无处不在的RNase污染
RNase(Ribonuclease,核糖核酸酶)是一类能够催化RNA降解为小分子RNA的核酸酶,广泛存在于真核、原核生物的所有细胞和组织中,通常有极强活性,RNA样本中微量的RNase污染足以导致其完全降解。实验室中RNase污染的主要来源有:
01 外源性污染源
实验中使用的水溶液、反应体系的各组分试剂、枪头等在内的实验耗材;
实验大环境的污染,RNase 存在于空气、灰尘和大多数物体表面;
实验人员的皮肤或唾液等。
02 内源性污染源
所有组织样品均含有内源性RNase。
如何从源头上避免RNase污染
RNase的无处不在,使得实验过程中,难以保存RNA样本的完整性,导致实验失败或影响RNA分析的结果。因此,从源头上避免RNase污染十分必要,一方面要严格控制外源性RNase的污染,另一方面要最大限度地抑制内源性的RNase。
01 控制外源性RNase污染的方法
1. 操作人员全副武装
在实验过程中戴手套可避免源自人手的RNase污染;触摸皮肤、门把手及普通物体表面后更换手套;
2. 使用专业仪器与试剂
RNA操作专用的移液枪;使用RNase-free的枪头和离心管;使用RNase-free的化合物与试剂;
3. 选择实验操作环境
远离/遮蔽通风孔或开放窗口,走动较少的区域作为RNase-free区域;
4. 其他注意的点
在RNA提取和分析期间,不要进行其他可能引起RNase污染的实验。
02 抑制内源性RNase活性的方法
1. 样本保存
组织取样后若不直接提取RNA,要及时用液氮迅速冷冻存于-80°C环境,并尽早进行实验,这样可使RNA的降解达到最少。
2. 添加抑制剂
在细胞裂解液中加入RNase抑制剂(RNase inhibitor),使破碎细胞与灭活RNase同步进行,最大限度地降低细胞破碎过程中所释放的RNase的活性。
RNase抑制剂可有效避免RNase污染
常见的RNase抑制剂有焦碳酸二乙酯(DEPC)、异硫氰酸胍、氧钒核糖核苷复合物(RVC)和RNA酶的蛋白质抑制剂(RNasin)。其中,DEPC和异硫氰酸胍具有一定的毒性,RVC对PCR聚合酶有抑制作用,不利于展开后续的实验。RNA酶的蛋白质抑制剂能够特异地与RNase以非共价键结合形成复合体,造成RNase失活,因不具有毒性,不影响后续PCR实验等优势,常被用来减少RNase的污染。目前,RNasin主要用于cDNA合成,体外转录,体外翻译,以及mRNA-protein复合物分离纯化等过程中保护RNA不被降解,还可用于特定RNase活性的鉴定等。
翌圣生物鼠源RNase抑制剂
翌圣生物Murine RNase Inhibitor(MRI)是以可溶形式在大肠杆菌中表达纯化的重组鼠源RNase抑制剂,能够广泛抑制各种类型RNase (RNase A, B, C) 可用于RT-PCR/RT-qPCR,解决体外转录中RNA降解问题,抑制RNA分离纯化过程中RNase的活性。与人源RNase inhibitor相比,Murine RNase Inhibitor不含人源蛋白中的两个对氧化非常敏感的半胱氨酸,因而具有更高的抗氧化活性,且更加适合于对高DTT敏感性的实验(如qPCR)。
图1. Yeasen Murine RNase Inhibitor(MRI, Cat#10603ES)产品图。
01 产品特点
广谱的RNase抑制活性:可抑制包括RNase A、RNase B、RNase C等在内的RNase。
兼容广泛的反应条件:在pH 5.0至9.0条件下和25℃至60℃的温度下都具有活性,适用于热稳定型逆转录酶(55℃-60℃)。
兼容广泛的下游实验:对SP6、T7或T3 RNA聚合酶,AMV、M-MLV逆转录酶和Taq DNA聚合酶酶活性无影响。
规模化量产:单次生产达20亿U产能,确保了产品的均一性、稳定性和供货的及时性。
批间稳定性:成熟的蛋白表达和纯化平台,符合ISO13485质量管理体系,根据质量标准进行质控检测,保证批次间产品的稳定性。
02 产品性能
无核酸外切酶、切口酶及RNase残留
图2. MRI核酸外切酶(20 μl反应体系中加入200 U MRI和0.5 μg λDNA-HindⅢ digest,37℃孵育4小时,琼脂糖凝胶电泳DNA谱带不发生变化)、切口酶残留(20 μl反应体系中加入200 U本酶和0.5 μg质粒DNA,37℃孵育4小时,琼脂糖凝胶电泳DNA谱带不发生变化)检测。
注:N代表阴性对照;1、2、3为3组平行实验。
图3. 20 μl反应体系中加入200 U MRI和0.5 μg 293T RNA,37℃孵育4小时,琼脂糖凝胶电泳RNA谱带不发生变化,则无RNase残留。
注:N代表阴性对照;1、2、3为3组平行实验。
2. RNase抑制能力媲美进口品牌
图4. 以甲流病毒培养液为模板,使用Hifair® V Multiplex One Step RT-qPCR Probe Kit (UDG Plus)(Cat#13650ES)进行RT-qPCR反应,验证MRI消化RNaseA能力,结果表明翌圣MRI对RNaseA的抑制能力媲美同类国际竞品。
注:Yeasen Control:8 U MRI+0 ng RNaseA;Yeasen:8 U MRI+60 ng RNaseA;R* Control:8 U同类竞品+0 ng RNaseA;R*:8 U同类竞品+60 ng RNaseA。
FAQ
1. Murine RNase inhibitor是否会影响RT-PCR和qRT-PCR实验?
答:不会影响。经质量测试,每批次Murine RNase inbitior均不含有基因组污染,可适用于RT-PCR和qRT-PCR实验。
2. 在使用Murine RNase inhibitor配制反应体系时,有什么注意事项?
答:配制体系时,在其他可能引入RNase污染来源的组分加入前,RNase inhibitor可首先加入。
3. Murine RNase inhibitor具有核酸内切酶及核酸外切酶活性吗?
答:无核酸内切酶及核酸外切酶活性,有助于提高产物得率。
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