最近，有小伙伴私信小翌，抱怨转录组建库，最后得到的有效信息和耗费的财力、物力、人力、时间相比，简直是九牛二毛。归根到底，竟是rRNA惹的祸。

转录组（transcriptome）是指在某一特定生理条件下，细胞、组织或者生物体内所有转录产物的集合，即转录出来的所有RNA的总和，包括编码RNA（mRNA）和非编码RNA（tRNA、rRNA、miRNA、lncRNA、circRNA）等不同类型的RNA分子，其中，rRNA约占RNA总量的80%以上，是最多的一类RNA。

图1. 总RNA中各种RNA占比饼状图

 

rRNA作为总RNA中最丰富的成员，提供的转录本信息却少之又少，且检测过多会掩盖其它基因的表达丰度，从而增加低丰度转录本的检测难度。因此，通常在测序之前从总RNA样品中去除rRNA，rRNA去除的效率也被视为最大化读取到转录物的关键因素。

 

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新品简介

 

 

翌圣生物最新推出植物rRNA去除试剂盒Hieff NGS^® MaxUp rRNA Depletion Kit (Plant)（#12254），满足客户rRNA去除的多元化需求，致力于将转录本信息读取做到最大化。

 图2. 植物rRNA去除试剂盒

Hieff NGS^® MaxUp rRNA Depletion Kit (Plant)利用RNase H消化法去除植物来源总RNA中的核糖体RNA（包括细胞质18S、25S rRNA，线粒体18S、26S rRNA，叶绿体16S、23S rRNA）以保留信使RNA（mRNA）和其它非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析mRNA和非编码RNA，可显著提高测序结果中有效数据比例，也可用于cDNA合成或其它下游应用。

 

 

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产品特点

 

 

 

图3. 植物rRNA去除试剂盒特点

 

 

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操作流程

 

 

图4. 植物rRNA去除操作流程

 

 

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产品数据

 

 

1、不同起始量，rRNA的去除效率测试

不同Input量的拟南芥叶片RNA，使用12254进行rRNA去除后衔接12251构建链特异性文库，并进行 Illumina 双端测序（2 × 150 bp），分析下机数据中rRNA的占比。结果表明：测试的所有起始量均能有效去除rRNA。

图5. 不同投入量，rRNA去除效率图

2、重复实验相关性测试

1μg拟南芥叶片RNA，使用12254进行rRNA去除后衔接12251构建链特异性文库，实验进行3次重复。文库分别进行 Illumina 双端测序（2 × 150 bp），分析下机数据不同转录本的表达量。结果表明：3次重复转录本表达相关性保持一致。

 

图6. 植物rRNA去除试剂重复实验相关性测试图

3、不同投入量相关性测试

不同Input量的拟南芥叶片RNA，使用12254进行rRNA去除后衔接12251构建链特异性文库，并进行 Illumina 双端测序（2 × 150 bp），分析下机数据不同转录本的表达量。结果表明：测试的所有起始量转录本表达相关性保持一致。

图7. 植物rRNA去除试剂不同投入量相关性测试图

4、多个物种的rRNA去除效率测试

不同物种来源的1 μg Total RNA，使用12254进行rRNA去除后衔接12251构建链特异性文库，同时构建未去除的文库，并进行 Illumina 双端测序（2 × 150 bp），分析下机数据不同物种在去除前后rRNA的占比。结果表明：针对多种植物来源RNA，该试剂盒均能有效去除rRNA。

图8. 多物种rRNA去除效率测试图

好啦，产品介绍到这里就结束啦！性能如此优秀，是不是心动的感觉？心动不如行动，小伙伴们快来点击申请领取试用吧，数量有限（限领20），先到先得哦。也欢迎小伙伴们积极向小翌反馈使用效果，反馈有奖哦。

 

HB200727