酶切点位
5'-G↓AATTC-3'
3'-CTTAA↑G-5'
产品描述
FuniCut™系列内切酶是通过基因工程重组技术,可在5~15 min内精确完成DNA切割的快速限制性内切酶,适用于快速切割质粒DNA、PCR产物、基因组DNA等。FuniCut™系列快速内切酶共用一种酶切缓冲液,从而简化了酶切反应体系,另外,有良好的酶活冗余度,可轻松处理底物过量或困难模板的酶切。
产品组分
组分编号 |
组分名称 |
产品规格 |
15010-A |
FuniCut™ EcoRI |
600 μL |
15010-B |
10×FuniCut™ Buffer |
3×1 mL |
15010-C |
10×FuniCut™ Color Buffer |
3×1 mL |
运输与保存方法
冰袋运输。-20°C保存,有效期2年。
识别位置
5'-G↓AATTC-3'
3'-CTTAA↑G-5'
推荐反应条件
1× FuniCut™ 缓冲液;
最适37°C孵育。
失活条件
80°C孵育20 min。
注意事项
1)3 h孵育未表现星号活性,延时酶切可能出现星号活性;
2)受CpG甲基化影响,序列可能重叠,剪切受阻;
3)为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作;
4)本产品仅作科研用途!
质量控制
1. 功能活性检测:最适反应温度下,在20 μL反应体系中,1 μL酶能够在15 min内完全消化1 μg λDNA。
2. 超长时间孵育检测:最适反应温度下,将1 μL酶与1 μg λDNA共孵育3 h,未检测到其他核酸酶污染或星号活性引起的底物非特异性降解,但延长孵育时间可能出现星号活性。
3. 酶切-连接-再酶切检测:最适反应温度下,使用1 μL酶消化底物,回收酶切产物,在22°C下使用适量T4 DNA连接酶可以将酶切产物重新连接,将连接产物再次回收后,使用相同的内切酶可以重新切开连接产物。
4. 非特异性内切酶活性检测:最适反应温度下,将1 μL酶与1 μg超螺旋质粒DNA共同孵育4 h后,使用琼脂糖凝胶电泳检测,质粒DNA仍然处于超螺旋状态。
5. 蓝白斑检测:将含有单一lacZα基因的载体以1 μL酶消化,重新连接后转化入大肠杆菌感受态细胞,涂布在含有对应抗生素、IPTG和X-gal的LB培养基平板上。连接正确的产物会生长出蓝色菌落,而连接错误(即DNA末端切口不完整)的产物将得到白色菌落。对于FuniCut™系列限制酶而言,白色菌落比例应小于1%。
使用方法
1. DNA快速酶切流程
1)按如下建议的加样顺序配制体系反应液(冰上操作):
组分 |
质粒DNA |
PCR产物 |
基因组DNA |
ddH2O |
15 μL |
16 μL |
30 μL |
10×FuniCut™ Buffer或10×FuniCut™ Color Buffer |
2 μL |
3 μL* |
5 μL |
底物DNA |
2 μL(~1 μg) |
10 μL (~0.2 μg) |
10 μL (5 μg) |
FuniCut™ EcoRI |
1 μL |
1 μL |
5 μL |
Total |
20 μL |
30 μL |
50 μL |
*本体系指已纯化后的PCR产物。未纯化的PCR产物具备一定的离子强度,10×FuniCut TM Buffer加入量可适当减少至2 μL。若下一步进行克隆等实验,酶切前需纯化PCR产物。
2)轻柔吸打或轻弹管壁以混匀(切勿涡旋),然后瞬时离心以收集挂壁液滴。
3)37°C孵育15 min(质粒),或15~30 min(PCR 产物),或30~60 min(基因组 DNA)。
4)80°C孵育20 min即可使酶失活,停止反应(可选)。
2. 双酶切或多酶切
1)每种内切酶的用量为1 μL,并根据需要适当扩大反应体系。
2)所有内切酶的体积总和不得超过总反应体系的1/10。
3)如果选用的几种内切酶的最适反应温度不同,应先以最适温度低的酶开始酶切,再添加最适温度较高的酶,以较高的温度进行孵育。
3.质粒的扩大反应体系
组分 |
体积(20 μL) |
体积(20 μL) |
体积(50 μL) |
DNA |
1 μg |
2 μg |
5 μg |
FuniCut™ EcoRI |
1 μL |
2 μL |
5 μL |
10×FuniCut™ Buffer或10×FuniCut™ Color Buffer |
2 μL |
2 μL |
5 μL |
Total |
20 μL |
20 μL |
50 μL |
【注】:如果总反应体系大于20 μL,可使用水浴、金属浴或沙浴,并增加孵育时间。
不同DNA中的识别位点数
λDNA |
ΦX174 |
pBR322 |
pUC57 |
pUC18/19 |
SV40 |
M13mp18/19 |
Adeno2 |
5 |
0 |
1 |
1 |
1 |
1 |
1 |
5 |
甲基化修饰影响
Dam |
Dcm |
CpG |
EcoKI |
EcoBI |
无影响 |
无影响 |
序列可能重叠 剪切受阻 |
无影响 |
无影响 |
不同反应缓冲液中的活性
反应缓冲液 |
FuniCut™ Buffer |
Thermo Scientific FastDigest Buffer |
NEB CutSmart® Buffer |
Takara QuickCut™ Buffer |
活性 |
100% |
100% |
100% |
100% |
【注】:活性数据来自翌圣生物限制酶标准反应体系下的检测。
同裂酶
FunII
【注】:同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。
keywords: EcoRI、EcoR I、EcoR i、EcoR1、EcoR 1、EcoRⅠ、EcoR Ⅰ、EcoR
相关产品
产品名称 |
货号 |
规格 |
11801ES80 |
10×100 μL |
|
11802ES80 |
10×100 μL |
|
10148ES60 |
100 U |
|
10149ES03 |
1 mL |
|
10912ES10 |
10 T |
|
11003ES10 |
10 T |
HB211123