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上新 | 磁珠法土壤/粪便DNA提取试剂盒，助力宏基因组学研究

 

宏基因组学是直接研究环境样品中的遗传学材料，主体研究对象是微生物群落的基因组，即所有微生物个体基因组的总和。对于微生物组学的研究，最常见的就是通过高通量测序技术对16SrDNA/18S rDNA/ITS等序列进行测序，从而获得样品中的微生物群落组成以及相对丰度，进而揭示环境样品中的物种组成，物种多样性特征，预测基因功能信息等。
 

图1.宏基因组学概貌（Berg et al. Microbiome (2020) 8:103）

 

环境样本，比如土壤、粪便、水体等样本中含有丰富的微生物，但这些样本成分复杂；

 

翌圣生物经过匠心打造，自主研发出高性能的磁珠法土壤/粪便DNA提取试剂盒，助力宏基因组学的研究！

 

 

产品介绍

 
MolPure® Mag Soil/Stool DNA Kit磁珠法土壤/粪便DNA提取试剂盒（Cat#18526ES）适用于土壤、粪便、水样、水体滤膜、细菌、真菌等环境样本基因组DNA的提取。采用独特的磁珠和精心优化的缓冲体系，可最大限度的分离纯化样本中的微生物基因组DNA。提取的核酸纯度高，质量稳定可靠，适用于各种下游应用实验，如酶切、PCR、建库等。配合磁珠法自动化提取仪器使用，可实现核酸的高通量提取。

 

 

产品特点

 
 

  • 操作便捷：室温操作，仅需1h内即可回收DNA；

  • 产量高：独特的研磨珠能高效裂解土壤微生物，释放更多DNA，最大限度地提高其产量；

  • 适用范围广：适合土壤、粪便、水体、滤膜、拭子等环境样本；

  • 纯度高：有效去除环境样本中腐殖酸、重金属离子等杂质，适用于各种下游应用实验，如酶切法建库。

 

 

 

操作流程

 

图2.土壤/粪便DNA提取操作流程图

 

 

产品性能

 
01
DNA的浓度和纯度
 
 
土壤、粪便、水体样本，分别用18526ES和竞品M进行DNA提取，其中18526ES搭配翌圣48通道自动化核酸提取仪使用，洗脱体积均为70μL，结果显示：18526ES相对竞品展现出更优异的DNA浓度和纯度。

 

图3.土壤/粪便/水样DNA的浓度和纯度

 

02
16S qPCR扩增
 
 

土壤、粪便、水体样本，分别用18526ES和竞品M进行DNA提取，各取相同体积的DNA溶液进行细菌16S qPCR扩增实验，结果显示，18526ES提取产物Ct值均小于竞品M。

 

图4 .土壤/粪便/水样DNA16S qPCR扩增结果

 

03
NGS文库构建分析
 
 

土壤样本和粪便样本，分别用18526ES和竞品M进行DNA提取，各取100ng DNA用翌圣一步法DNA建库试剂盒V2（Cat#12195ES）进行宏基因组建库，结果显示，18526ES提取的DNA文库产量和QC指标与竞品M相当，微生物种类数量优于竞品M。

 

图5.土壤/粪便DNA文库数据质量

 

 

 

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产品名称

产品货号

产品规格

MolPure® Mag Soil/Stool DNA Kit磁珠法土壤/粪便DNA提取试剂盒

18526ES20

20T

18526ES50

50T

18526ES70

200T

MolPure® Mag48 SoilStool DNA Kit FA 磁珠法48孔土壤/粪便DNA提取试剂盒FA（预封装）

18528ES48

48T

 

 

 

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产品应用

产品名称

产品编号

磁珠法石蜡包埋组织DNA提取

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18371ES

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18382ES

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18600ES

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18504ES

400-6111-883