前言

新生儿疾病筛查是出生缺陷三级预防的最后一道关键防线。我国新生儿筛查率已超98.5%，但传统生化检测与二代测序（NGS）仍存在明显短板：复杂疾病检出不全、阳性召回周期长、2周内确诊率偏低、假阳性/假阴性难以避免。《出生缺陷防治能力提升计划（2023—2027年）》明确提出：遗传代谢病力争2周内诊断、2周内治疗，听力障碍3个月内诊断、6个月内干预，核心目标已从“广覆盖”转向快诊断、早干预。

第三代测序（长读长测序）凭借超长读长、无PCR偏好、精准解析结构变异/重复序列/真假基因、直接定相单倍型等核心优势，可实现筛诊一步到位，完美解决新生儿筛查的痛点。翌圣生物依托自主分子酶平台与超洁净生产工艺，推出适配Nanopore等平台的三代全长建库解决方案，为新生儿基因筛查提供稳定、高效、低背景的全流程试剂支撑，助力实现“筛—诊—治”一体化提速。

一、新生儿基因筛查：从传统筛查到基因组一级筛查的变革

1.1 传统筛查的瓶颈与痛点

1) 覆盖病种有限：以生化/免疫为主，仅能检出苯丙酮尿症、先天性甲状腺功能减低症等少数疾病，对CAH、地贫、SMA、FXS、耳聋等高发单基因病覆盖不足。

2) 流程多阶、周期漫长：筛查阳性→召回→复检→确诊，平均耗时数周，PKU出生2周内确诊仅6%，经典型CAH 30天内确诊仅44.4%，延误最佳干预窗口。

3) 复杂变异检出盲区：二代测序难以解析大片段缺失/重复、假基因干扰、串联重复动态突变、顺反式变异，易漏诊、误诊。

4) 假阳性高、家长焦虑：多重验证增加医疗负担与家庭心理压力。

1.2 基因组一级筛查成为国际新趋势

1) Baby Detect等大型队列研究证实：

 基于测序的基因组一级筛查接受率＞90%，可一次性覆盖数百种可治严重儿科疾病。

 可检出传统筛查遗漏的G6PD缺乏症、血友病、糖原累积病、CPT2缺乏症等，阳性率达1.8%，显著提升早诊率。

2) 行业共识：生化+基因组测序双轮驱动，是未来新生儿筛查的标准模式。

二、三代测序（长读长）：新生儿筛查的“筛诊一体”核心技术

2.1 三代测序核心技术优势

三代测序以SMRT（PacBio）与Nanopore为代表，具备四大临床价值：

1) 超长读长：单次读长可达kb~Mb级，跨越重复区、同源区、假基因区，一次到位解析全长基因。

2) 无PCR扩增、无GC偏好：适用于降解样本、低起始量样本，新生儿干血斑也能稳定建库。

3) 变异类型全覆盖：同时检出SNV、Indel、CNV、大片段缺失/重复、基因重排、动态突变、假基因干扰等所有致病变异。

4) 直接定相（Phasing）：无需家系验证，直接区分顺式/反式突变，实现一次检测=确诊，真正筛诊一体。

2.2 三代测序 vs 二代测序：新生儿筛查场景关键对比

维度	二代测序（NGS）	三代测序（Long-read）
读长	短（100–300 bp）	长（kb~Mb）
结构变异 / 重复序列	难准确解析	精准解析
假基因干扰（如 CYP21A2）	易混淆、误判	精准区分真假基因
串联重复动态突变（FXS）	不准、易漏检	准确定量重复数
单倍型 / 顺反式	需家系验证	直接定相
筛诊周期	筛查→召回→验证，周期长	一次检测，筛诊一体
适用复杂疾病	有限	全覆盖（地贫、CAH、SMA、FXS、耳聋等）

