FFPE(Formalin-fixed,paraffin-embedding)，一般指人类或者动植物组织样本经福尔马林(目前应用最为广泛的固定剂为10%中性福尔马林)固定，石蜡包埋形成的切片或石蜡块。这种方式是目前长期保存病理样本的标准化方法。

福尔马林固定、石蜡包埋 (FFPE) 组织切片代表了珍贵的生物医学研究材料。FFPE样本堪称为病理科的“瑰宝”，它们承载着众多的疾病信息。

图1.FFPE样本

翌圣生物通过不断地打磨，将FFPE样本DNA提取的性能全面升级，采用独特的磁珠和精心优化的缓冲体系，面对不同降解程度的FFPE DNA片段，可最大限度的分离纯化高纯度DNA，同时可适配自动化提取仪，让提取如此简单！

MolPure^® Magnetic FFPE DNA Kit （Cat#18375ES）适用于福尔马林固定、石蜡包埋的组织中提取 DNA，可配合翌圣3种不同通量的自动化提取仪Auto-Pure32A/AP-48/AP-96，实现核酸的高通量提取。

图2：FFPE DNA的提取流程

不同类型的FFPE样本，包括小鼠心脏FFPE样本、肝脏FFPE样本、颈部软组织FFPE样本、甲状腺FFPE样本、肺部FFPE样本，样本的切片厚度为5μm，一次提取2卷；分别采用18375ES、竞品1和竞品2提取，每组3个重复；其中18375ES搭配翌圣AP-96自动化提取仪，提取的DNA用Qubit定量浓度，Nanodrop定量纯度，Qsep100评估大片段的占比。如图3-图5所示，18375ES提取的DNA得率、纯度、大片段占比都显著优于竞品1和竞品2。

图3.不同FFPE样本提取的 DNA得率

图4.不同FFPE样本提取的 DNA纯度（260/280）

图5.不同FFPE样本提取的 DNA大片段占比

采用标准品蜡卷（菁良）分别用18375ES、竞品1和竞品2提取DNA，DNA中含有5% EGFR T790M突变和5% EGFR L858R突变，各取200ng进行酶切法DNA建库（Cat#12195ES）和杂交捕获，三种试剂盒提取的DNA杂交捕获后的数据质量和突变位点检出率如图6所示，18375ES和竞品提取的DNA文库数据质量相当，突变检出率均在5%左右。

图6.不同FFPE样本提取的 DNA文库数据质量和突变位点检出率