研发背景
RT-PCR是常用到的实验手段,cDNA的质量关乎qPCR、PCR等实验的成败。看似简单的实验,但总是不可避免的碰到一些实验问题:
1)RNA浓度低,逆转录效果差,Ct值不理想;
2)RNA具有二级结构或GC含量高导致逆转录失败;
3)逆转录酶的合成长度达不到要求;
4)逆转录时间太长,严重影响实验进度;
5)cDNA质量差,基因扩增失败...
基于以上易出现的实验问题,Yeasen在Hifair® II Reverse Transcriptase基础上开发了Hifair® III Reverse Transcriptase,其cDNA合成速度快,热稳定性大幅度提高,可耐受高达65℃的反应温度,适合具有复杂二级结构的RNA模板的逆转录。同时,该酶增强了与模板的亲和力,非常适合少量模板以及低拷贝基因的逆转录。
Hifair® III系列逆转录产品选择指南
全长cDNA合成 |
全长cDNA合成 |
Real Time RT-PCR 反转录预混液 |
Real Time RT-PCR反转录预混液 (基因组去除) |
|
产品名称 |
Hifair® III Reverse Transcriptase |
Hifair® III 1st Strand cDNA Synthesis Kit (gDNA digester plus) |
Hifair® III 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix |
Hifair® Ⅲ 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR (gDNA digester plus) |
产品货号 |
11111 |
11139 |
11137 |
11141 |
产品形式 |
单酶 |
试剂盒 |
即用型预混液 |
即用型预混液 |
引物形式 |
自备 |
自选 |
Oligo dT和Random primer混合物 |
Oligo dT和Random primer混合物 |
基因组去除 |
- |
+ |
- |
+ |
产品特点
1、cDNA合成速度快,大大缩减逆转录时间;
2、热稳定性大幅度提高,可耐受高达65℃的反应温度,适合具有复杂二级结构的RNA模板的逆转录;
3、增强了与模板的亲和力,非常适合少量模板以及低拷贝基因的逆转录;
产品性能
1、逆转录反应温度达55℃,耐受65℃高温
图1. 逆转录反应温度达55℃,耐受65℃高温。反应温度55℃可满足常规模板及二级结构模板的转录,高GC模板可适当提高到65℃反应。
2、延伸性能优越,可合成长达19.8 kb的cDNA
图2. 最长可合成19.8kb的cDNA。 RNA 投入量为500ng, A、B、C分别为经过 Hifair® III 1st Strand cDNA Synthesis Kit(11139) gDNA消化、gDNA消化跳过、T品牌Kit逆转录后,以cDNA为模板扩增DYNC1H1(19.8kb)的结果。逆转程序为各产品的标准逆转录程序。综上,Hifair® III Reverse Transcriptase可合成长达19.8kb的cDNA。
3、cDNA合成速度较快,5min内可合成6kb的cDNA
图3. cDNA合成速度较快,5min内可合成6kb的cDNA。以293T细胞的 RNA为模板,按说明书标准程序进行逆转录,逆转录时间按5、10、15、30、45、60min分别进行设置。Hifair® III Reverse Transcriptase 5min内可合成6kb的cDNA,特异性和产量均优于V品牌。
4、适用性广泛,适合不同GC含量、不同表达丰度的基因
图4. 适合不同GC含量、不同表达丰度的基因。针对不同GC含量、不同表达丰度的基因,Hifair® III Reverse Transcriptase相对市面同类产品ct值更低,具有更高的逆转录效率。
5、宽广的模板线性范围内均可高效合成cDNA
GAPDH:E=98.47%,R2=0.998
RPS2:E=98.79%,R2=0.998
AGTPBP1:E=100.08%,R2=0.998
GLUD1:E=100.35%,R2=0.998
图5. Hifair® III Reverse Transcriptase在很宽的模板范围内均可高效合成cDNA。 Total RNA投入量为5pg-5μg,逆转录按说明书标准程序进行,所得cDNA对4个基因进行qPCR检测,结果显示扩增效率均在98-100.10%之间。说明在宽广的模板线性范围内均可高效合成cDNA。
6、高效去除基因组残留,让实验结果更准确
Positive control:25ng Mus gDNA作为模板进行qPCR检测。
实验1:25ng Mus gDNA,按说明书标准程序进行gDNA去除后逆转录(gDNA digester具备gDNA消化功能),所得产物进行qPCR检测。
实验2:25ng Mus gDNA,同时加入gDNA digester Mix和Hifair® III SuperMix处理(注意:该步骤可导致gDNA digester消化gDNA功能失效),按说明书程序逆转录后进行qPCR检测。
图6. 带有gDNA去除组分的产品可高效去除gDNA残留。 试剂盒中的gDNA digester组分可高效去除残留基因组,当加入10×Hifair® III Super buffer后,消化功能终止,可实现去除RNA模板中gDNA的干扰,保证定量结果准确。
7、RNA最大可投入12μL,有利于低浓度模板检测
1)残留基因组DNA去除 |
2)逆转录反应 |
||
组分 |
使用量 |
组分 |
使用量 |
RNase free ddH2O |
To 15 μL |
第1步的反应液 |
15 μL |
5×gDNA digester Mix |
3 μL |
4×Hifair® III SuperMix plus |
5 μL |
模板RNA |
Max:12 μL |
产品信息
产品名称 |
货号 |
规格 |
价格(元) |
11111ES92 |
10000U |
1426.00 |
|
11111ES93 |
50000U |
4626.00 |
|
Hifair® III 1st Strand cDNA Synthesis Kit (gDNA digester plus) |
11139ES60 |
100T |
1303.00 |
Hifair® III 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR (gDNA digester plus) |
11141ES10 |
100T |
1383.00 |
相关产品
产品定位 |
产品名称 |
货号 |
规格 |
促销价(元) |
销量高,明星定量产品 |
11201ES08 |
5mL |
498.00 |
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黑科技,彩色版通用型定量产品 |
11184ES08 |
5ml |
663.00 |
更多产品敬请详询400-6111-883
关于我们
翌圣生物成立于2009年,是致力于分子酶创新研发的国家高新技术企业,总部位于上海市浦东新区国际医学园区。公司围绕“解析分子酶结构与功能,拓展分子酶应用场景,解决生命科学领域与精准医疗领域试剂核心问题”为重点,开发分子生物学,高通量测序,细胞生物学及体外诊断相关的酶原料与试剂。秉承客户至上,合作分享,诚信务实,创新奉献的价值观,踏实服务于生命科学以及精准医疗领域。