
RP207 |
CAACGTATAA |
CAACGTATAA |
RP208 |
ACGTCGCGTT |
ACGTCGCGTT |
RP209 |
TTCTGCTAGC |
TTCTGCTAGC |
RP210 |
AGGAAGATAG |
AGGAAGATAG |
RP211 |
GCTCTTGCTT |
GCTCTTGCTT |
RP212 |
CAAGCACGCA |
CAAGCACGCA |
RP213 |
CGGCAATCCG |
CGGCAATCCG |
RP214 |
ATCAGGATTC |
ATCAGGATTC |
RP215 |
TCATTCCAGA |
TCATTCCAGA |
RP216 |
GATGCTGGAT |
GATGCTGGAT |
Barcode 1 Index Primers |
引物中的序列 |
测序仪拆分用序列(与引物中的序列反向互补) |
RP101 |
TAGGTCCGAT |
ATCGGACCTA |
RP102 |
GGACGGAATC |
GATTCCGTCC |
RP103 |
CTTACTGCCG |
CGGCAGTAAG |
RP104 |
ACCTAATTGA |
TCAATTAGGT |
RP105 |
TTCGTATCCG |
CGGATACGAA |
RP106 |
GGTAACGAGC |
GCTCGTTACC |
RP107 |
CAACGTATAA |
TTATACGTTG |
RP108 |
ACGTCGCGTT |
AACGCGACGT |
RP109 |
TTCTGCTAGC |
GCTAGCAGAA |
RP110 |
AGGAAGATAG |
CTATCTTCCT |
RP111 |
GCTCTTGCTT |
AAGCAAGAGC |
RP112 |
CAAGCACGCA |
TGCGTGCTTG |
RP113 |
CGGCAATCCG |
CGGATTGCCG |
RP114 |
ATCAGGATTC |
GAATCCTGAT |
RP115 |
TCATTCCAGA |
TCTGGAATGA |
RP116 |
GATGCTGGAT |
ATCCAGCATC |
RP117 |
GTGAGTGATG |
CATCACTCAC |
RP118 |
GAGTCAGCTG |
CAGCTGACTC |
RP119 |
TGTCTGCGAA |
TTCGCAGACA |
RP120 |
ATTGGTACAA |
TTGTACCAAT |
RP121 |
CGATTGTGGT |
ACCACAATCG |
RP122 |
ACAGACTTCC |
GGAAGTCTGT |
RP123 |
TCCACACTCT |
AGAGTGTGGA |
RP124 |
CACCACAAGC |
GCTTGTGGTG |
HB210421