eTET1 增强型DNA双加氧酶是翌圣生物科技(上海)股份有限公司基于纳氏虫属DNA双加氧酶 (NgTET1)进行改造的重组融合突变体蛋白,具有更高的酶活性。eTET1可以将甲基化胞嘧啶 (5mC)经过三步连续氧化反应氧化成羧基化胞嘧啶 (5caC)。通过转化剂的作用,5caC进一步被转化成尿嘧啶 (U),并通过PCR将尿嘧啶 (U)转化成胸腺嘧啶 (T),从而达到单碱基分辨率和高准确性的DNA甲基化位点鉴定。
一、关于操作
1. 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
2. 请于使用前将试剂盒各组分置于室温解冻。解冻后上下颠倒数次充分混匀,短暂离心后置于冰上待用。
3. 推荐在带热盖的PCR仪中进行各步骤反应,使用前应预热PCR仪至反应温度附近。
4. PCR产物因操作不当极容易产生气溶胶污染,进而影响实验结果准确性。推荐将PCR反应体系配制区和PCR产物纯化检测区进行强制性的物理隔离;配备文库构建专用移液器等设备;定时对各实验区域进行清洁(推荐使用ThermoFisher公司的DNAZapTM高效核酸去除喷雾),以保证实验环境的洁净度。
5. 本产品仅用作科研用途!
本试剂盒适用于DNA甲基化 (DNA 5mC)研究,针对的DNA投入量为1-200 ng,也提供了应用于RNA甲基化 (RNA 5mC)的可能性。
1. eTET1为二价金属依赖性DNA双加氧酶,因此对氧化体系中EDTA较为敏感。请不要用包含EDTA的缓冲液溶解DNA材料。若使用EDTA的缓冲液溶解DNA材料,我们建议进行一轮DNA回收进行纯化,或者对eTET1 Enhancer的投入量进行重新滴定,以达到eTET1最佳的氧化效果。
2. eTET1 Enhancer的容易被氧化,收到后建议分装保存于-20°C。短时间内不用,建议-80°C保存。
一、eTET1氧化甲基化胞嘧啶 (5mC)过程
图1 eTET1氧化甲基化胞嘧啶 (5mC)过程
1. 将表中试剂解冻后颠倒混匀,置于冰上备用。配制eTET1氧化反应体系:
名称 |
体积 (μL) |
DNA模板(不含EDTA,若含EDTA,见注意事项1) |
24-25 (1-100 ng) |
10× eTET1 Buffer |
3 |
10× eTET1 Enhancer |
1 |
eTET1 Enzyme Mix (5 mg/mL) |
1-2 |
总共 |
30 |
2. 37°C反应1.5 h。
3. eTET1活性(使用荧光抗体法对eTET1活性进行测定)
图2 eTET1活性与其他TET酶活性比较
HB211124