分子克隆作为分子生物学的一项成熟技术,几乎每个实验室都或多或少的会涉及。在分子克隆实验中,限制性内切酶是克隆必备产品,但大家也常常因为限制性内切酶的各种问题而感到烦扰。比如小翌常被问到的:
1
限制性内切酶种类这么多,不知道如何选择。
2
酶切不完全或出现乱切、错切的情况。
3
酶切速度慢,需要 1 h 甚至过夜酶切。
4
多酶切还需要选择多款酶切缓冲液。
针对第 1 个问题,小翌会简单介绍一下什么是限制性内切酶,不同内切酶的分类如何,让您对限制性内切酶有一个更全面的认识。
针对第 2~4 个问题,翌圣 FuniCut® 系列快速内切酶通过菌株改造,配合优化的工艺,可以轻松解决以上难题!
限制性内切酶是一种能够识别双链 DNA 分子中特定核苷酸序列,并在特定位置切割 DNA 链中的磷酸二酯键的一类酶,简称限制酶。
不同的限制性内切酶会识别不同的 DNA 序列,它可以在识别序列内或距识别序列不远的位置处切割DNA,酶切之后会形成不同类型的产物,如下图 1 中的 BamHI 形成 5’粘性末端产物,KpnI 形成 3’粘性末端产物,EcoRV 形成平末端产物。
图1.BamHI、KpnI、EcoRV 酶切示意图
限制性内切酶除了最常用于分子克隆实验中外,它还可以应用于疫苗研发生产、基因测序、SNP 鉴定、ddPCR 等领域。
限制性内切酶的命名主要是根据细菌的属名、种名、菌株或血清型、发现的顺序而定,以 BstEII 为例,命名规则如下表一所示:
表1.限制性内切酶的命名规则
根据结构的复杂程度、作用方式与辅因子的区别,限制性内切酶可分为四大类,下表二总结了各类的特点和典型酶种。
表2.不同限制性内切酶的区别
除了以上分类,根据识别和切割位点的异同可以分为3类,如下表三所示:
表3.同裂酶、异裂酶和同尾酶对比
产品特点:
1.快速酶切:5-15 min完成酶切,较常规酶切实验可减少1-2 h以上。
2.通用缓冲液:任意内切酶组合都能用同一缓冲液,多酶切反应更简便。
3.酶切效果:媲美进口品牌N*,且兼容其缓冲液。
4.直接电泳:提供红色Color缓冲液,酶切产物可直接点胶电泳,操作更简便。
5.精准酶切:即使过夜酶切,星号活性也极低。
性能展示:
1.在FuniCut® Buffer中,5 min完成单、双和三酶切
M: 1 kb DNA Ladder
1:FuniCut® EcoRI
2:FuniCut® EcoRI+KpnI
3:FuniCut® EcoRI+KpnI+SmaI
C:未酶切质粒对照(含多个酶切位点)
2.酶切效果媲美N*、T*进口品牌,并且与其buffer兼容性好
M:1 kb DNA Ladder
1:Yeasen BamHI+ Yeasen Buffer
2:Yeasen BamHI+ T* Buffer
3:T* BamHI+T* Buffer
4:Yeasen BamHI+ N* Buffer
5:N* BamHI+N* Buffer
D:未酶切质粒对照(含2个BamHI位点)
3.过夜酶切,星号活性极低
图4.分别使用翌圣、T*公司、N*品牌的HindIII、NheI、PstI、XbaI、XhoI快速内切酶,以λDNA为底物,按照各品牌推荐的实验体系,进行过夜酶切(16 h),酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳。
4.高度冗余,轻松应对一定程度的过量底物
图5.以 FuniCut® EcoR I、Eag I、XbaI、Sac I快速限制性内切酶,分别以1 μg、1.5 μg质粒为底物,酶切5 min,酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳。
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