等温扩增技术可在恒温条件下实现扩增特异性核酸序列的目的,因无需专用的仪器设备、扩增时间短、灵敏度高等特点,在现场检测和即时诊断中显示了良好的应用前景,非常适于分子诊断工具的开发。
根据不同的扩增原理,等温核酸扩增技术可分为很多类,主要包括环介导等温扩增(LAMP)、交叉引物扩增 (CPA)、链替代扩增 (SDA)、重组酶聚合酶扩增 (RPA)、依赖核酸序列的扩增 (NASBA)、滚环扩增 (RCA)和依赖解旋酶的扩增 (HAD)等。目前最常见、应用最广的当属日本学者Notomi等在2000年开发的环介导核酸等温扩增技术LAMP,其技术特征是针对靶基因上的6个区域设计4~6条引物,利用链置换型的Bst DNA聚合酶在60℃~65℃恒温条件下进行扩增反应,在15-60 min内实现目标序列109-1010倍的扩增。
针对LAMP/RT-LAMP技术,翌圣生物可提供高品质等温扩增核心酶原料,包括链置换Bst DNA聚合酶、MMLV逆转录酶、防污染UDG酶、RNase抑制剂,目前已获得众多客户的好评,完美替换进口品牌,为客户解决了货期和成本问题。
翌圣-链置换Bst DNA聚合酶
翌圣生物Bst Plus DNA Polymerase(Cat#14402ES)是将缺少5′→3′外切核酸酶结构域的Thermophilic Geobacillus sp DNA 聚合酶基因在E.coli 中表达纯化而得。该酶链置换能力强,具备高灵敏度、高扩增效率、高dUTP耐受性的优势,可广泛应用于基于等温扩增技术的病原体即时检测。
灵敏度低至50 copies/T,反应时间<15 min(荧光定量RT-LAMP法)
图1. 用翌圣Bst Plus DNA Polymerase进行RT-LAMP反应,扩增新 冠病毒。25 μL反应体系中,50 copies/T的检出率达100%,反应时间<15 min。
高dUTP耐受性
使用翌圣Bst Plus DNA Polymerase进行RT-LAMP反应,扩增新 冠病毒(20 copies/T)。在推荐反应方案中引入dUTP/UDG酶防污染系统,使用dUTP替换dTTP。对比全U(35 mM)替换(红色扩增曲线)与T:U = 1:1(蓝色扩增曲线)的扩增结果发现,在反应体系中添加dUTP对Bst Plus DNA Polymerase的灵敏度及扩增效率无影响,该酶具有较高的dUTP耐受性。
图2. 翌圣Bst Plus DNA Polymerase高dUTP耐受性验证结果
翌圣-MMLV逆转录酶
翌圣生物Hifair® Ⅲ Reverse Transcriptase 第三代耐热逆转录酶(Cat#11111ES、14601ES)cDNA合成速度快,热稳定性高,可耐受高达65℃的反应温度,适合具有复杂二级结构的RNA模板的逆转录。同时,该酶增强了与模板的亲和力,非常适合少量模板及低拷贝基因的逆转录。此外,本品可扩增长达19.8 kb的cDNA。
反应温度55℃,耐受65℃高温
图3. 以300 ng 297T细胞总RNA为模板,使用Hifair® Ⅲ Reverse Transcriptase(Cat#11111ES)在42~65℃下进行反转录。取1μL cDNA为模板,使用2×Hieff Canace® Gold PCR Master Mix高保真酶预混液(Cat#10149ES)扩增不同类型模板结果图。
线性检测范围广,Total RNA 10 pg-5 μg
图4. 以10 pg~5 μg297T细胞总RNA为模板,使用Hifair® Ⅲ Reverse Transcriptase(Cat#11111ES)合成cDNA。取1μL cDNA为模板,使用Hieff UNICON® Power qPCR预混液(Cat#11195ES)扩增PTTG1基因。
翌圣-防污染UDG酶
翌圣生物Uracil DNA Glycosylase(UDG/UNG) , 1 U/μL(Cat#14455ES)能催化水解含有尿嘧啶的DNA链的尿嘧啶碱基和糖磷酸骨架的N-糖苷键,释放游离尿嘧啶,无核酸酶、切口酶、RNase酶残留,可轻松控制气溶胶污染。本品适用于PCR、qPCR以及RT-qPCR等常见分子生物学体系。
消化能力强
0.025 U防污染UDG酶即可完全消化360 ng 200 bp的dU-DNA。
图5. 0.05 U、0.025 U、0.0125 U、0.00625 U、0.003125 U防污染 UDG酶与360 ng 200 bp dU-DNA在25℃孵育30 min电泳结果图。
兼容性强
完美兼容下游qPCR以及RT-qPCR反应体系,在高投入量下对检测体系无影响。
图6. 不同浓度防污染UDG酶可兼容qPCR以及RT-qPCR反应体系,对DNA及RNA模板扩增无抑制。
翌圣-RNase抑制剂
翌圣生物Murine RNase Inhibitor(Cat#10603ES、10610ES、14671ES)是以可溶形式在大肠杆菌中表达纯化的重组鼠源RNase抑制剂,能够广泛抑制各种类型RNase (RNase A, B, C)。经RT-PCR、RT-qPCR检验,本产品能与各种逆转录酶及DNA Polymerase兼容。
高效RNase抑制能力
图7. 1μL Murine RNase inhibitor(40 U/µL, Cat#10603ES)可有效抑制5ng RNase,1μg HEK细胞总RNA电泳结果图。
Murine RNase Inhibitor在qPCR实验中表现优于国际同类产品
表8. 不同浓度梯度的 MRI 与 100 ng RNase A 共孵育以封闭 RNase A 的活性,再消化处理 1 μg RNA。用一步法 RT-qPCR 的方法检测 RNA的降解情况,以此来判断 MRI 对 RNase A 的封闭效果。PC 代表体系中仅RNA不加 RNase A 和 MRI。
产品选择指南
产品定位 |
产品名称 |
货号 |
Bst酶 |
14402ES |
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Bst酶冻干粉-Lyophilized Bst Plus DNA Polymerase (60 U/μL,Glycerol-Free) |
14405ES |
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RT-LAMP预混液 |
13762ES |
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pH显色法可冻干-RT-LAMP pH Sensitive Dye Chromogenic Version Freeze-Dryable Kit(含冻干保护剂) |
13920ES |
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13906ES |
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逆转录酶 |
11111ES |
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三代逆转录酶不含甘油Hifair® III Reverse Transcriptase,600U/μL,Glycerol-free |
11297ES |
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防污染UDG酶 |
14455ES |
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14001ES |
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鼠源RNase抑制剂 |
10603ES |
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10703ES |