基因定点突变是目前生物学和基础医学研究中的重要实验技术,是改造、优化基因的便捷方案。对已知DNA片段的特定碱基进行定点改变、缺失或者插入,可以改变对应的氨基酸序列和蛋白质结构,可用于研究蛋白质结构和功能之间的复杂关系。
蛋白质相互作用位点的结构研究;
酶的活性或者动力学特性改造;
启动子或者DNA作用元件改造;
蛋白的抗原性或稳定性提升;
药物研发&基因治疗;
目前基因突变主要使用PCR介导的突变引入技术,常见的基因定点突变方法有重叠延伸PCR 法和滚轮扩增法,各方法有利有弊。
图1. 基于重叠延伸PCR的定点突变实验流程
常规重叠延伸PCR需设计一对涵盖突变位点的引物进行两轮PCR,第一轮PCR由正向外侧引物与突变引物合成片段1,由另一突变引物与反向外侧引物合成片段2;第二轮PCR利用两个片段作为模板扩增出含突变位点的全长基因。该方法最大的缺陷是操作相对繁琐,两轮PCR扩增和频繁的DNA回收操作会提高原始质粒污染的风险,并且第二轮PCR受影响因素较多,有时反复调整PCR反应条件也不能获得目标基因。
图2. 基于滚轮扩增原理的定点突变实验流程
基于滚轮扩增原理的定点突变方法需设计一对包含突变位点的引物(正、反向),和模版质粒退火后用DNA聚合酶扩增,获取的扩增片段完成5‘端磷酸化后在DNA连接酶的作用下环化,原始质粒在DpnI的酶切作用下被消化,最终获得突变质粒,该方法的缺陷在于7-10 Kb全长质粒的扩增往往不顺利,若不彻底消化原始质粒也容易产生假阳性克隆。同时,若需要完成多位点的定向突变,则需要花费更多的时间精力以及试剂成本。
图3. 基于同源重组技术的定点突变实验流程
目前市面上还存在着一种基于同源重组技术的定点突变方法,该方法需要在反向PCR引物中引入同源臂和突变位点,获取的产物在剔除掉原始模板后,于重组酶的作用下发生同源重组形成全长目的基因。该方法应用范围广,可进行单点、多点突变以及插入缺失等等,扩增的片段长度更长,可满足十几Kb全长基因的扩增需求,所要花费的时间精力等成本更少。
三种定点突变方法比对
基于重叠延伸PCR法定点突变 |
基于滚轮扩增原理的定点突变 |
基于同源重组技术的定点突变 |
|
难度系数 |
★★★★★ |
★★★ |
★★★ |
所需时间 |
★★★★★ |
★★★ |
★★★ |
基因长度 |
★★ |
★★★ |
★★★★★ |
突变效率 |
★★ |
★★★ |
★★★★★ |
适用范围 |
单点突变、多点突变 |
单点突变,多点突变需花费大量时间 |
单点突变、多点突变 |
翌圣生物匠心研发的定点突变试剂盒基于Hieff Clone® 快速克隆技术的定点突变系统,目标质粒扩增产物经DpnI消化、Hieff Clone®重组环化后直接进行转化即可完成定点突变。高效快速的实现直接对目标质粒中的靶位点进行单点突变,多点突变,以及插入或缺失等。
应用范围广:可进行单点,多点突变
扩增性能优越:超高保真酶可扩增长度小于20 Kb的任何质粒
高效DpnI酶:可充分有效降解未突变的质粒模板
应用 |
产品名称 |
产品货号 |
规格 |
单碱基、不连续双碱基 |
11003ES10 |
10 T |
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三至五个不连续位点 (相距超过50 bp) |
11004ES10 |
10 T |