近年来,等温扩增技术因其无需专用的仪器设备、扩增时间短、灵敏度高等特点,在现场检测和即时诊断中显示了良好的应用前景。其中,环介导等温扩增技术(loop mediated isothermal amplification, LAMP)使用具有链置换特性的Bst DNA聚合酶,可在恒温条件(60-65℃)下高效、快速、特异性扩增靶标序列,在15-60 min内即可实现109-1010倍的扩增,目前已广泛应用于临床传染病诊断、环境监测、食品安全检测等领域。
表1. 常规PCR技术与等温扩增技术对比
常规PCR 技术与等温扩增技术(IAT)对比 |
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特点 |
PCR |
IAT |
扩增 |
3步循环:95℃变性;-60℃引物退火;72℃聚合延伸 |
通常在60-65℃下恒温进行 |
变性 |
需要通过高温进行解链,以便引物结合 |
直接通过链置换活性DNA聚合酶完成 |
反应时间 |
至少需要90min获得结果 |
一般可在30min内获得结果 |
反应仪器 |
需要热循环仪 |
无需专用热循环仪,简单的水浴锅即可 |
结果观察 |
通过凝胶电泳后才能观察到核酸片段 |
通过比色/目视比浊法可直接观察结果 |
灵敏度 |
可检测纳克级别靶标 |
可检测飞克级别靶标 |
优势 |
技术成熟;通量较大;敏感性、特异性高 |
用时短;设备要求低,价格便宜;程序简单,实现全自动、一体化较简单 |
劣势 |
操作繁复,时间较长;对仪器的精密度、可靠性要求高;影响扩增因素较多 |
通量较低;引物设计难度大;试剂价格较高 |
图1. 翌圣Hieff® Bst Plus DNA Polymerase(Cat#14402ES)检测灵敏度测试结果
图2. 翌圣Hieff® Bst Plus DNA Polymerase(Cat#14402ES)高dUTP耐受性验证结果
图3. 翌圣Hieff® Bst Plus DNA Polymerase(Cat#14402ES)稳定性验证结果
图4. 通过改造Bst DNA 聚合酶的热稳定性,相比母本,突变体M22的Tm值提高了2.9℃,能耐受70℃高温RT-LAMP反应
产品定位 |
产品名称 |
产品货号 |
高灵敏度Bst酶 |
14402ES |
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适合RT-Lamp的逆转录酶 |
11111ES |
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RNase抑制剂 |
10603ES |
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防污染UDG酶 |
UCF.ME® Uracil DNA Glycosylase(UDG/UNG), heat-labile, 1 U/μL |
14466ES |
荧光染料法RT-Lamp试剂盒 |
13762ES |
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pH指示剂法RT-Lamp试剂盒 |
13906ES |
注:翌圣单酶系列均可提供高低浓度、无甘油等不同产品形式。
参考文献
[1] Njiru ZK, Mikosza AS, Matovu E, et al. African trypanosomiasis: sensitive and rapid detection of the sub-genus Trypanozoon by loop-mediated isothermal amplification (LAMP) of parasite DNA. Int J Parasitol. 2008;38(5):589-599. doi:10.1016/j.ijpara.2007.09.006.
[2] Verkooyen RP, Luijendijk A, Huisman WM, et al. Detection of PCR inhibitors in cervical specimens by using the AMPLICOR Chlamydia trachomatis assay. J Clin Microbiol. 1996;34(12):3072-3074. doi:10.1128/jcm.34.12.3072-3074.1996.
[3] Fereidouni SR, Starick E, Ziller M, et al. Sample preparation for avian and porcine influenza virus cDNA amplification simplified: Boiling vs. conventional RNA extraction. J Virol Methods. 2015;221:62-67. doi:10.1016/j.jviromet.2015.04.021.