DNA建库必备磁珠——你选对了吗？
背景介绍
磁珠是高通量测序过程必备产品，通过磁颗粒活性基团在一定条件下可与核酸结合和解离的原理，将样本中目的片段分离。可实现对核酸样本的高通量自动化操作，广泛应用于基因测序以及分子诊断领域。
商业化磁珠产品体系一般包含：磁珠、聚乙二醇（PEG）、盐离子等。基于SPRI(Solid Phase Reversible Immobilization )技术， DNA在一定浓度的PEG存在条件下，NaCl或MgCl2促进条件下，DNA分子构象会发生急剧变化，会暴露出磷酸骨架上大量的带负电荷的磷酸基团，与表面带负电荷的羧基磁珠结合。带负电磷酸基团借由解离的盐离子（如Na+）与羧基形成离子桥，使DNA被特异性吸附到羧基磁珠表面。利用磁珠的磁性，可通过外加磁场进行收集洗脱，不同长度的DNA片段可以被选择性的沉淀出来。
图1. 磁珠结构示意图与磁珠吸附DNA原理示意图
产品描述
Hieff NGS® DNA Selection Beads基于SPRI (Solid Phase Reverse Immobilization)原理，配合精心优化过的缓冲体系，可用于二代测序文库构建过程中的DNA片段分选、纯化。本产品可适用于各品牌的DNA、RNA建库试剂盒，和目前广泛使用的AMPure XP Beads使用方式相同，片段回收效率和文库大小分布均与AMPure XP Beads高度吻合。
产品特点
» 品质保证：采用进口原材料，品质高度稳定。
»无缝替换：产品原理，产品操作与实验结果与AMPure XP保持高度一致。
»兼容性高：兼容目前市面上所有的DNA/RNA建库试剂盒。
»批次稳定：严格的批次性能与稳定性质控，单次能产20L。
操作流程
图2. DNA分选操作示意图
性能展示
» 回收效率与XP高度一致
相同小牛胸腺基因组DNA，分别使用Yeasen磁珠与进口XP磁珠，在不同分选比列条件下， 片段大小与回收产量高度一致。
|
品牌 |
磁珠比例 |
测试值1 |
测试值2 |
平均值 |
回收效率对比 |
|
XP |
1.8x |
14.4 |
14.8 |
14.6 |
0.99 |
|
Yeasen |
14.8 |
14 .8 |
14.8 |
||
|
XP |
0.8x |
13.2 |
13.1 |
13.15 |
1.04 |
|
Yeasen |
12.5 |
12.7 |
12.6 |
||
|
XP |
0.6x |
10.7 |
9.18 |
9.94 |
0.91 |
|
Yeasen |
11.0 |
10.8 |
10.9 |
||
|
XP |
0.5x |
9.26 |
9.88 |
9.57 |
1.27 |
|
Yeasen |
6.58 |
8.46 |
7.52 |
» 分选效果与XP一致
利用模式样本，用XP磁珠和Yeasen磁珠做平行实验，Yeasen磁珠分选效果与Beckman磁珠对比，二者回收效率，分选片段大小基本一致。
图3. 磁珠分选效果与AMPure XP磁珠对比
» 批次间稳定性好
Yeasen三个批次磁珠的回收效率高度一致，批间稳定性佳。
|
样本 |
测试人 |
Input（ng） |
纯化（1.8×） |
||
|
纯化后（ng） |
回收率% |
平均回收率 |
|||
|
B-YS |
测试人1 |
169.5 |
159.75 |
94.25% |
94.5% |
|
C-YS |
162 |
95.58% |
|||
|
D-YS |
158.75 |
93.66% |
|||
|
B-YS |
测试人2 |
169.5 |
155 |
91.45% |
91.94% |
|
C-YS |
154.25 |
91% |
|||
|
D-YS |
158.25 |
93.36% |
|||
» 性价比更高
相同规格产品，Yeasen磁珠价格远低于AMPure XP价格，性价比更高。
价格对比
图4. Yeasen磁珠与AMPure XP磁珠价格对比
订购信息
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类型 |
名称 |
货号 |
规格 |
|
完美替换XP |
12601ES03 |
1 mL |
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12601ES08 |
5 mL |
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12601ES56 |
60 mL |
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|
12601ES75 |
450 mL |
HB210802
