面对突发性、传染性强、不明病因的疾病,需要可靠、快速手段锁定病原。毫无疑问,mNGS将病原一网打尽并在24h内出具报告,成为病原检测的一把利剑。mNGS不需要培养,直接对样本核酸进行高通量测序,能够快速、无偏差的检测临床样本中的全部病原。其检测流程可以分为5个步骤:核酸提取、文库构建、上机测序、生信分析与报告解读。
mNGS检测流程图
翌圣 mNGS湿实验完整解决方案
宏基因组建库性能
主推产品:Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for Illumina®(Cat#13490)
产品特点:
1)起始兼容广:适用500pg-1μg的gDNA、全长cDNA等样本
2)操作简单:片段化/末修/加A一步完成,建库时间低至3h
3)极低背景:工艺优化,严苛质检,背景菌残留低,特别适合病原建库
产品性能:
1)建库性能:不同批次13490试剂盒,酶切 4℃1min;30℃ 20min;72℃ 20min;4℃ Hold,结果表明,不同类型样本,不同投入量情况下,均能建库成功
表1、不同样本、不同起始量样本文库产出
图1、不同样本、不同起始量样本文库大小
2)背景残留:两个批次13490试剂盒(C、S),小牛胸腺DNA,500 pg、1μg Input 酶切时间20min,14cycles,illumina,PE150,20M reads/样,结果表明,两个批次背景菌残留菌较低,批次间稳定建较好
图2、两个批次试剂500 pg、1μg Input背景菌残留结果
产品详情
分类 |
产品名称 |
产品编号 |
规格 |
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DNA建库 |
机械法建库 |
12199ES08/ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T |
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13310ES16/ES96 |
16 T/96 T |
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酶切法建库 |
Hieff NGS® OnePot Ⅱ DNA Library |
13490ES08/ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T |
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Hieff NGS® OnePot II DNA Library |
13509ES16/ES96 |
16 T/96 T |
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酶切PCR-free建库 |
Hieff NGS® OnePot Pro PCR-Free DNA |
12209ES08//ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T |
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转座酶建库 |
12206ES08/ES24/ES96; 12207ES08/ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T; 8 T/24 T/96 T |
宏转录组建库性能
主推产品:Hieff NGS® Fast RNA Library Prep Kit for Illumina®(Cat#12304)
产品特点:
1) 起始兼容广:10~500 ng RNA建库
2) 极速建库:将传统约3.5h建库时间缩短到3 h
3) 极低背景:工艺优化,严苛质检,背景菌残留低,特别适合病原建库
产品性能:
1)Control为12253+12252(常规RNA建库),不同起始量293 RNA 为样本建库测序,结果表明,不同起始量文库产出、基因表达数量检出均正常
表2、不同起始量RNA文库产出
图3、不同起始量RNA建库基因表达数量
2)不同起始量293 RNA ,illumina,PE150,20M reads,结果表明,大肠残留均较低
图4、不同起始量ENA建库,大肠残留检测
产品详情
分类 |
产品名称 |
产品编号 |
规格 |
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RNA建库 |
rRNA去除/珠蛋白去除 |
12258ES08//ES24/ES96 12259ES08//ES24/ES96 12260ES08/ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T; 8 T/24 T/96 T; 8 T/24 T/96 T |
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常规RNA建库 |
12252ES08/ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T |
||
13333ES08//ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T |
|||
极速RNA建库 |
12304ES08/ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T |
RNA&DNA共建库性能
主推产品:Hieff NGS® ds-cDNA Synthesis Kit(Cat#13488)
Hieff NGS® OnePot cDNA&gDNA Library Prep Kit(Cat#13502)
产品特点:
1) 起始兼容广:500pg-1μg RNA、DNA均能建库成功
2) 模块自由组合:Cat#13502可进行DNA建库,搭配Cat#13488可进行DNA&RNA共建库,模块灵活搭配,经济便捷
3) 极速建库:3h内完成共建库
产品性能:
1)建库性能
不同起始量标准品RNA、小牛gDNA进行建库测序,500pg-1μg RNA、DNA均能建库成功
表3、不同gDNA投入文库产出
表4、不同RNA投入文库产出
2)背景残留
表5、不同gDNA投入背景残留
表6、不同RNA投入背景残留
产品详情
分类 |
产品名称 |
产品编号 |
规格 |
|
DNA&RNA共建库 |
RNA一、二链合成 |
Hieff NGS® ds-cDNA Synthesis Kit |
13488ES08/ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T |
Illumina&MGI DNA建库 |
Hieff NGS® OnePot cDNA&gDNA Library Prep Kit |
13502ES08/ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T |
tNGS多重扩增试剂
主推产品:Hieff® HG Multiplex PCR Master Mix Library Prep Kit (Cat#13283)
产品特点:
1) 性能优:高均一性、高特异性和高灵敏度
2) GC兼容广:兼容GC含量在25%-70%
3) 性能优:高均一性、高特异性和高灵敏度
4) 操作简洁:预混液包含除引物和DNA模板之外所有组分
产品性能:
YS自设panel 35对GC 70-80;95对GC 27-72.5; 130对GC 27-80,和竞品A、B测序比较,结果显示,GC含量在25%-70%左右基因区域均得到稳定扩增、均一性优于竞品
表7、不同GCpanel扩增测序结果
图5、不同GC覆盖结果
产品详情
分类 |
产品名称 |
产品编号 |
规格 |
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tNGS(多重PCR)建库 |
扩增Mix |
13283ES03/ES08/ES50/ES60/ES76 |
1 mL/5×1 mL/50 mL/250 mL/500 mL |
建库必备
分类 |
产品名称 |
产品编号 |
规格 |
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13519ES04/ES16;13520ES04/ES16 |
48×4 T/48×16T; 48×4 T/48×16T |
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13360ES02/ES04/ES96; 13361ES02/ES04/ES96; 13362ES02/ES04/ES96 |
8×2 T/8×4 T/8×100 T; 16×2 T/16×4 T/16×100 T; 96×2 T/96×4 T/96×100 T |
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12412ES02; 12413ES02 |
96×2 T; 96×2 T |
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13451ES02/ES04; 13452ES02/ES04; 13453ES02/ES04; 13454ES02/ES04; |
48×2 T/48×4 T; 48×2 T/48×4 T; 48×2 T/48×4 T; 48×2 T/48×4 T |
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文库定量 |
Qubit定量 |
12642ES60/ES76 |
100 T/500 T |
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12640ES60/ES76 |
100 T/500 T |
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qPCR定量 |
Hieff NGS® Library Quantification Kit for Illumina®, |
12302ES05 |
500 T |
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Hieff NGS® Library Quantification Kit for Illumina®, |
12307ES09 |
6×96 μL |
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磁珠 |
DNA纯化 |
12601ES03/ES08/ES56/ES75 |
1 mL/5 mL/60 mL/450 mL |
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RNA纯化 |
12602ES03/ES08/ES56/ES75 |
1 mL/5 mL/60 mL/450 mL |