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RPA技术分子酶系列之核酸外切酶Ⅲ(Exo III):3’-5’方向的dsDNA外切酶,从dsDNA链的3’端逐个去除单核苷酸

 

重组酶聚合酶扩增(Recombinase Polymerase Amplification,RPA)是一种新型核酸恒温扩增技术,可以在37~42 ℃条件下,10~30 min内实现待测靶标的快速检测。它具有反应灵敏度高、特异性强、对仪器依赖程度低且可整合多种检测模式等优点,特别适用于基层和现场即时检测,可广泛应用于体外诊断、动物疫病、食品安全、生物安全、农业等领域。
图1.RPA等温扩增技术原理图[1]

 

目前常用的与RPA扩增相结合的检测方法有电泳法、荧光探针法、侧流层析试纸条(LF-RPA)、絮凝分析检测法,其中荧光探针法因操作简便、灵敏度高、特异性强、无需开盖处理产物(减少气溶胶污染)等优势,已发展为目前最常用的一种结合RPA扩增的检测手段。荧光探针法RPA主要在RPA扩增的基础上,加入了Exonuclease III和exo荧光探针,在RPA扩增过程中Exonuclease III会特异地切割荧光探针(THF位点),导致荧光基团与淬灭基团分开,荧光信号被检测到,通过荧光收集的仪器来实时监控荧光值的变化。翌圣特推出一款Exonuclease III(Cat#14525ES),为RPA扩增技术的广泛应用助力。
图2.EXO探针法检测原理图[2]

 

翌圣Exonuclease III

翌圣Exonuclease III是一种无碱基序列依赖性的核酸外切酶,该酶作用于双链DNA,从3’OH末端方向逐步切去单核苷酸。该酶能降解平滑末端、3’凹陷末端及有切口的DNA,但是不能降解3’-突出末端大于或等于四碱基的序列。此外,该酶也有RNase H、3’-磷酸酶、脱嘌呤/嘧啶(AP)位点特异性核酸内切酶活性。

 

产品应用

  • RPA扩增中荧光探针的降解,释放荧光信号;

  • 分子信号放大技术中双链DNA 3’平末端切割;

  • 单链特异性探针的制备;

  • 制备用于双脱氧测序的单链底物;

  • 双链DNA的非定向巢式缺失。

     

性能展示

  • 无核酸内切酶残留

 

图3.对翌圣Exonuclease III(Cat#14525ES)进行核酸内切酶残留检测,结果显示测试组与对照组条带无明显差异,说明翌圣Exonuclease III(Cat#14525ES)无核酸内切酶残留。

 

  • 应用于RT-RPA反应,对RNA病毒的检测限低至10 copies/T

图4.用翌圣Exonuclease III(Cat#14525ES)进行RT-RPA反应,扩增RNA病毒,检测限低至10 copies/T。

 

  • 应用于单克隆实验,提高单克隆阳性率

图5.使用翌圣Exonuclease III(Cat#14525ES)在单克隆实验前处理PCR回收产物,用于酶切去除产物中的短片段,提高单克隆阳性率。结果显示翌圣Exonuclease III(Cat#14525ES)可显著提高单克隆阳性率,且效果优于进口品牌A*的Exonuclease III产品。

 

 

翌圣RPA相关产品推荐

 

产品名称

产品货号

产品作用

Exonuclease III(100 U/μL)

14525ES

具有3’→5’外切酶活性,切断荧光探针中淬灭基团,释放荧光

Bsu DNA polymerase(Large fragment,5U/μL)

11078ES

结合引物与原始靶核酸序列互补合成新的DNA模板

T4UvsXRecombinase(2μg/μL)

11079ES

具有配对和链转移活性的重组酶

T4UvsY protein(2μg/μL)

11080ES

重组酶辅助因子,刺激T4UvsX的单链DNA依赖性ATP酶活性并降低活性所需的T4UvsX临界浓度

T4 gene 32 protein(gp 32)T4噬菌体基因32编码蛋白

11081ES

参与DNA复制、修复、重组与解链后的单链DNA结合,防止自杂交

Creatine Kinase(2μg/μL)肌酸激酶

14502ES

刺激ATP和肌酸分解为磷酸肌酸

 

参考文献:
[1] 施奕,徐昌平,余蓓蓓,卢亦愚,梅玲玲.重组酶聚合酶扩增技术研究进展[J].病毒学报, 2020,36(03):522-532.
[2] JiaLi, JoanneMacdonald, Stetten F. Review: a comprehensive summary of a decade development of the recombinase polymerase amplification[J]. The Analyst, 144.

400-6111-883