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中草药DNA/RNA提取的难点与解决方案

14253

2026-03-18

一、中草药分子检测背景

中草药存在同名异物、同物异名、掺伪混充等问题,传统性状、显微与理化实验方法难以精准鉴定。DNA条形码、PCR、测序等分子检测技术,以核酸为依据可以实现精准基因鉴定,而高质量DNA/RNA是分子检测成功的前提,中草药样本的特性导致其核酸提取难度显著高于动物与普通植物。

二、中草药DNA/RNA提取核心难点

1. 次生代谢产物干扰

中草药富含多糖、多酚、单宁、色素、脂类,多糖会与DNA共沉淀会形成难溶解的胶状杂质,影响核酸释放;多酚会氧化为醌类,与核酸共价结合导致褐变、降解并抑制PCR酶,影响下游扩增反应。

2. 样本降解严重

药材多为干燥、陈化、加工品,细胞破裂后核酸酶会持续降解核酸,DNA多为短片段,RNA极易完全降解。

3. 细胞壁与组织结构坚硬

木质化、纤维化程度高,常规研磨破碎不充分,核酸释放效率低。

三、解决方案

(一)样本前处理

  • 优先选用幼嫩组织,幼嫩组织的次数代谢产物和木质化、纤维化程度低,干燥药材用75%乙醇擦拭表面灭菌
  • 液氮快速研磨成细粉(液氮可以保证低温和研磨充分),避免反复冻融,RNA提取全程低温、无RNase操作。

图 一边倒液氮一边研磨植物

(二)去除多酚与褐变

  • 裂解液加入β-巯基乙醇、PVP、半胱氨酸,阻断氧化并结合多酚。
  • 全程低温、快速操作,减少氧化时间。

(三)去除多糖

  • 采用高盐缓冲液(1.0–2.5 mol/L NaCl),促进多糖与核酸分离。
  • 异丙醇/乙醇分步沉淀;离心后弃去黏稠胶状沉淀,取上清。
  • 选用多糖多酚专用植物试剂盒,配合选择性结合柱。

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货号

名称

备注

19292ES

MolPure® Plant Plus RNA Kit 多糖多酚植物RNA提取试剂盒

柱提法,操作简便,30 min即可完成总RNA的提取

18801ES

MolPure® Plant Plus DNA Kit 多糖多酚植物DNA提取试剂盒

柱提法,操作过程1 h完成。

18529ES

MolPure® Mag Plant DNA Kit磁珠法通用植物DNA提取试剂盒

磁珠法,操作过程1 h完成。

18534ES

MolPure® Mag Plant RNA Kit磁珠法通用植物RNA提取试剂盒

磁珠法,操作过程40min完成。

10604ES

RNAsafe Tissue Stabilizer RNAsafe动植物组织RNA稳定液

用于采集样本后保存样本,可以灭活内源RNA酶。

10609ES

Surface RNase Remover (with Spray Bottle) 固相RNase清除剂(含喷雾瓶)

适用于喷洒在台面等固体上,达到清除RNA酶的效果。

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