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Hieff® LongSeq cDNA Library Prep Kit for CycloneSEQ(三代全长转录组建库试剂盒)
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产品介绍

Hieff® LongSeq cDNA Library Prep Kit for CycloneSEQ是以Oligo (dT) Primer为引物,利用逆转录酶的末端转移酶活性即Template-switching活性在cDNA的3’端添加特殊序列,PCR扩增以这个特殊序列和Oligo (dT) Primer的末端部分序列为引物进行全长cDNA的制备。该试剂为CycloneSEQ仪器专用试剂。

产品特色
  • 全长转录组应用

1-农学

  • 完善转录组信息:复杂基因结构,转录本结构和功能分析。
  • 差异/动态转录组:胁迫处理或不同时序转录组变化,动植物驯化机制。
  • 比较转录组:近缘物种间亲缘关系,mRNA序列差异。

2-医学

  • 融合基因鉴定:融合基因的癌症致病机理。
  • 复杂基因转录本研究:疾病或癌症相关基因的复杂剪切形式。
  • 定量转录组:基因/转录本水平定量,挖掘条件特异性基因/转录本。
应用案例

一、UHRR 标准品数据展示
实验方案:使用翌圣全长转录组试剂盒12937ES搭配序风 CycloneSEQ 纳米孔测序平台G400-ER / G100-ER,用UHRR标准品进行全长转录组建库和测序,测序总通量超过 248 Gb,其中全长转录本通量占比达88.02%, 有效比对率高达98.01%。

结果显示,在标准品RNA 条件下,可稳定获得高比例、可用于转录本层级分析的有效数据。随着 reads 数增加,转录本与基因检出数量持续提升。在基因体覆盖层面,测序覆盖从转录起始位点(TSS)到转录终止位点(TES)均匀连续,未观察到明显的 5' 或 3' 端偏好性,表明数据质量支持精细的转录本结构解析。

二、真实样本的全长转录组数据展示

实验方案:使用翌圣全长转录组试剂盒12937ES搭配序风 CycloneSEQ 纳米孔测序平台G400-ER / G100-ER,用UHRR标准品进行全长转录组建库和测序。 该数据包含小鼠脾脏、小鼠肝脏、雌雄斑马鱼、UHRR、酵母等多类样本,每类样本各 4 个生物学重复, 在不同物种与样本复杂度条件下 , 各样本全长转录本占比均高于83%,比对率均在 96.5% 以上,获得了稳定性高、重复性好的转录组数据表现。

存储条件

-25~-15℃保存。

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