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常见定点突变方法分析与对比

基因定点突变是目前生物学和基础医学研究中的重要实验技术,是改造、优化基因的便捷方案。对已知DNA片段的特定碱基进行定点改变、缺失或者插入,可以改变对应的氨基酸序列和蛋白质结构,可用于研究蛋白质结构和功能之间的复杂关系。

 

定点突变的应用领域

蛋白质相互作用位点的结构研究;

酶的活性或者动力学特性改造;

启动子或者DNA作用元件改造;

蛋白的抗原性或稳定性提升;

药物研发&基因治疗;

 

目前基因突变主要使用PCR介导的突变引入技术,常见的基因定点突变方法有重叠延伸PCR 法和滚轮扩增法,各方法有利有弊。

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1. 基于重叠延伸PCR的定点突变实验流程

 

常规重叠延伸PCR需设计一对涵盖突变位点的引物进行两轮PCR,第一轮PCR由正向外侧引物与突变引物合成片段1,由另一突变引物与反向外侧引物合成片段2;第二轮PCR利用两个片段作为模板扩增出含突变位点的全长基因。该方法最大的缺陷是操作相对繁琐,两轮PCR扩增和频繁的DNA回收操作会提高原始质粒污染的风险,并且第二轮PCR受影响因素较多,有时反复调整PCR反应条件也不能获得目标基因。

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2. 基于滚轮扩增原理的定点突变实验流程

 

基于滚轮扩增原理的定点突变方法需设计一对包含突变位点的引物(正、反向),和模版质粒退火后用DNA聚合酶扩增,获取的扩增片段完成5‘端磷酸化后在DNA连接酶的作用下环化,原始质粒在DpnI的酶切作用下被消化,最终获得突变质粒,该方法的缺陷在于7-10 Kb全长质粒的扩增往往不顺利,若不彻底消化原始质粒也容易产生假阳性克隆。同时若需要完成多位点的定向突变,则需要花费更多的时间精力以及试剂成本。

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3. 基于同源重组技术的定点突变实验流程

 

目前市面上还存在着一种基于同源重组技术的定点突变方法,该方法需要在反向PCR引物中引入同源臂和突变位点,获取的产物在剔除掉原始模板后,于重组酶的作用下发生同源重组形成全长目的基因。该方法应用范围广,可进行单点、多点突变以及插入缺失等等,扩增的片段长度更长,可满足十几Kb全长基因的扩增需求,所要花费的时间精力等成本更少。
 

三种定点突变方法比对

 

基于重叠延伸PCR法定点突变

基于滚轮扩增原理的定点突变

基于同源重组技术的定点突变

难度系数

★★★★★

★★★

★★★

所需时间

★★★★★

★★★

★★★

基因长度

★★

★★★

★★★★★

突变效率

★★

★★★

★★★★★

适用范围

单点突变、多点突变

单点突变,多点突变需花费大量时间

单点突变、多点突变

 

翌圣生物匠心研发的定点突变试剂盒基于Hieff Clone® 快速克隆技术的定点突变系统,目标质粒扩增产物经DpnI消化、Hieff Clone®重组环化后直接进行转化即可完成定点突变。高效快速的实现直接对目标质粒中的靶位点进行单点突变,多点突变,以及插入或缺失等。

产品优势

应用范围广:可进行单点,多点突变

扩增性能优越:超高保真酶可扩增长度小于20 Kb的任何质粒

高效DpnI酶:可充分有效降解未突变的质粒模板

产品列表

应用

产品名称

产品货号

规格

单碱基、不连续双碱基

Hieff Mut Site-Directed Mutagenesis Kit 定点突变试剂盒

11003ES10

10 T

三至五个不连续位点

(相距超过50 bp

Hieff Mut Site-Directed Mutagenesis Kit 定点突变试剂盒

11004ES10

10 T

 

400-6111-883