在生命科学领域,随着测序技术的发展,测序工具不断推陈出新。华大智造凭借其独有的新型DNBseq™测序技术以及高准确性、低错误积累、低重复序列、低标签跳跃等特点被广泛应用。
华大BGISEQ测序平台整体流程主要分为三个步骤:核酸样本制备、DNB的制备/加载和上机测序分析。其中DNB(DNA Nanoball,DNA纳米球)技术是整个平台的核心,所谓DNB是指环状DNA分子通过滚环扩增得到DNB纳米球,随后进行加载测序的过程。单链环化DNA分子是DNB制备的前提。
图1.华大平台测序原理(图片来自华大智造官网)
DNA单链环化是将带有接头序列的双链DNA(double-stranded DNA,dsDNA),通过高温变性形成单链DNA(single-stranded DNA,ssDNA),在连接酶的催化下,splint oligo引物与ssDNA的两端互补配对。ssDNA两端连接形成单链环状DNA分子,后续用于构建MGI高通量测序仪专用的单链环状DNA文库。
图2.环化原理
新
品
介
绍
Hieff NGS® Fast-Pace DNA Cyclization Kit for MGI®是针对 MGI®高通量测序平台量身打造的模块化试剂盒,可以将接头连接后的PCR产物制备成适用于MGI测序仪专用的单链环状DNA文库。整体环化、消化和纯化流程可在1h内完成,可满足快速、高效的建库需求,也保证了文库构建的稳定性和重复性。
图4.翌圣环化试剂盒特色
图5.翌圣环化试剂盒操作流程
1、广泛的试剂盒兼容性——兼容目前市面上主流建库产品
1 ng小牛胸腺基因组DNA,使用市面上不同的建库试剂盒,分别搭配华大环化试剂盒与翌圣环化试剂盒,结果显示我司环化试剂盒同华大环化试剂盒效率相当,同时具有广泛的兼容性。
图6.不同建库试剂搭配翌圣/华大环化试剂盒对应环化效率
2、高效的环化效率——搭配我司建库试剂盒环化效率更高
不同样本使用我司华大平台建库试剂盒Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for MGI®(13310)(备注:加入超链接),分别搭配华大和翌圣的环化试剂盒。结果显示,我司成套产品的环化效率要比配套华大平台的环化效率更高。
图7.不同样本使用翌圣建库试剂盒搭配翌圣/华大环化试剂盒对应环化效率
产品信息 |
名称 |
货号 |
规格 |
环化试剂盒 |
13341ES16 |
16T |
|
13341ES96 |
96T |
产品信息 |
名称 |
货号 |
规格 |
全能型建库试剂盒 |
13310ES08/16/96 |
8/16/96T |
|
酶切法建库试剂盒 |
13321ES08/16/96 |
8/16/96T |
|
mRNA建库试剂盒 |
Hieff NGS® MaxUp II Dual-mode mRNA Library Prep Kit for MGI® |
13331ES08/16/96 |
8/16/96T |
环化试剂盒 |
13341ES08/16/96 |
8/16/96T |
|
rRNA去除试剂盒 |
12253ES08/24/96 |
8/24/96T |
|
接头 |
13360-62 |
4/16/100T |
|
磁珠 |
12601ES08/56/75 |
5/60/450mL |
|
Qubit定量 |
12640ES60/76 |
100/500T |