2.3 三代测序在新生儿筛查中的核心价值

 快：大幅缩短TAT，助力实现2周内诊断、2周内治疗目标。

 准：降低假阳性/假阴性，减少不必要召回与焦虑。

 全：一次性覆盖点突变、缺失、重复、重排、动态突变，无检测盲区。

 省：减少复检、转诊、多平台验证，降低家庭与社会成本。

三、三代测序重点覆盖的新生儿高发遗传病

3.1 先天性肾上腺皮质增生症（CAH）

致病基因：CYP21A2，邻近假基因CYP21A1P高度同源，二代易混淆。

三代优势：精准区分真假基因，全面检出点突变、大片段缺失、基因转换，一次确诊，无需MLPA+Sanger组合验证。

3.2 地中海贫血（地贫）

变异复杂：α/β地贫、大片段缺失、三联体、四联体、融合基因并存。

三代优势：一次检测全覆盖，检出传统方法漏检的罕见变异，为重症地贫防控提供精准依据。

3.3 脊髓性肌萎缩症（SMA）

关键：SMN1/SMN2高度同源，需准确判读拷贝数、微小变异、2+0携带者风险。

三代优势：全长测序，精准区分同源基因，全面评估携带者与患儿风险，降低漏检。

3.4 脆性X综合征（FXS）

致病机制：FMR1基因CGG串联重复动态突变，重复数异常导致发病。

三代优势：准确定量重复数，识别AGG插入，精准评估前突变女性遗传风险。

3.5 其他高发可筛可治疾病

G6PD缺乏症、苯丙酮尿症（PKU）、非综合征性耳聋等，均存在复杂变异或假基因干扰，三代测序可显著提升检出率与确诊速度。

四、翌圣生物：三代测序新生儿筛查全流程解决方案

翌圣生物聚焦长读长建库核心试剂，以超低背景、高效连接、宽样本兼容、极速流程为特点，完美适配新生儿干血斑、微量样本等临床场景，助力筛诊一体落地。

4.1 核心产品矩阵（适配Nanopore三代平台）

1) Hieff® DNA Library Prep Kit for ONT（13301ES）

连接法全长建库，流程约2小时，操作极简；末端修复+加A一步完成，产物无需纯化直接接头连接，减少损失、提升成功率；兼容gDNA、扩增子、微量基因组，适配新生儿低起始量样本。

2) Hieff® Endprep&dATail Module for ONT（13302ES）

高效末修加A，投入量100 ng–1.5 μg，适配多种样本类型；优化酶与缓冲体系，连接效率高、测序长度表现优异。

3) 配套核心试剂

分选磁珠（12418ES）：纯化效率＞90%，背景低；

Qubit定量试剂（12642ES）：高敏精准，质控稳定，保障建库成功率；

长片段高保真扩增酶（17228ES）：适用于长片段目标区域富集，保真性强、偏好低。

4.2 翌圣方案核心优势

1) 超低背景菌残留：超洁净生产，避免新生儿样本干扰，结果更可靠。

2) 流程极简、耗时短：减少手工操作，适合临床高通量筛查。

3) 宽兼容、高稳定：适配干血斑、微量组织、体液等多种新生儿样本。

4) 数据表现优异：文库转化率高、读长长、质控稳定，与进口试剂对标不掉链。

5) 全流程配套：从提取、建库、纯化、定量到防污染，一站式配齐。

五、总结与展望

三代长读长测序以筛诊一体、全面精准、快速高效的独特优势，正在重构新生儿基因筛查新格局，是实现2周内诊断、2周内治疗的核心技术支撑。它可全面解决传统与二代测序在复杂变异、假基因、重复序列、定相上的盲区，让新生儿筛查从“多阶慢筛”迈向“一步快诊”。

翌圣生物将持续深耕三代建库核心试剂，以超低背景、高效稳定、全流程配套的解决方案，助力各级新生儿筛查中心与临床机构提升早诊率、干预率，降低漏诊误诊与医疗成本，为中国出生缺陷防控事业提供更精准、更普惠、更高效的分子工具支撑，共同守护亿万新生儿健康起点。

六、翌圣三代测序新生儿筛查核心产品货号表

分类	货号	产品名称	备注
ONT文库制备	13301ES	Hieff® DNA Library Prep Kit for ONT （ONT平台三代建库试剂盒）	三代全长文库构建试剂盒
三代全长RNA建库	12937ES	Hieff® LongSeq cDNA Library Prep Kit for CycloneSEQ	三代RNA逆转录成全长cDNA
	13302ES	Hieff® DNA Endprep&dA-Tail Module for ONT 末端修复/A尾添加模块
	13304ES	Hieff® Adapter Ligation Module for ONT
三代rRNA去除推荐	12266ES	Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Mammal) with purification beads/磁珠法哺乳动物通用核糖体去除试剂盒	全长lncRNA建库前rRNA去除
	12264ES	Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Bacteria(G- and G+)) with purification beads/磁珠法细菌核糖体去除试剂盒
	12262ES	Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Plant) with purification beads / 磁珠法植物通用核糖体去除试剂盒
三代PCR产物（含全长扩增子）建库	13306ES	Hieff® LongSeq Amplicon End repair and Ligation Module	片段化酶法线性化质粒全长建库
	13304ES	Hieff® Adapter Ligation Module for ONT	马达蛋白接头连接模块
	13317ES	Hieff® Native Barcode Kit for ONT	ONT平台专用Barcode，连接法专用
试剂	12642ES	1×dsDNA HS Assay Kit	用于核酸提取后的定量、三代DNA文库制备过程文库浓度的测定
	12643ES	dsDNA BR Assay Kit
	12640ES	dsDNA HS Assay Kit
磁珠	12602ES	Hieff NGS® RNA Cleaner	RNA纯化磁珠
	12418ES	Hieff NGS® DNA Selection Beads V2 分选磁珠(完美替代AMPure XPBeads)	三代建库纯化磁珠
耗材	83509ES	Qubit专用检测管